Detailed information on CNT30691216


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT004724, E-value = 2e-46

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30523910Oryza sativaSetaria italica3.5634.1590.99111forward
CNT30554388Oryza sativaOryza glaberrima9.0479.2185.46282forward
CNT30371309Oryza sativaOryza glumipatula8.0826.8486.11252forward
CNT30108554Oryza sativaOryza longistaminata10.5821.9685.76330forward

Expression of CNT30691216

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (62 aa)
MALGLCSFIFQIIENELSAPYFKRYFFLKKHFFLLYCLDHFVLNYLLSLFLYINYFYNEGHV*

>peptide 2 (66 aa)
MICCCSSPLISFTNTTGPAAQLYMQPPHSTVAHIRARTPAGDRAYICMHLILYNDSRTYQYHPFHY*

>peptide 3 (43 aa)
MHALDSLQRLAYVPVPSFSLLNFAQQSAPVLVTSQDLFPAAHG*

>peptide 4 (56 aa)
MRHGVPTSFGKELGDGNDECMIPRNSWRRLKLGKAAGFMRKSPPHSPGPLRWAPKAS

>peptide 5 (30 aa)
MKIASYGVLEPSMCSGKIEWWANTCTKTVS*

>peptide 6 (39 aa)
MNEALFSSQNKNFSPITSKIFGHMHGVLNVEKINYTVCV*

Sequence

>CNT30691216
TTGAGCTAAACTTCACCTGTGATCAACGATTTATTGGTCCCAGTTTATATAATTTGCCACACCTTTAACAAATTAGCTATAAAACTACTTAAAACACAAT
TTAAAATGCCATAATCCGGTAAATACTTTGTTTCAAATGGCCCTAGGCCTTTGTTCTTTTATTTTTCAGATTATTGAAAATGAATTATCTGCCCCATACT
TTAAAAGATATTTTTTTCTTAAAAAACACTTTTTCCTACTATATTGTTTAGACCATTTTGTTTTAAATTATCTGTTAAGTTTATTTTTATATATTAATTA
TTTTTATAATGAAGGCCATGTTTAGTTCGTGTGCCAAAATTTTTTTGAAGTACACGGATACACATTTAAAGTATTAACTATAGACTAATAACAAAACAAA
TTACAGATTCCACCTGTAAACTGCGAGACGAATTTATTAAGCCTAATTAATCCATCATTAGTAAATATTTACTGCAGCATCACATTGTCAAATCATGACG
TAATTAGGCTCAAAAGATTCGTCTCGCAATTTACCTGCAAACTGTGTAATTGGTTTTTTCATCCATATTTAATGCTTCATGTATGTGTCTAAATATTTAA
TGGGACGGAAAAATTGAAAGTTTAAAGGAACTAAACACTGTCTAAATAGATAATCCTCTAAATCTAACATGACCCTAACTTATTTATATGAAAATCGCTA
GCTATGGAGTATTAGAGCCGAGCATGTGCAGTGGCAAAATTGAATGGTGGGCAAACACATGTACTAAGACTGTCAGCTAGTCAGTTATTGCATGGCAACC
CCAAGTCAACTGTTGCGAATCTTGAACCATCTGCAAGGATTTAAAACGGCCACCTACCCATAACCAAAGCAGCTCGTGATGATTTGTTGCTGTTCTTCAC
CATTGATATCCTTTACAAACACAACTGGCCCAGCAGCTCAGCTATATATGCAGCCTCCACATTCCACAGTTGCACACATCCGAGCGAGGACACCGGCTGG
CGATCGAGCATATATATGCATGCACTTGATTCTTTACAACGACTCGCGTACGTACCAGTACCATCCTTTTCATTACTGAATTTTGCTCAACAATCGGCGC
CCGTTTTGGTTACGTCTCAGGATCTGTTTCCAGCTGCACATGGGTAAACTGCTTCAATCTGCGGCGCCACATTATTGAAGCCATTGGTGAATTGGTGAGG
TGAAATGCGCGAAATTTCACGAGCGGCCGGTCGATCTCTTGGTGAGGTGAAAGCGGTGAAAATCTGAAATCTCGCGTCAGATTTGTTCACTGGAGCTGGT
GGTGGTGACAACCTACTGCAAACGTCTGAACCTGCAATTTAACGTTTATGACGGCCCTGCCTGAGTGGCTGACACGACGATGAAAAATGAATTTAATCAT
GCATGCATGGCTTGCATGTACGTACGTACTACGTACGTAGCAAATCTGTATTAACATGCATGCATTGATGGAAGCCAATAAAGGATCGATCGATAAGAAA
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TTTTGTATCAAAATTCATGTTCATGTATATCAAGCTTACATATATACTTTGTTAGATAGCATTTATATCCAGTTAGCATATATTTATACTCAGTTACAGT
GCACCAAAATTAGATTTTACACTATTTTTTCTAGATTTATGATTATTTATTTTTGTTATTTCATTTAAAATGGGATATATCATTGGTTAAAATTTTTGCA
AGATAGTCCCTTGAAAAAATTCTGCAAGATTTAAAGTTATAAATCCATTAAAAGATCAATAGATATCCCTTTAATTATATTGTTGAGCTGATGGTTATCG
TGAATTATCTATTTATTGCATGGTAAATTAAATATTATGAAAAGTAACTTACCAAAGAACTTAAAATAACTTAAAATAAGTGGTCTAAATAATACTACAG
TAGAAGATTTTTTTTTGAGAAAACATTTTTTTTTCAAATCGTGAAGCAAGTAATCAGTTTTAATAATTTTATGAATGAGGCCTTGTTTAGTTCCCAAAAC
AAAAACTTTTCACCCATCACATCGAAGATATTTGGACACATGCATGGAGTATTAAATGTGGAAAAAATCAATTACACAGTTTGCGTGTAAATTGCGAGAC
GAATATTTTAAGTATAATTGCGCCATGATTTGGTAATGTGGTGCTACAGTGAATATTTGCCAATGACGGATTAATTAGGCTTAATAAATTCATCTCACTG
TTTCCTAGCGGAATCTGTGGTTTGTTTTGTTATTAGACTACGTTTAATACTTCAAATGTGTGTCCGTATATCCGATGTGATAACCAAACCCAAAATTTTT
CCCCAAGTGGTGGTGTTTGGATGTAGGGACTAAACTTTAGTCTTTGTCACATAGGGTGTTTGACACTAATTTAGAGTATTAAACATAGACTAATAATAAA
AATAATTGCATAAATGAGAGCTAATTTACGAGATGAATTTTTTAAGTCTAGTTAATCCATAATTAGCAAATGTTTACTGTAGCATCACATGGACTAATCA
TGTATTAATTAGGCTCAATAGATTCGTCTTGCGAATTAGTCCAAGGTTTATAGAATATGTTTTATAATTAATCTATGTTTAATACTCTAAATTAGTGTTC
AAACATCTCATGTGATAGAGACTTAAAAAAAATTTAGTCCCTGAGCTGAAAAGAACGGAGCCGAAGTATTGGACTGGACCCGAGATCTCCTCTCTGCTAC
ATGCTTCCATTCAAATCAATCGTCGGTCTTTTACTCCCCCACAGACATGAGACACGGCGTGCCAACTTCTTTTGGTAAAGAGTTGGGGGATGGAAATGAC
GAGTGTATGATCCCTAGAAATTCTTGGCGAAGACTAAAGTTGGGAAAAGCGGCTGGCTTCATGAGGAAGTCACCACCACACTCCCCCGGCCCGCTGCGAT
GGGCCCCGAAAGCCTCTT