Detailed information on CNT30105143


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002233, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30692566Oryza longistaminataOryza sativa10.3496.6788.53436forward
CNT30553432Oryza longistaminataOryza glaberrima5.1244.7289.81216forward
CNT30596270Oryza longistaminataOryza meridionalis7.5257.2288.96317forward
CNT30101408Oryza longistaminataOryza rufipogon5.0344.7392.45212forward
CNT30576216Oryza longistaminataOryza barthii5.3449.6790.22225forward
CNT30116422Oryza longistaminataOryza nivara5.3447.5790.67225forward
CNT30604033Oryza longistaminataOryza punctata13.5264.2689.82570reverse complement

Expression of CNT30105143

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (32 aa)
MASFLEDRVYKLLHLSFEWLLFLGSIRHAKPKA

>peptide 2 (32 aa)
MLCLCSSSKQYDARHIHHKCDTTIIVSVQRNE*

>peptide 3 (33 aa)
MVVLLCAFRKFRKIIGSFENISEIPKNYRKLRN*

>peptide 4 (63 aa)
MYLIQVIHFHLIGIFIVYHIFEYMILVVLINTHHLFIFFYRRDWLVNMWRLTTGSLGLIILLS*

>peptide 5 (62 aa)
GGGGRQASEAACSGFFLSALLLLLLQTLLVIWSSSQLIYHLYLIIHCFLEVLTYDCVILKMV*

>peptide 6 (29 aa)
MDHAAVKGMQGAWRRRTKSGGERRVTALS*

>peptide 7 (33 aa)
MNGLKRLRQLLKNYMDLITWSKQLNIRKTFYLR*

>peptide 8 (51 aa)
MFHLYLCILFFIQIFRMYTFRGSKSYALVMHVFDPSYSLSFNWDLYSLSYI*

>peptide 9 (45 aa)
MDSRAKSYGSFTMCFSEIPKNYRKFRKYFGNSEKLSEVTKLRLVL*

>peptide 10 (59 aa)
MLRKNLTLVVPDEDSLQPCFNLRKNSVYINICVVEYMHEIYCGDAFPVLIQIQVLREGL*

>peptide 11 (61 aa)
MVSGKDGFSGAGLEGRSQESRMRASGSHRWEGQKWVMFGVYPRSGEEALSSTADVSCSQVT*

>peptide 12 (54 aa)
MRLPRLEGRREEPLRLRGDATSVGVDTAAQDRSFDGIGERRIQRRRARGSEPRE*

>peptide 13 (58 aa)
MGINMYTRGLCNISSRSIQFGASPPFTFSSFSTSLFLSWRLASAGLGLQHSDRVSVSV*

>peptide 14 (34 aa)
MGRKFLMDRAANPYVGSFGPNITHVMPVFIQQAI*

>peptide 15 (37 aa)
VAAAGDKLVRRRVVVSFYLLSSCSSCKHYWLSGLLLN*

>peptide 16 (47 aa)
MKGRWKEGIHIGIILLLFKFEYRNVVLSRGMQCRCVCVCLGAQSDLS*

>peptide 17 (38 aa)
MGVVKSPATVFSMESDQLKGIYPEESEFRKNAAWQVIY*

>peptide 18 (66 aa)
MLLLYYIIISRLHLYHLYWTHSRLLKPYRYRLASTIRWYWHRLESLHRPIGCFICCLHILSVAGSN*

Sequence

>CNT30105143
GTGGCGGCGGCGGGCGACAAGCTAGTGAGGCGGCGTGTAGTGGTTTCTTTCTATCTGCTCTCCTCTTGCTCCTCTTGCAAACACTACTGGTTATCTGGTC
