Detailed information on CNT30438383


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30183145Aegilops tauschiiSecale cereale27.2645.7190.522459reverse complement
CNT30220549Aegilops tauschiiHordeum vulgare14.6822.5179.681324forward
CNT30384070Aegilops tauschiiTriticum turgidum1.8421.1793.98166reverse complement
CNT30660461Aegilops tauschiiTriticum dicoccoides6.1884.3990.84557forward

Expression of CNT30438383

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (38 aa)
MDCCWFSSYWTCMGTFRKVPCVCFTMLQAVSSVDFNLS*

>peptide 2 (50 aa)
MDIIGTCGVYLTIPVETQRQAYFIFNSSPFNLVSSLTETFIERYLARCRS*

>peptide 3 (47 aa)
MQTCCLCVGFHGLVAGLDLVCGDPWGVVCHCRSCGLLVLITSSVIIS*

>peptide 4 (70 aa)
MCITSLNQAYPHLPCYICSHVFDVEQLSPKWLGIMVFCSLQVYLTILQKSDVMLRENLFGDPLTSHFLFS*

>peptide 5 (69 aa)
MLSYLMKKLLLSWLPFACSIDQAMLVAIQNMLPFWFLILYVVYFVICTTHPCVSVGLLAWPGMRICSFR*

>peptide 6 (69 aa)
MPLFILFRHADSKFRALDATTVQLYISSAQMLLLIFAASNILYIVEQTLACLSSGYCLSTTLSKHAGRC*

>peptide 7 (54 aa)
MTSASDCMWFGRNMISAFASNQQNARSNVVLTGSSFSLKQGFNNGNISSYSKFV*

>peptide 8 (43 aa)
MAHQYGCPSICGELVLVLTADLACGMCLCSLRCRMLLGDESKD*

>peptide 9 (42 aa)
MFQGSQRCRYMVVHFQGRNSGPTKLKLQPLQASTGDGYPTVR*

>peptide 10 (32 aa)
MVVQKLELHGLAGGPILPQRGGSFFFNLIELS*

>peptide 11 (32 aa)
MRSHPRCASASSGEMVLDIDEGSRFDFCSWLF*

>peptide 12 (31 aa)
MFGFLYKWLDLSGGRCFGVISVWMISNSRSL*

>peptide 13 (32 aa)
MVFSALGNYVSLQILTWMRDNIVCYLELVLIN*

>peptide 14 (31 aa)
MSSECSKILHFLVHTWFSFNYFPGEFFRIIL*

>peptide 15 (31 aa)
MFFSCLDDILSLGLELLVMPAWLRIHKRLEA*

>peptide 16 (30 aa)
MLKYPKHLYHNSERREYIATLLAVQSFGLS*

>peptide 17 (30 aa)
MRIIQTNVHNFTKPGLSPSPLLYLFTRFRC*

>peptide 18 (29 aa)
MVKSSGMIKLSTSYQPRLQYTICVWIILI*

>peptide 19 (30 aa)
MWFSFSCSKEVRDADIWWFIFRVGIQVRRN*

>peptide 20 (50 aa)
MRIYLFEDLLNPTPFQFIAICSTYKLSYGDNLNIQIDLLDRFEGFSGASV*

>peptide 21 (48 aa)
MSQRVDVWFLIQMVRSFRRTMFWCDQCLDDLKFSITLTFNLLIFYEVQ*

>peptide 22 (92 aa)
DFRRPPVPAKPCPVRNRLAPGRLPLPTASAPATKGAQVRPAHPVLRPPPSPPLSLSLSLELSFSAQAAASRLRDGFLPLCPSSTLDSVSNRV*

>peptide 23 (78 aa)
MSSFGSIGMAFLLMGLNFLDLSYRNNSDSADISFPCVTHSQLLQIVSCNGYNWNVWCLPDHPSRDSETGLLYFQLLTV*

>peptide 24 (79 aa)
MLSIVPGMTSVACLCEQSGVFSFLIIFILTVKRIANRAADEAADLALDQLAEHFNTWQIILSSVQTFFYTVYFKNEQIF*

>peptide 25 (29 aa)
MWRSLGCCMSLSLVWSSRSYHEFRHHQLI*

>peptide 26 (29 aa)
MGSSTTYSQIFNYIISVFWELRNFNFLGN*

>peptide 27 (38 aa)
MINPDPEAYYSLRPETLVLEMVVSRLILVIDTSIFNHF*

>peptide 28 (36 aa)
MDKLDLQCSRCKQMGMVHEFTGNFSCTPSVPKYLSF*

>peptide 29 (38 aa)
