Detailed information on CNT30102331


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30554139Oryza rufipogonOryza glaberrima32.5429.5891.851559forward
CNT30370554Oryza rufipogonOryza glumipatula14.2455.8698.39682forward
CNT30576747Oryza rufipogonOryza barthii32.5625.0991.731560forward
CNT30116141Oryza rufipogonOryza nivara34.8657.3398.921670forward

Expression of CNT30102331

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (43 aa)
MYFFFFLFSNLDVLEMDCFLFGLGWVSLYSLRFVGFLINNVVC*

>peptide 2 (38 aa)
RIIPLGKNPQIDPPLSLSPLLAGGRRGAARRIRRRFPS*

>peptide 3 (45 aa)
MCHFDHFSLDVSLCLNISSINGACLYRTCAVECLRPSYSFNILPS*

>peptide 4 (50 aa)
MDLVFYNTTPPLQKKKTNLSYELVYVCLGLSFFFYSLVRLIGLFVVQLYC*

>peptide 5 (47 aa)
MTVPLPTTRRRWRHRRLQPAITVMSCGSFVSPSAATPRAGNPRGWGT*

>peptide 6 (52 aa)
MATISFVISWKNIFFVLKSKYSSCDSTFYRSGYQFVVMCPHAFMFWDCVDCC*

>peptide 7 (52 aa)
MTTKNKLAVFCCWPYGETMGVWGSSALVMPLGLDGPSLLQYYPSVTKKKNQS*

>peptide 8 (62 aa)
MADVLLTVLLRFYSLFGILLIGGIFVGMQPGLVYQPRYQSFACFTTNIEYCSERRCVSWVSA*

>peptide 9 (37 aa)
MGDISKLLVAASYLCTFGKQTVELFCRLEISLVLALR*

>peptide 10 (38 aa)
MALRQWWVALNCLNNTGFIYVNWVVLALTFSFAPCCLA*

>peptide 11 (58 aa)
MLSCFGTVLIAVRSLQKLHGVVFILLICQFACLGEYSGAFFMTDDAFPIFSFAIYWLA*

>peptide 12 (44 aa)
MFEYIVHKWSLSLSYMCSRVPETLLFIQYIAVVTCMKHRSLFGL*

>peptide 13 (53 aa)
MLCILSIERSELAVPFKLSLYLYVVPFKLSVYLYDLISECVILTTFLLMYLYV*

>peptide 14 (33 aa)
MGFLLGCKYVTGLGQPTHTLIIQLLYPNIWLCS*

>peptide 15 (36 aa)
MKLSYLVPIWCIRITLFSHVWWTGGVYVIHTCKLCQ*

>peptide 16 (32 aa)
MILGIIHLHQNGICSYASSYMIPSIQVYAVYS*

>peptide 17 (68 aa)
ESSLSEKIPKSIRLSLSPPFSPAAGAARRGGFGGDFLPRVWSSSSPPASSRTDGIAPSLLDPPRHRKP*

>peptide 18 (74 aa)
MPPSAYHCPSMLGGTLSLVIGPCAESAVGGSVYLHTYFASYVCKSFLDVLSCLSVLHIVCPEKEDFSVDICYPP*

>peptide 19 (76 aa)
MEAGAWWSTMPLRAQKYRTRGYEDLCWALVGWLPGLVGLLPNTPFLLPNFSTMFSTNHASTISYGKATPYASALWR*

>peptide 20 (59 aa)
NHPSRKKSPNRSASLSLPPSRRRPARRGEADSAAISFLGFGLPPPLRPPLAPTASPPPF*

>peptide 21 (29 aa)
MAASTITTCDYRHVVRFVRLPLRGDASSR*

Sequence

>CNT30102331
CGAATCATCCCTCTCGGAAAAAATCCCCAAATCGATCCGCCTCTCTCTCTCTCCCCCCTTCTCGCCGGCGGCCGGCGCGGCGCGGCGAGGCGGATTCGGC
GGCGATTTCCTTCCTAGGGTTTGGTCTTCCTCCTCCCCTCCGGCCTCCTCTCGCACCGACGGCATCGCCCCCTCCCTTCTAGATCCGCCTCGCCATCGAA
AACCCTAGACGACCACGAGCCGCCATGACCGTCCCCCTTCCCACCACCCGCCGCCGATGGCGGCATCGACGATTACAACCTGCGATTACCGTCATGTCGT