TTCTTCTCAATTGATCTATCACCTATATCTCATCATCCATTGCTTCTTGGAGGTCCTTACATATGATTGTGTGATTCTCAAAATGGTGTAGTTATTTGCT
TTGGGATAACTCCAATTAGCAATTTAAACCCGAATCAACAGAAAGCCATGTGCAGATCAGGTTGATAACATGTTTCAAGTAGTAATTATTAAATCATGCT
AAGGATGCTTTTTTTAAAATTTTTTTTTTGTTAATATGCTAAGGAAAAATCTGACCCTTGTAGTTCCTGATGAGGATAGTTTGCAACCATGTTTTAATCT
AAGGAAAAATTCTGTGTATATCAATATATGTGTTGTTGAGTACATGCATGAGATATATTGTGGTGATGCTTTCCCGGTACTAATCCAAATACAAGTTTTA
CGAGAGGGATTGTGAGAAGCAAGAGGATTCATTCCCCCACATGGTTTTGAGTCCCTAGATAGGTTTTCCTTGGGGATTAAAACCCAAAGAACCAAACAAG
GTTATCACACTAATCACGCAACAGGTCGTTGTTAACAGTGAAATTTGGTAATCCCTGGAGTAATCATCGGCTTAGAGTCAGTATCGGCTTCAGAGTCCTG
GAATCGGCCGATGGGAGTCGTCAAGTCGCCAGCAACCGTGTTCTCAATGGAGTCGGATCAATTAAAGGGAATTTATCCAGAAGAGTCCGAGTTCAGGAAG
AATGCGGCATGGCAAGTTATCTATTAATTAGGAATAGTTTGTTAGTTTCCTTTTATCTTTAGGAAAGTGTGTTTAGTGTCCGATAAGGACTTTATCTTTT
CCTTTATTCTTTAGTTTCTTTCTTGTCCTACAAGGACTAGTATCTACCCATGGGTATAAATATGTACACCCGGGGTCTATGTAATATATCTTCACGATCA
ATACAATTCGGCGCATCGCCACCTTTTACCTTTTCTTCTTTTTCGACGAGTTTATTCTTGTCATGGCGGCTTGCATCGGCGGGGCTAGGGCTTCAACACT
CTGATCGCGTCAGTGTAAGCGTTTAATCTATCATATATCTTAGTTAATCTAGTCTTAGTATCTCGATTTACTTGTATCGGCTGCTATTCGCTTTAGAGTT
AATGCCGGTACCGGCTAAATCGCTTTACTAGATTAGATTAGCTAAGGTATCCACCACTCTGAAAATCAGTCAACGGCTTGATTGTCTAGATATTGTGTTT
CTTTTCATACTTAGTGCTGCATCAGTTAAGTTTGATCTACTAAGTCGTGCTTAGAACCATAATCTCTAGCCTGCTTCTTTATTGCCAATAAGGGTTTCAT
CGGGGGTTCAACCGGTGAGTTATCTGGACGTTGCATCGGCTCATAAGGATTGCATATACATATAAGTTGGATTTAGCCGATGACAACAAAGGTTTCACTG
TTTAATCTAATCTTGTGGATTTCATGACATCAGACCTCTAGCCAATGTGTGCTTTAACATTCGGATCAATGCTTATTCTATCATATCATTGCTAGCCGAT
TGGTTTATATTGGATTATGTTATTGTTATATTATATTATTATCAGCCGATTGCATTTATATCATCTATATTGGACACATAGCCGATTGCTTAAACCCTAT
CGCTATCGGCTGGCATCGACTATCCGCTGGTATTGGCATCGGCTGGAATCTCTACATCGGCCGATCGGCTGTTTTATCTGCTGTTTGCATATCTTGTCAG
TTGCAGGATCAAACTGACTGGCACGCCCGCATCTCATCAAGATTTGGACCTGCACAGGAGCTAAGCAGATCTCCCAGGCCAGTGTGTTCGATTTTTTTCG
TCAACAGTCGTCAAATATATGGAGCCGGCATACAATTGGGCGCGAGGTTTCACTTGACCTTTCGAAAATTTTGCAAAGCAAACTGCCGTTCAAGTCCTAA
AATGTATGAATGGATTGAAGCGCCTCAGACAACTACTTAAAAACTACATGGATTTGATTACTTGGAGCAAACAACTAAACATTCGAAAAACATTTTATCT
ACGTTAGGAGATATTTGGTCTTCCGTGCCAATTGAAGAAATTGGCTTGGATGGGATGCGCCTCCCTCGATTGGAGGGGAGGAGAGAAGAGCCCCTTCGCC
