SEARCH OPTIONS

lncRNA id
CNCI status
Max. peptide length
Is conserved?
Organ-specific expression:
Max. expression
No. of exons
Order results by

Current search details:

Found 6583 records

CNCI status:   #
Max. peptide length:   #
Is conserved:   #
Organ specific:   #
Max. expression:   #
No. of exons:   #
Order by:   lncRNA ID


Record details CANTATAdb ID Species Location CNCI status (score) Swiss-Prot best hit Max. peptide length Max. expression No. of exons Notes
CNT30516792 Juglans regia 11:10298962-10299872 (-) noncoding (-0.0647168)1e-35 (sp|P18616|NRPB1_ARATH) 75 78.23 2Conserved counterparts:
CNT30516791 Juglans regia 11:10069066-10069417 (-) noncoding (-0.0294912)- 68 19 2
CNT30516789 Juglans regia 11:26715729-26716699 (-) noncoding (-0.114688)- 91 61.96 2
CNT30516787 Juglans regia 11:1132141-1132791 (-) noncoding (-0.155648)- 56 14.4 2
CNT30516785 Juglans regia 11:30434467-30436720 (-) coding (0.162)- 67 1.16 2
CNT30516784 Juglans regia 11:24289744-24290323 (+) noncoding (-0.065536)- 78 2.99 2
CNT30516783 Juglans regia 11:28347189-28349042 (+) coding (0.146)5e-56 (sp|Q9FHW7|SKP1B_ARATH) 74 24.71 2
CNT30516782 Juglans regia 11:25413627-25415268 (-) noncoding (-0.0094208)- 49 7.49 2
CNT30516781 Juglans regia 11:21266877-21268344 (+) noncoding (-0.393216)4e-30 (sp|F4HZB5|NET1D_ARATH) 83 9.9 3
CNT30516778 Juglans regia 11:1126954-1128108 (-) noncoding (-0.036864)- 57 203.28 2
CNT30516777 Juglans regia 11:31423993-31424763 (-) noncoding (-0.0606208)6e-25 (sp|Q96289|ZAT10_ARATH) 44 5.06 2
CNT30516776 Juglans regia 11:36717363-36720960 (+) noncoding (-0.126976)- 78 11.06 3
CNT30516775 Juglans regia 11:15332887-15333619 (+) noncoding (-0.0004096)- 37 53.02 1
CNT30516774 Juglans regia 11:8733222-8734011 (-) noncoding (-0.136806)- 87 13.3 2
CNT30516773 Juglans regia 11:25918566-25918778 (+) noncoding (-0.0004096)- 53 8.86 1
CNT30516772 Juglans regia 11:24213576-24216870 (+) noncoding (-0.004096)- 82 4.77 4
CNT30516771 Juglans regia 11:34894369-34896798 (-) noncoding (-0.0446464)- 71 1.49 3
CNT30516770 Juglans regia 11:10838803-10839475 (-) noncoding (-0.0249856)- 71 2.16 2
CNT30516769 Juglans regia 11:33535474-33544536 (-) noncoding (-0.0004096)- 42 8.49 2Conserved counterparts:
CNT30516768 Juglans regia 11:36603277-36605661 (+) noncoding (-0.016384)3e-53 (sp|Q9SK39|SBP3_ARATH) 57 704.42 2
CNT30516767 Juglans regia 11:32941568-32943043 (-) noncoding (-0.0249856)- 38 3.68 3
CNT30516766 Juglans regia 11:34699778-34700834 (+) noncoding (-0.22528)- 33 1.42 2
CNT30516765 Juglans regia 11:26412879-26415051 (-) noncoding (-0.0004096)- 59 11.99 2Conserved counterparts:
CNT30516764 Juglans regia 11:25213750-25214355 (+) noncoding (-0.0086016)- 85 0.55 2
CNT30516763 Juglans regia 11:10038476-10041821 (+) noncoding (-0.147456)- 57 6.91 7
CNT30516762 Juglans regia 11:8616139-8616862 (+) noncoding (-0.028672)- 35 4.08 1
CNT30516761 Juglans regia 11:12282892-12288555 (-) noncoding (-0.126976)- 43 5.22 2
CNT30516759 Juglans regia 11:34117825-34121477 (-) noncoding (-0.0004096)- 68 1.86 2
CNT30516758 Juglans regia 11:27271473-27272768 (-) noncoding (-0.012288)0.000000000003 (sp|F4JMB8|HIP44_ARATH) 92 2.81 3
CNT30516757 Juglans regia 11:17783691-17784352 (+) noncoding (-0.065536)- 57 0.28 2Conserved counterparts:
CNT30516755 Juglans regia 11:24364782-24368004 (-) noncoding (-0.0004096)- 74 16.76 2
CNT30516752 Juglans regia 11:21226406-21227308 (+) noncoding (-0.0077824)- 92 11.58 1
CNT30516751 Juglans regia 11:14145847-14146384 (-) noncoding (-0.0004096)- 56 83.1 1
CNT30516750 Juglans regia 11:28566649-28567954 (+) noncoding (-0.0221184)9e-27 (sp|Q9FYB5|DNJ11_ARATH) 58 819.68 1
CNT30516748 Juglans regia 11:27188393-27191244 (-) noncoding (-0.0036864)- 96 3.39 2
CNT30516747 Juglans regia 11:35155927-35158277 (+) noncoding (-0.0004096)0.000000005 (sp|P10978|POLX_TOBAC) 85 20.87 2
CNT30516745 Juglans regia 11:25161954-25163015 (+) noncoding (-0.024576)- - 2.82 2
CNT30516744 Juglans regia 11:7442671-7443482 (-) noncoding (-0.045056)- 62 22.11 3
CNT30516743 Juglans regia 11:10838805-10839532 (-) coding (0.192)- 83 52.14 2
CNT30516742 Juglans regia 11:31270465-31273838 (+) coding (0.11)- 78 22.59 4Conserved counterparts:
CNT30516741 Juglans regia 11:35155927-35158277 (+) coding (0.027)- - 3.98 2
CNT30516739 Juglans regia 11:15093368-15098965 (+) coding (0.138)- 65 4.42 4
CNT30516738 Juglans regia 11:33189130-33192633 (-) noncoding (-0.032768)- 74 9.76 2
CNT30516737 Juglans regia 11:32053462-32056844 (+) noncoding (-0.049152)- 56 0 1Conserved counterparts:
CNT30516736 Juglans regia 11:12660298-12665093 (-) noncoding (-0.004096)0 (sp|F4K2E9|PRP16_ARATH) 70 0.62 2
CNT30516735 Juglans regia 11:28639233-28639765 (-) noncoding (-0.0004096)- 77 20.58 1
CNT30516734 Juglans regia 11:27068125-27068341 (-) noncoding (-0.0004096)- - 71.29 1
CNT30516733 Juglans regia 11:35841489-35843121 (+) noncoding (-0.0360448)- 85 1.61 3
CNT30516732 Juglans regia 11:26411099-26415099 (-) noncoding (-0.110592)- 84 23.93 2Conserved counterparts:
CNT30516731 Juglans regia 11:6079225-6082632 (-) noncoding (-0.126976)- 79 11.59 3