Detailed information on CNT30554139


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30370554Oryza glaberrimaOryza glumipatula12.8755.5396.02678forward
CNT30102331Oryza glaberrimaOryza rufipogon29.4732.4191.891553forward
CNT30576747Oryza glaberrimaOryza barthii45.5238.5899.792399forward
CNT30116141Oryza glaberrimaOryza nivara29.4953.3592.211554forward

Expression of CNT30554139

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (37 aa)
MGDISKLLAAASYLFTFGKQTVELCCRLEISLVLALR*

>peptide 2 (38 aa)
MGFLLGCKYVTGLGQPTHTPSFSCFALISGFVHKDAGR*

>peptide 3 (39 aa)
MNFFTGLNFLLVLASGLLRVKFLNTIIRIKISSNFALRL*

>peptide 4 (42 aa)
MADVLLTVFALTVYMADWWDFCWDATGLGLPTQIPILCLLYH*

>peptide 5 (43 aa)
MLQCMLIVRQRLKRMIMRAILNHLFVLVCECDNNINGNYILRQ*

>peptide 6 (44 aa)
MLKVMQYLFIAHSCAVFFFPFFQSGCFRDRLFSICFRLGFLVFS*

>peptide 7 (47 aa)
MYHLNHFSLDVYLLCLNISSINGASLYRACAVECLRPSYSLFNILPS*

>peptide 8 (35 aa)
MKLSYLVPICCIRVTLFSHVWWTAGVHIIHTCKLC*

>peptide 9 (36 aa)
MLSVDCEVLTSLYCVVCEGYGLHCFVPCGIKHTLDK*

>peptide 10 (56 aa)
MFWDCLLIAVRSLQKLHGVVFILLICQFACLGEHSGAFFMTDDPFPIFSFAIYWLA*

>peptide 11 (56 aa)
MFYSLFLHSLFTWLIGGIFVGMQLGLVYQPRYQSFACFTTNIEYCSERLCVSWVSA*

>peptide 12 (65 aa)
SELTPFEAQQAEATRLTHPHRSPLILSRIFPLGKIPKSIRLSLSSPLLAGGRRGAARRIRRRFPS*

>peptide 13 (97 aa)
MAGAWWSTMPLRAQKYRTRGYEDLCWALVGCLPGLVGLLPNTPFFFLISLPYSPLITPQPSHMAKQRLMPQRYGAKAVVGRLNNTGFIYVNWVVLAL*

>peptide 14 (50 aa)
MATISFVNSWMNFFFVLKSKYSSCDSTFYRFGLYQFVVLCLVLSCFGTVC*

>peptide 15 (51 aa)
MLGFGGLPAWLSWPFTKYPFLLPNFSTIFSTNHASTISYGKATPYASALWC*

>peptide 16 (58 aa)
MGVWDSSALVRPLGLKGPGLLQYYPSIQKVLTTNLDICVSGFIFFIDRLVRLIGLIVV*

>peptide 17 (32 aa)
MVQGIIHLHQNGICSYASSYMIPSIQVCAVNS*

>peptide 18 (30 aa)
MNSKAPPPPPKKKNEREKEKECPILLAVFL*

>peptide 19 (41 aa)
MAMKMYLFLSIVNFSVSLPEISLSIVLSVVVVPSKFCAIGA*

Sequence

>CNT30554139
AGTGAACTTACTCCTTTCGAGGCCCAACAGGCCGAGGCTACAAGGCTAACCCACCCACACCGAAGCCCATTAATCCTTTCCCGAATCTTCCCTCTCGGAA
AAATCCCCAAATCGATCCGCCTCTCTCTCTCCTCCCCCCTTCTCGCCGGCGGCCGGCGCGGCGCGGCGAGGCGGATTCGGCGGCGATTTCCTTCCTAGGG
TTTGGTCTTCCTCCTCCCCTCCGGCCTCCTCTCGCACCGACGGCATCGCCCCCTCCCTTCTAGATCCCGCCTCGCCATCGAAAACCCTAGACGGCCTCAA
GCCGCCATGACCATCCCCCTTCCCACCACCCGCCACCGATGGCGGCATCGATGATAACAACCTGCGATTACCTTCATGTCGGGCGGTTCGTTCGTCTCCC
ACTCCGCGGCTGACGCCCGCCGACAACAGCCGGGCGGCGACGCCTCGAGCAGGTAATCCGCGGGGTTGGGGTACCTAGGGTTAGGGTTTGTTCCGTGAAC
GGGGGGGTGTCCGTTGTACGGTACCGACTCAACCACTGGCTCTAGCATCCATTAGACCATGACGATGACGGCGATATCTCCCATCAGTTGCATGGTCCCC
