Detailed information on CNT30515237


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30201861Juglans regiaPisum sativum23.2357.784.38397forward
CNT3048549Juglans regiaPrunus dulcis22.6444.989.66387reverse complement
CNT30162946Juglans regiaPistacia vera5.3241.7486.8191forward
CNT3086189Juglans regiaVigna radiata5.7323.7990.8298forward
CNT30144549Juglans regiaMedicago truncatula10.0152.9486.55171reverse complement
CNT30716815Juglans regiaMalus domestica golden21.9461.7886.4375reverse complement
CNT30723531Juglans regiaLupinus angustifolius22.6415.8687.6387reverse complement

Expression of CNT30515237

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MLYVSQFCCLWERIKMGNLCFTTSTGISIV*

>peptide 2 (37 aa)
MLHEMVYMFVFSGFVRVWWKIYRWIGLCMSRVFFFYR*

>peptide 3 (33 aa)
MHPMDLYATATPSTLSYGEEVVGTNGARELIGK*

>peptide 4 (41 aa)
FMGAFVFSTMGTFRELDVNFGACIVKWCLLMVFLIILWGLV*

>peptide 5 (40 aa)
MQKNACWVFETVQIIFIIISLICFTEKVYGSSLYSPILLI*

>peptide 6 (46 aa)
MTLGMVDNGLSYRSKLHVLVAMLLNFHCIDIVLCCMCLSFAVYGKG*

>peptide 7 (63 aa)
MGKDKNGKFVFHYKHRHFYCIKVIYRLYQSIYYISIRTSKNKKILFSSYLMNFKVYEVSYLIF*

Sequence

>CNT30515237
TTTATGGGTGCTTTTGTTTTTTCTACGATGGGGACTTTTAGGGAATTGGATGTTAATTTCGGAGCTTGTATTGTAAAATGGTGCTTGTTGATGGTTTTTT
TAATTATTTTGTGGGGTTTAGTTTAGGGTTTGTGGAGTCAGTTTTGATCTTTCGGCTCTAAGGGGTTTTCCGTCAAATATTTTATTTTGTTTCAATTTTG
GGTTATGTTGCATGAAATGGTGTATATGTTTGTGTTTTCAGGTTTTGTGCGTGTTTGGTGGAAAATATATAGGTGGATAGGATTGTGCATGAGTAGGGTT
TTCTTTTTTTATCGCTAACTCGCGCATGCACCCTATGGATCTTTATGCCACAGCTACGCCCTCCACCCTGTCTTATGGGGAGGAGGTAGTAGGTACCAAT
GGAGCTAGAGAGCTTATTGGCAAATAAAATCACTAAGTGGTTTTTGTTGAAATGACTTTGGGTATGGTGGACAATGGATTGAGTTATAGGTCCAAACTGC
ACGTTTTGGTCGCAATGCTGCTGAATTTCCACTGCATTGACATTGTTTTATGTTGTATGTGTCTCAGTTTTGCTGTTTATGGGAAAGGATAAAAATGGGA
AATTTGTGTTTCACTACAAGCACAGGCATTTCTATTGTATAAAAGTAATCTATAGATTATATCAATCTATATATTATATAAGTATCAGGACCTCAAAAAA
TAAAAAAATTCTCTTTTCGTCTTATCTTATGAACTTTAAGGTGTATGAAGTTTCATATTTGATTTTTTAAATAGAAGTAGGTCGATAGAGACTCCATTTA
ACTTAAGTTGATCTAGGCCAAAAGCAGACCAATGTCAGGATAATCCTTCTTTGAAACACTTTGGTAGTGCTCCTTTATTTTGATTGGAATCCAAATAATG
AATCAGAGCACACGGAGCCATCTCCTTATCTTTTTGTCAAGAAAAAATATGGTAGACTAGCCGATATTTATATCAGTTAATGAAAGAGCCCAATGCAAAA
AAATGCATGTTGGGTCTTTGAAACAGTTCAAATCATTTTTATAATAATCAGTTTGATTTGTTTTACCGAGAAGGTCTACGGTTCGAGTCTGTATAGTCCT
ATATTATTAATATAACTATAATTAATATTAATATAACTATAATATAATGAAAATAAAATGTATTTTATTGATATCGATTTCTAATAAAAATTTCTAATAA
TACTTATAAAAATTTCTAATAATAAATAATAATAGAATAGAATTGGGAATAGAATTTAAAATTCTAAACAAAAAAATTATAATGCTATTTCAAATTCCTT
TTCTTTAGCTTGTTATATACTTTAGTTCTTTATAAGTTTCTTATAGAAAATCTTTTTATATAAAATTAAAACCAGAAGTGAAGTGAAGCCGTGAGAGTTT
TATTTGTATTGTATATTTGATTTGTATCGTATAAAAGTAATCTATAGATTATATTAATCTATATATTATATATATTTGAATATATTAGAAAATATGCGAA
TTTCCTAGTTTTTGCCAAGATTTTCTTATGGCAGTCTAAACATTGTTAGATTGTTGTAGTAATGTCAGTAAATTGTGCTTCAAGTATTTACACTAATATG
TACAATGTGCATGAAGGGTTCATTAAGCCATTTTTTAACAATTGTTGAAGTCCGAGGAACATATTGAAATGATTGTGTCTACGCTTCCACTATGTTGCAG
AAAATTTTC