TTCGAGGTGACGCGACGTCGGTGGGAGTAGACACGGCCGCACAAGACCGCTCGTTCGATGGTATCGGGGAAAGACGGATTCAGCGGCGCCGGGCTCGAGG
GTCGGAGCCAAGAGAGTAGGATGAGAGCATCGGGGAGCCATAGGTGGGAGGGGCAAAAGTGGGTGATGTTTGGTGTTTACCCGCGAAGCGGTGAGGAAGC
CTTGAGCTCCACCGCCGACGTCAGTTGCTCACAGGTGACTTGACTAGGAAGTGAGGTGACAGGCTGGTGGATTCGCTTTTGTAATTTTGGATATTGCTGT
CTCTTTCTTCGTCTCCGCTCGTGTGTGCGGCTAGCGATCTCGTCGTTACACCGATATGTGGGCCAGAATGCTTGAGAGGCCGAGAGCGAGATGCCGCCTA
GGCCCAACACCCCCGTGCGGCTGAGACGACGTCTCGTTGGTGGATGGGCCGTAAGTTTTTGATGGACCGGGCCGCTAACCCGTACGTAGGCTCGTTTGGC
CCAAATATCACGCATGTTATGCCTGTGTTCATCCAGCAAGCAATATGATGCACGACACATCCATCACAAATGTGACACAACTATCATCGTGTCAGTGCAA
CGAAACGAATAACAATGTATGATGTAAATTTTGAGCTGGGGATGGTTAACGTTATGCTCGTGATAGCTTGATATCTTCCACGTTTTGAGATCTTTACCAT
TTGAAGAAATAATTTGCTCAAAATTTGTTTTATAAACTGATATGCAATATCTTTCTTTGGCAGATGGATCCTATATAAAGCATTGACTGGGGCACTTTCT
AGGATGGCAGTTATGTAGGATAAGCTCCCAATGTTTCATCTCTATTTATGCATACTCTTCTTCATACAAATATTCCGTATGTATACATTTAGGGGGAGCA
AATCCTATGCCTTAGTTATGCATGTATTTGATCCAAGTTATTCACTTTCATTTAATTGGGATCTTTATAGTTTATCATATATTTGAGTATATGATACTTG
TGGTGTTGATTAATACTCATCACTTATTCATCTTCTTTTATAGACGTGATTGGTTGGTCAACATGTGGAGGTTGACAACTGGATCATTGGGACTAATAAT
TTTATTGAGTTGAATGAGAGAAATAGGTCTCAAGGATTACAAAGGTGTCAAGCTCAAGTGATATCATTACACCTAAAAATACCAAGAATAACAAAGGGGA
GATATTGAAGATGTGGGATAAGAAGTGGCTACTATGGTGAGACGGTGAAGGGCAAGCGATGCTCGGTCGTGATGGACCATGCGGCGGTGAAGGGCATGCA
AGGGGCTTGGCGCCGAAGAACCAAATCCGGTGGTGAAAGGCGAGTGACGGCTTTGTCATGATGGACGTGCGAGACCATTTGAAGCTACAAGTAACCGCAT
CAATCATTTGAAGAATATATGGTGAAACGGTTTTGGCATTGGCGTCCCTTAAGACAATGAAAGGAAGATGGAAAGAAGGCATTCATATTGGTATAATTCT
CTTACTATTTAAATTTGAGTATAGGAATGTCGTACTATCAAGAGGGATGCAATGTCGATGTGTTTGTGTATGTCTCGGTGCTCAAAGTGACCTATCATAG
AGCTACCTTGTAGAGAAACCTAAACTTTAACCTATCCTTTGAGTGATTTTAGACCTTGTTTTTGGTTGAGTTGGGTAGTCCTCTGAGTGAGCTTTCCATA
GAGTCCAAGATCATCAAAAATGGACTCCCGAGCAAAAAGTTATGGTAGTTTTACTATGTGCTTTTCGGAAATTCCGAAAAATTATCGGAAGTTTCGAAAA
TATTTCGGAAATTCCGAAAAATTATCGGAAGTTACGAAACTGAGATTGGTTCTGTAAATTTTCGGAAGTTCCAAAAATGCATTTCGGAAGTTCTGAAAAT
TTTAGTCTTTGCCTCCAATGGCTAGTTTTTTAGAGGATCGGGTATATAAACTCCTCCACCTCTCCTTTGAGTGGTTGTTGTTCTTGGGGAGTATTAGACA
TGCAAAACCAAAGGCCG