TTGCACAAACGCCCAGACCAAGGTGATCTCGGAACCTAATTTACATCAGATATCATTGCCTTGCACTGATTTTAGGGATTAGGGTAAATTAAAGGCCTTA
TAAATGTATGTTCCCGTGAAATCTAATCGGACCTGTTGTTTCCCATTCATGCCGTTGATTGTAGGGCTTGCTTGTTTAGGTTAGGTGATAAAAATTAGAA
AATGCTTAAAGTAATGCAGTATTTATTTATTGCACATAGTTGTGCTGTATTTTTTTTTCCTTTTTTCCAATCTGGATGTTTTAGGGATAGATTGTTTTCT
ATTTGTTTTAGGTTGGGTTTCCTTGTATTCTCTTAGATTTGTTGGGTTTCTTATCAACAATGTTGTCTGTTGACTGTGAAGTTCTGACCAGTTTGTACTG
TGTTGTTTGTGAGGGATATGGGCTTCATTGTTTTGTTCCTTGTGGCATTAAACATACTTTAGATAAGTAAATTAGGTTGTATTTGTACAATTGGTAGTAT
CTGCACTTTGGCCTTTTATTTGCTACTCAGTGTTGTCCGCATCATCCGATTTGTTTTGGAATTTATTGGATAAGATTAATGGGGTTTCTGTTAGGATGCA
AGTATGTAACTGGGCTTGGTCAGCCAACCCACACACCATCATTCAGTTGCTTTGCCCTAATATCTGGCTTTGTTCATAAAGATGCCGGACGATAGCTATA
GGCCATGTGCAGAGAGTGAGTAGGTGGGTCATCCATCCCACTTGCATACGTACTTACCTAGTATATGTGTAAGAGTTTCTTGTATGATGTTACTAATAGA
TGGCTATGAAAATGTACCTTTTTTTGTCCATAGTTAACTTTTCAGTGTCCTTACCAGAAATATCTTTGTCCATAGTATTGTCTGTGGTGGTGGTCCCTTC
AAAGTTTTGTGCAATCGGAGCTTAACTATCTTCTTTTACCTCTAGGTTGTGTTTTAGCAGCTGAACAAGTGCTGTAATCCTTTCTATACTTCTTTCTGCC
TTAATGAATAGCAAAGCCCCCCCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAACGAGAGAGAGAAAGAAAAGGAATGTCCTATATTGCTTGCTGTGTTTCTTTAAGTTG
GTTCTGTTTTCCTTCCTTCGAAATGAAATTTGGTTCTTGTGAATCAATGTAACGTCCCTTTACACAGTATTGTTTTCTCCCAGTTGTCTTGTGTTTTTAT
TTGACTTTCATATATGTAAGGGAAGGAAGAAGGCCTTAGAGACAAAACCAGTAGAAAAAAGGAAAAGAAGATAGGGGTAAGCTCATTCTAGAACCCTAGT
TGGCTTGCAGTCACCTTCTTCCTCACCGCAATGGCTGGTGCCTGGTGGAGTACGATGCCTCTTAGGGCACAGAAGTATAGAACACGTGGGTATGAAGACC
TATGTTGGGCTTTGGTGGGCTGCCTGCCTGGCTTAGTTGGCCTTTTACCAAATACCCCTTTCTTCTTCCTAATTTCTCTACCATATTCTCCACTAATCAC
GCCTCAACCATCTCATATGGCAAAGCAACGCCTTATGCCTCAGCGCTATGGTGCTAAGGCAGTGGTGGGTCGCCTTAACAACACTGGTTTCATATATGTA
AATTGGGTTGTACTTGCACTTTGACCTTTTCTTTTGCACCCTGTTGCCTTGCATAATTTGTTGGTACATGGCTGATGTTTTACTCACTGTTTTTGCACTC
ACTGTTTACATGGCTGATTGGTGGGATTTTTGTTGGGATGCAACTGGGCTTGGTCTACCAACCCAGATACCAATCCTTTGCTTGCTTTACCACTAATATT
GAATATTGTTCAGAAAGGCTCTGTGTGAGTTGGGTTTCTGCCTAGGAGCTAGGTTACCAGTTAATACTTGTGCAGCAGGCGGGAGGATGCCACCTAGCGC
CTATCATTGCCCTAGTATGCTTTGTGGAACTTTGTCACTGGTTATATAGGTCCATGTGCAGAAAGTGTGGTAGGTGGGTCAGTCTACTTGCATACCTACT
TTACCTTGTATGTTTGTAAGAGTTTCTTGGATGAATCTTGCTTATCCGTAGTGCAAATAGTCTGCCCCTAAAAAGAAGATTTTTCTGTTGATATTTGTTA
TCCTCCATAATTAACTTCTCAGTGCCCTTATCATAGAATTATCTCCAGGGAATGCCCTATGTTGTTTGCCTCCCTTCATATGAAAATTGGTTGTTGTGAA
TCAATGTAACCCTTTACATCCAGACGTCTTTTTTGTTTGTTTAGCCCATGGTGCTGACTTTTTGTTTTTAGTTTTATGAAGCTGAGTTATCTTGTTCCTA
