« Back to Vigna unguiculata search


Detailed information on CNT30628398


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30519668Vigna unguiculataSetaria italica3.9121.5186.4974forward
CNT30532997Vigna unguiculataEucalyptus grandis5.2322.9783.8499forward
CNT30162463Vigna unguiculataPistacia vera8.1960.0883.23155forward
CNT30358787Vigna unguiculataLactuca sativa8.5143.2883.23161forward
CNT30573621Vigna unguiculataVitis vinifera6.9727.4483.33132forward
CNT30725977Vigna unguiculataLupinus angustifolius16.3255.0880.91309forward

Expression of CNT30628398

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (48 aa)
MIRGVAVSPTPLLKDAMLINYIFFFSISNSHPNPFITVFTSKSYFQKM*

>peptide 2 (49 aa)
MAALVAVCGSVWLDSVPFPNIPEFKNLKRNKRIIIRNSCFKLIKKLIHV*

>peptide 3 (41 aa)
MCTERGGSRVELVSYLMSSFCSAPPCLVRRCEVAPKPVVTP*

>peptide 4 (46 aa)
MIYIILVFYCKPTLSYPILLILKNKNIFKPTLLQIILNKENMTIQS*

>peptide 5 (34 aa)
MLFITHSLLALTPSRADSDSSTLTPWSCADTAAT*

>peptide 6 (67 aa)
MVSVSPPRRTSGCRYSATMRLTSSRWLPFSASAAVPQFRGSLLLVEVMQKEPFWWPLVRVVASILKQ*

Sequence

>CNT30628398
GCATTAAGTACTTCTCCTGAAGGTCCAACAGCTTTGGAGTTGGGTCTGCCAGTTAGCAAACCAGCAATATAGGAAAGTGGAACAAGATCTCCAGAAGCTG
TGATTGTACCACGAAGTGGCAAGCATGGGGTAACGTTGTTGTTAAGGAGCTTGGTGATGGCTTCCAAGATTTCAAATCTGATCCCTGAGTAGCCTTGAAG
AAGAGTGTTGATCCTCACTAGCATGGCTGCTCTAGTTGCTGTGTGTGGCAGTGTGTGGCTTGATTCAGTCCCATTTCCAAATATTCCAGAGTTTAAAAAC
CTGAAAAGGAATAAAAGAATCATAATTAGGAATTCCTGTTTTAAATTAATTAAAAAATTGATCCATGTTTAAGAAAGCGCGTAGTTACATACAATTAATA
CAAAAACATTTAAGATAAGACTCAGATAATTCAGGTAAGTGAGAAATCATAACTAAAAGAGATAATGTAAAGACTTATTCTTTGAAATAAAAAATATTTT
CACTTTAGCGTAAAACCTTTTCACTTTGATATCGTTGATATAAAAGTTGAATCTTTTTAGCCGTGAAAGTATAAGTGGCAGTTTGATAGCAATTTTCCGA
TCTGGGTACAGTTTGGTGAGAGCCGTCCAATATAAAATAAAATAAAACAAAATTAGAAAATGACATCAATGGGAAGAACTTGAGTCAAACATGGGTAGTA
GTAGTTGCGATGATACGAGGGGTTGCAGTCTCACCAACCCCCCTACTTAAAGATGCCATGCTAATAAATTACATTTTTTTTTTCTCCATCTCAAACTCCC
ACCCAAACCCTTTCATCACTGTTTTCACATCGAAGTCATATTTCCAAAAAATGTGATTATTTTTCGGGACGGTTAATTTGGTCCACTCCACCCCTTTTAT
ACACTTAATCTTTTAATATTATTTCTGTCTATTAATAATAATTTAAAAAAATAATTGTAATAAATCATAAAAGCCACAATTCCTTCTAAGAAAACATGTT
TCTTCATCATAGAATGATATACATAAAAGCAATAATAGAATGATATATATAATTTTAGTGTTCTACTGTAAGCCAACACTAAGTTATCCGATTTTACTTA
TTTTAAAAAATAAAAATATCTTTAAACCAACTTTATTACAAATAATTTTAAATAAAGAAAATATGACAATTCAATCATAAACTAAAAATTCAATATCAAG
AAATACGCAAGTAAAGTTATATATCTAAAACTTTACTTTTAAGTTGTAGTAATTTATGAAACGGTTACATTATTTATAGGTAACCCGATGAGTACCGTAC
CCAGAAAATACATTCGACTACGAAACGTATATATACGTAGAGTGTATGTGTACCGAGAGAGGGGGGAGTAGAGTAGAGTTAGTTAGTTACCTGATGAGTT
CTTTCTGCAGTGCACCGCCTTGTTTGGTTCGGCGGTGTGAGGTGGCACCGAAGCCGGTGGTGACACCGTAACTGTCAGTGCCATTGTTCATGCTGTTCAT
CACCCACTCACTGCTCGCCTTAACACCTTCCCGAGCGGACTCCGACAGCTCCACCCTCACGCCTTGGTCGTGTGCAGACACCGCCGCCACCTGAGCGATG
GTGAGCGTCTCGCCACCGAGGCGGACCAGCGGCTGCCGGTATTCTGCCACCATGCGCTTGACCTCATCGAGGTGGCTCCCCTTCAGCGCCTCCGCGGCCG
TTCCCCAATTCAGAGGATCACTGCTCTTGGTGGAAGTCATGCAGAAGGAACCGTTTTGGTGGCCATTGGTAAGGGTGGTTGCTTCCATCTTAAAACAGTG
AAGAGAATGAAAAAATGGAGTTTTGTATAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGGAAATGTGTGTGTTTGTGTGTTTATGAGTTTGAGGATTCCCTGAG