GCGGTTCGTTCGTCTCCCCCTCCGCGGCGACGCCTCGAGCAGGTAATCCACGGGGTTGGGGTACCTAGGGTTAGCGTTTGTTCGGTGAACGGGGGGCGTC
CGTTGCACGGCACGACCCGACCACTGGCTCCCGCATCCATGGCGATGACGGCGATATCTCCCGTCAGTTGCATGGTCCCCTTGCACAAACGCCCAGACCA
AGTTGATCTCGGAACCTAATTTACATCAGATATCGTTGCCTTGCACTGATTTTAGGGATTAGGGTAAAGTAAAGGCCTTATAAATGTATGTTCCCATGAA
ATCTAACCGGACCTGTTGTTTCCCATTCATGCCGTTGATTGTAGGGCTTGCTTGTTTAGGTTAGGTGATAAAAATTAGAAAATGCTTAAAGTAAAGCAGT
AGTGATGTATTTCTTTTTTTTTCTTTTTTCCAATCTGGATGTTTTAGAGATGGATTGTTTTCTATTTGGTTTAGGTTGGGTTTCCTTGTATTCTCTTAGA
TTCGTTGGGTTTCTTATCAACAATGTTGTCTGTTGACTGTGTTGTTTGTGAGGGATATGGGTTTCATTGTTTTGTTCCTTGTGGGATTAAACATACTTTA
GATAAGTAAATTGGGCTGTATTTGTACAATTGGTAGCATCTGCCCTTTGGCCTTTTATTTGCTACTCAGTATTGTCGGCATCATCCGGTTTGTTTGGAAT
TTATTGGATAAGATTAATGGGGTTTCTGTTAGGATGCAAGTATGTAACTGGGCTTGGTCAGCCAACCCACACACTGATCATTCAGTTGCTTTACCCTAAT
ATCTGGCTTTGTTCATAAAGATGCCGTACGATAGCTATAGGCCATGTGCAGAGATTGAGTAGGTGGGTCATCCATCCCACTTGCATACGTACTACTAATA
TGTGTAAGAGTTTCTTGTATGATGTTACTAATAGATGGCTCTGAAAATGTACTTTTTTTTGTCCATATTTAATTTTTCAGTGTCCTTACCAGAAATATCT
CTGGCCTATCTCTAGAGCTGTATTGTCTGTGGTGGTGGTCCCTTCAAAGTTTTGTGCAATCGGAGCATAGCTATCTTCTTTTACCTCTAGGTTGTGTTTT
AGCAGCTGAACAAGTGCTGTAATCCTTTCTCTACTTCTTTCTGCCCCCCCCCCCAAAAAAAAAAAAAGAGAGAGAGAGAAAGAAAAGGGAATGTCCTATC
TTGCTATGTTTCTTTAAGTTGGTTCTGTTTTCCTTCCTTCCAAATGAAATTGGTTCTTGTGAATCAATGTAGCGTCCCTTTACACAGTATTGTTTTCTCC
CAGTTGTCTTGTCTTTTTATTTGACTTTTCATATATGTAAGGGAAAGAAGAAGGCCTTAGAGAAAAAAACAGTAGAAAAAGGAAAAGAAGATAGGGGTAA
GCTCATCCTAGAACCCTAGTTGGCTTGCAGTCACCTTCTTCCTCACCGCAATGGCTGGTGCCTTATCTGCTCGTCATGGAGGCTGGTGCCTGGTGGAGTA
CGATGCCTCTTAGGGCACAGAAGTATAGAACACGTGGGTATGAAGACCTATGTTGGGCTTTGGTGGGCTGGCTGCCTGGCTTAGTGGGCCTTTTACCAAA
TACCCCCTTTCTTCTTCCTAATTTCTCTACCATGTTCTCCACTAATCACGCCTCAACCATCTCATATGGCAAAGCAACGCCTTATGCCTCAGCGCTATGG
CGCTAAGGCAGTGGTGGGTCGCGTTAAACTGCCTTAACAACACTGGTTTCATATATGTAAATTGGGTTGTACTTGCACTGACCTTTTCTTTTGCACCCTG
TTGCCTTGCATAAATTTGTTGGTACATGGCTGATGTTTTACTCACTGTTTTGTTAAGATTTTACAGTTTGTTTGGAATTTTGTTAATTGGTGGGATTTTT
GTTGGGATGCAACCGGGCTTGGTCTACCAACCCAGATACCAATCCTTTGCTTGCTTTACCACTAATATTGAGTATTGTTCAGAAAGGCGCTGTGTGAGCT
GGGTTTCTGCCTAGGAGCTAGGTTACCTGTTAATACTTGTGCAGCAGGCGGGAGGATGCCGCCTAGCGCCTACCATTGCCCTAGTATGCTGGGTGGAACC
TTGTCACTGGTTATAGGTCCATGTGCAGAAAGTGCGGTAGGTGGGTCAGTCTACTTGCATACCTACTTTGCCTCGTATGTTTGTAAGAGTTTCTTGGATG