MDGYKLLSCVLKFSFWIKAVDWINHGMGIREFVKSVFG*

>peptide 30 (39 aa)
MVCLFHLLAPPPELACRTGSGSGLDMKLPMVYKNMVKGT*

>peptide 31 (39 aa)
MIPVWWYGIDFQKMMFFSLVLLQWDIFNSMHLLGLLENS*

>peptide 32 (41 aa)
MLVVSLNMLKSSCLPFTISLWFYYWLSVLLIPALVFLPIAI*

>peptide 33 (40 aa)
MWFTLLSVLPIHVFLLVCWPGLVCAFVPLDKKDGGDHTEG*

>peptide 34 (33 aa)
MPRCMNLRIIRSFLLMAHPTTGKDSCRPFFNFI*

>peptide 35 (33 aa)
MLHPCFDSLSSSNYGLTFLEETSKYADYIWAVH*

Sequence

>CNT30438383
TTGATTTCCGCCGCCCACCCGTCCCCGCAAAGCCGTGTCCGGTAAGGAACCGGTTGGCGCCAGGCCGGCTCCCCCTCCCCACCGCCTCTGCGCCGGCTAC
AAAAGGCGCCCAGGTGCGCCCCGCCCACCCCGTGCTCCGGCCTCCTCCCTCCCCCCCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTCTGGAGCTTTCGTTCTCCGCCCAA
GCCGCCGCCTCGCGTCTCCGCGACGGTTTCCTTCCCCTGTGTCCATCATCAACTCTCGATTCCGTCTCGAATCGCGTTTGATCTTGCTATATCCTCGCCG
CCTCTGCTTCTGTGCTCGCAGGTGGTTCGGCCCGTCTCGTCCGCCTCCGGGGGAGCGATCGATCGGGATCAGGATCCCGCCGAGCTGTTCGGTTTTGCTT
CCGCGTCTGGTTTCGGGCGATCCTCCGTTGGCCGAGATTGGTCCTCGGTTCTGCGTCCGTCGGTGATTTCAGATTTCAATTTAATTGAACGTCTATCGCC
CGTACGGCTCTATGTTCCCCGATCACGTCACCAGTTCCGTCGTCATCACTTAATACGAGGTGGATTCCAGGCCCTCCCTCGTGGATTCTTGTTGTACCGC
TGATCTAGCTTTTGGTGTATGCGCTCTCATCCTAGATGCGCGAGCGCTAGTTCTGGAGAAATGGTATTGGATATAGATGAAGGGTCAAGGTTTGATTTCT
GTTCATGGTTATTTTGATTGATTGGTTATACAGTCCAACGGTTATTCTAATAATATGGTCAAATCTTCTGGGATGATCAAGCTTTCGACCTCTTACCAAC
CTAGGCTGCAATACACGATCTGCGTGTGGATAATCCTAATTTAGTTTCTTGGTTCAATTTAGCCTGCTGCAGTACAATTCTGATTTGGGTGTTTTGCTGG
TTATCCAGAAACTGCGAGCCACTCATCTTCTGGCACACCTGCGTTTGGATGATAGCACTCTCTGTTTAATTTGTTCTTCTCCACAATTCAATTAGCCCCC
CAACAACTCTGATTTTGATTTGTTGCTGGCTCCCCAGACTGGAATTACATGTCCTCTTTTGGCTCTATCGGCATGGCATTCCTTCTTATGGGCCTCAACT
TTCTGGACCTTTCTTATCGAAACAATTCTGACTCAGCAGACATTAGTTTCCCGTGCGTTACTCATTCTCAGCTCTTGCAGATAGTGTCTTGCAATGGATA
TAATTGGAACGTGTGGTGTCTACCTGACCATCCCAGTCGAGACTCAGAGACAGGCTTACTTTATTTTCAACTCCTCACCGTTTAATCTAGTTTCCTCCCT
AACTGAAACATTTATAGAAAGGTATCTTGCTCGTTGCAGGTCATAGTTCACCAACACAAGGCCACCAACCTGATGCTAAGTCTGCAGTTCTTCTATCTAC
TCAGCTCCTTAACTTAGATAACAATACTAAGATTTCTTGTTAGGCAATATTTCAGATTCAGATTTAGCTGCAAAGGTGCAAAAATGAAGCTTAAAACTAG
TGGCATATCCTAACTTAAATCTCTTATCCTCTTATTTTTATTTAATTCAGCTACATGTTCATGTCTTTGATTTAGGCTTTTTGCTTCTGTCCTCCATGTC
GCTGCAGATTTGTTTTGGCCTAAGACAATGCTGGTAGTGAGCCTGAATATGTTAAAATCGTCTTGTTTGCCATTTACTATCTCTTTGTGGTTTTATTATT
GGTTATCTGTACTCTTGATCCCTGCGTTAGTCTTCCTGCCCATTGCTATCTGATATATTTATAGGAAGTCTGGGCCTACATGCAAACCTGTTGTTTGTGT
GTTGGCTTCCATGGGTTGGTTGCAGGACTGGATCTAGTATGTGGAGATCCCTGGGGTGTTGTATGTCACTGTCGCTCGTGTGGTCTTCTCGTTCTTATCA