TTTGTTGTATTAGAGTAACGCTCTTTTCACATGTTTGGTGGACAGCTGGAGTTCATATTATTCATACATGCAAGTTATGTTAATGACACCAAACTGGTTT
AGCTTAGATCCTTGTGTCTCATTGTCTCCTTTGCAAGGCAGAAGTTCTATTTGATTAAAGCAATGCTGCAATGTATGTTGATTGTGAGACAACGACTGAA
AAGGATGATAATGAGAGCAATACTGAATCACCTGTTTGTATTAGTATGTGAATGTGACAATAATATTAATGGCAACTATATCCTTCGTCAATAGCTGGAT
GAACTTTTTTTTTGTTTTAAAAAGCAAATATAGCTCGTGTGATAGTACTTTTTATCGGTTTGGTTTATACCAATTTGTAGTCCTGTGCCTCGTGCTTTCA
TGTTTTGGGACTGTCTGTTGATTGCTGTTAGGAGCCTTCAAAAGCTGCATGGTGTTGTATTTATTTTACTAATTTGCCAATTTGCATGTCTTGGTGAGCA
TTCAGGTGCTTTCTTTATGACTGATGATCCCTTCCCCATCTTTTCTTTTGCTATTTATTGGCTAGCTTAATCCAGAGTCTTATTCTGCTGTAGCTTTTGG
GGATTAAGTTAGTTTTTAGTCGCATATAGTGGAATTGACTGTATTGTTTCAGCAAGCAAGATAAATTTCCACTCTTCCAACCGTATTATTTATCGCAAGC
AAGATAAATTTCCACTCTTCCAACTGTATTATTTATCTTTATGTAGAGCTCGCCCTCTGATTCTCGAGCGATGATCTTCTTCTCTCCTGAACCACCTACC
ATCACTTAACCCAATCCACAACAAATCTGCTTTGTTCTTTTGTACTTACGGCTGGTTACGCTAGTTGTGCAGGTGTGATGTCTGGTATATGACCAGAAGT
TGCTCTGGGTGTTTGTAGTAGGGATTTGAACCGTGCCTTATTGTTTAAATGTCATTTTATTGCTTTCATGGATGGTCCAAGGTATCATTCACCTTCATCA
GAATGGAATTTGCAGTTATGCTAGCTCTTATATGATTCCATCTATACAAGTGTGTGCTGTGAATTCATAGTATTGAGCGTTCAGAACTTGCTGTTCCTGT
ATTTATATGATGTTCCTTTTAAGCTCTTTGTATTTATATGATTTGATTAGTGAATGTATCATTTGAACCACTTTTCTCTGGATGTATATCTTTTATGTTT
GAATATATCGTCCATAAACGGAGCTAGTCTTTATCGTGCATGTGCAGTAGAGTGCCTGAGACCCTCTTATTCTTTATTCAATATATTGCCGTCGTGACTT
CGCAACTGAGCGTGTGTTTGGCATGAAACATCGTTCTCTTTTTTGACTTAGGCTCACTCTGAATTACTGTTGCCTGAATCTGCGTTCAATAAGCTAATTA
TGTCTGGAGTCTGCTCATTCTCATGATATCCCGTTTTCTTTACCGGATATGCTTGCAGGATTGCAGGTGCATCGTCGATGGTACCCGTTTGTAGCTTACT
AAACAACGAACTATGAGTGATTGTTCATGTATTATGATTGTTCATGTATTAATTTCAGATTAAATGAATATTAATCGGCCTTGACTAAGAATAAACTGGC
TGTATTTTGTTGCTGGCCCTATTGCGAGACCATGGGGGTATGGGACTCGAGTGCGCTAGTTAGGCCGTTAGGCTTAAAAGGACCTGGTCTTTTGCAATAC
TACCCCTCCATCCAAAAAGTCCTTACTACGAATTTAGATATATGCGTGTCTGGGTTTATCTTTTTTATTGACAGACTAGTACGTCTTATTGGGCTAATTG
TTGTTTAGCTTTACTGTTGATATCCCGCTCTTCATTGGGATTTAAAATCTTGACATGGGTGACATTAGCAAATTATTAGCGGCAGCGAGTTATTTGTTTA
CCTTTGGAAAACAAACAGTTGAACTTTGTTGCCGGCTCGAAATTTCACTAGTATTGGCATTAAGATAATTGTGTGTGAAATTTGGAACAAACGTTAAAAT
TAGCACAAAAATTTTCATGAAAGTTTGCCTTCACTCTATAATTCGTGAGAAACAACCTTTGGGCAAAACGTGTGAGTATTAAGCTTTGCAAAAAAAAATG
CATGAATTTTTTCACTGGCTTAAATTTTTTGCTAGTATTAGCATCGGGACTGTTGCGTGTGAAATTTTTGAATACTATAATTAGGATTAAAATTTCATCG
AACTTTGCCTTAAGGCTATAAATTTATGAGATATACACTTGGGTCAAAACCCAGAAGTATTAACCTTTAGAAAAATGCACTATTTTTTCCTCCAACCCAA
AATTTTGTTAATAGTAGCACCTATACCATACCATAACATTAGGAGAAAATTTTCATGAAATTGAGCCTCC