TTCTATCTTGCTTATCTGTACTGCATATAGTCTGCCCCGAAAAAGAAGATTTTTCTGTTGATATTTGTTATCCTCCATAATTAACTTCTCAGTGCCCTTA
TCATAGAATTATCTCCAGGGAATGCCCTACGTTGTTTGCTCTTGTAGTTGGTTTTGTTTGCCTCCCTTCATATGAAAATTGGTTGTTGTGAACCAATGTA
ACCCTTTACATCCAGACGTCTTTTTTGTTTGTTTTCCCGTGGTGCTGACTTTTTGTTTTTAGTTCTATGAAGCTGAGTTATCTTGTTCCTATTTGGTGTA
TTAGAATAACGCTCTTTTCACATGTTTGGTGGACAGGTGGAGTTTATGTTATTCATACATGCAAGTTATGTCAATGACACCTAACTGGTTTAGTTTAGAT
CCTTGTGTCTCATTGTCTCCTTTGCAAGACAGAAGTTCTATTTGATTAAAGCAATGCTGCAATGTATGTTGATTGTGAGGCAATGACTGAAAAGGATGAT
TATGAGAGCAATACTGAATCACCTGTCTGTTTGTATTAGTATGTGAGTGTGACAATAATATTAATGGCAACTATATCCTTCGTCATTAGCTGGAAGAACA
TTTTTTTTGTTTTAAAAAGCAAATATAGCTCGTGTGATAGTACTTTTTATCGGTCTGGTTACCAATTTGTAGTCATGTGCCCTCATGCTTTCATGTTTTG
GGACTGTGTTGATTGCTGTTAGGAGCCTTCAAAAGCTGCATGGTGTTGTATTTATTTTACTAATTTGCCAATTTGCATGTCTTGGTGAGTATTCAGGTGC
TTTCTTTATGACTGATGATGCCTTCCCCATCTTTTCTTTTGCTATTTATTGGCTAGCTTAATCCAGAGTCTTATTCTGCTGTAGCTTTTGGGGATTAAGT
TAGTTTTTAGTCGCATGTAGTGGAATTGATTGTCTTGTTTCAGCAAGCAAGATAAATTTCCACTCTTCCAACTGTATTATTTATTGCAAGCAAGATAAAT
TTCCACTCCTCCAACTGTATTATTTATCTTTATGTAGAGCTCGCCCCCTGATTCTCGAGCGATGATCTTCTCTCCTGAACCACTGACCATCACTTAGCCC
AACCCACAACAAATCTGCTTTGTTCTTTCGCACTTACGACTGGTTACGTTAGTTGTGCAGGTGTGATGTCTGGTATATGACCAGAAGTTGCTCTGTGTGT
TTGTAGTAGGGATTTGAACCGTGCCTTCTTGTTTAAATGTCATTTTATTGCTTTCATGGATGATCCTAGGTATCATTCACCTTCATCAGAACGGAATTTG
CAGTTATGCTAGCTCTTATATGATTCCATCTATACAAGTGTATGCTGTGTATTCTTAGTATTGAGCGTTCAGAACTTGCTGTTCCTTTTAAGCTCAGTTT
GTATTTATATGTTGTTCCTTTTAAGCTCAGTGTGTATTTATATGATTTGATTAGTGAATGTGTCATTTTGACCACTTTTCTCTTGATGTATCTTTATGTT
TGAATATATCGTCCATAAATGGAGCTTGTCTTTATCGTACATGTGCAGTAGAGTGCCTGAGACCCTCCTATTCATTCAATATATTGCCGTCGTGACTTGC
ATGAAACATCGTTCTCTTTTTGGACTTTGAGGCTCACTCTGAATTAGTGTTGCCTGAATCTGCGATCGATAAGCTAATTATGTCTGGAGTCTGCTCATTC
TCATGATATCCCGTTTTCTTTACCGGATATGCTTGCAGGTGCTTCGTCGATGGTACCCGTTTGTACCTTACTAAACATGAGGGATTGTTCATGCAATGAC
GACTAAGAATAAACTGGCTGTATTTTGTTGCTGGCCTTATGGCGAGACCATGGGAGTATGGGGCTCGAGTGCGCTAGTTATGCCGTTAGGATTAGATGGA
CCTAGTCTTTTACAATACTACCCCTCCGTTACAAAAAAAAAAAACCAATCTTAGCTACGAACTTGTATATGTGTGTCTGGGTTTGTCTTTTTTTTTTTAC
AGCCTAGTACGTCTTATTGGGCTATTTGTTGTTCAGCTTTACTGTTGATACGCCGCTCTTCATTGGGATTTAAAATCTTAACATGGGTGACATTAGCAAA
TTATTAGTGGCAGCGAGTTATTTGTGTACCTTTGGAAAACAAACTGTTGAACTTTTTTGCCGGCTCGAAATTTCACTAGTATTGGCATTAAGATAATTGT
GTGAAATTTGGAACAAACGTTCAAATAAGCACAAATTAGCCCTTGGGCAAAACGTGTGAGTATTAATCTTTGCAAAAAAAATGCAAGAAAT