CGAGTTCCGTCATCATCAGCTAATATGAGGTGGATTTGAGGTCCTAGTGGATTCTTATTGTAGCAGCTGATCTCGCTTTTGGTGTGTGTTTGTGCTCCTT
TAGCTGCAGCAGAAGCAAGAGGGTAGTGGTTCCGCAGAGATGAGTCAAAGAGTGGATGTTTGGTTTCTTATACAAATGGTTAGATCTTTCCGGAGGACGA
TGTTTTGGTGTGATCAGTGTTTGGATGATCTCAAATTCTCGATCACTCTGACTTTTAACTTACTCATATTTTACGAAGTACAATAATTTACTCTCCAGAG
GTTCTGATTTGGATTACTATTGGTGATCTACAGAAATTTGGATTTGGCTTAGCGACTGGGGGTGACTTGCTGATCTGCTTTGGATGAATCATTACTTCCT
CCATTTCATTTATTTCTCTCCATAGCTCACCTTCAGTGTACGACAGTCCTGATTTGCATTTGTTGGTGGTTCTTCAGAAATTGAGGTTATACGGCTTAGC
GGGAGCACCTATCGTCTTGGTGATCTACAGTGGATGATCATTACCTACTCAGTTTAATTCTTCTTCTCCAGAGTTCAATTAGTCTCCCAACAATTCTGAC
TGTGATCTGTTGATGGTTGTCCAGAAATTGGAATTACACGGCCTAGCGGGCGGTCCTATTTTGCCTCAGCGTGGCGGTTCCTTCTTTTTCAACCTTATTG
AACTCTCATGACATTAGGTTTTCTCTGCCTTAGTTGGTAATTCTCAGCTCTTGCAGATACTGACATAGGATATATAACTGCAGTTTGGGACTGGTGGTGT
TGTCGTCCGTCAACCATAGCTGAACTTCCTATCCGAGCCAGGCTTACTTGTTGCCGCCCATCGTTTGGTCCAAGCTTTAGCTATTTAAGTAACATTTTCC
CCTAACTGAAAATTTATAGAAAGGTCTCTTGCTCGTTGCAGGTTGTAGTTGACGAAACTCGAGCCCAACCTGATGATGAATCTGTTTGCAGACCTTTTAA
ATCTACTAGTATAGCTTCAATTCAGTGCAACTCACATAACCTACAAATTATCTTACCTAGGCAATATTTTATAATACAGATTCATATGCCAAGGTGCATG
AACCTAAGGATAATCCGAAGCTTTCTACTAATGGCACATCCTACAACCGGAAAAGACTCTTGCCGTCCTTTTTTTAATTTCATTTAGCTACTTGGCCTTG
TCTTTGATATAGGTTTTTGCTCCTGCCCTTCCTGTGGTTGCAGATTTTTTTTAGCCCAGAGCCCCAGACCATGTGGGTAATGACGCGGAGTCTGTTCTAA
TATTTTGGTTTGCGATCTAGCTCTCCGTTGTTCGATTTGACACCTTTAACTCTTGATCTCTGTGTTCTATTGGTCTTCTGCAAGTGTGGGTTGCAGGATA
TGATAGTTAGGAGTTCGTGCCCAAATCTTTGCTCTGTCAGGTCAGTGTCTTGTATATGGTCTGTTTGTTTCATTTGTTAGCGCCACCTCCTGAGTTGGCT
TGCAGGACTGGATCTGGATCTGGTCTGGACATGAAGCTCCCTATGGTGTATAAGAATATGGTGAAGGGGACTTGAGGCAGGTTAGTTTCCCACGTTTGGT
CACATTGGTTTACTGGATCCCTCATCTGTGCTCGGTGACGAAAGATTTAAGTGGCTATACCTTGAGTTCCTCGATTTGTCTTTGTCTGATGGCTCATCAG
TACGGCTGTCCCTCAATATGTGGTGAACTGGTTCTCGTTTTAACAGCTGATCTCGCTTGTGGTATGTGTTTGTGCTCCTTGAGATGCAGGATGTTGTTGG
GTGATGAATCAAAGGATTGAGGTTTGCTTCATGGTTATTTTGATTGGTTATGGCAAATGGATGGTTATAAGCTGTTATCTTGTGTGCTGAAGTTTTCGTT
TTGGATTAAAGCTGTGGATTGGATTAACCATGGGATGGGGATCAGAGAATTCGTGAAGAGTGTGTTTGGATAATCGATCCTCCTCCAGTTAGTTTCTTTG
TTTGCACAGTCAAATTTAGCTAATGGACTGTTGTTGGTTCTCCAGCTATTGGACTTGTATGGGGACTTTCCGGAAGGTGCCCTGTGTTTGTTTCACCATG
TTACAGGCGGTTTCTTCTGTTGACTTCAATCTTTCCTGATTTTCTTTGAATATTGGACTTTCTATGGTTTTCTCTGCCCTTGGTAACTACGTGTCCTTGC
AGATATTGACATGGATGAGAGATAATATAGTTTGCTATCTGGAACTGGTGTTGATTAACTGATCTCTCCCAGCCAAGCAGGCTTATCCTATCCCCTCACT
GTTTTGATGCTTTATTTAGCTGTTTATAAGCAGCTTCATCTCCCAAAAGCAAAAATCATGAGAAGGTCTCTTGGTCGTTGCAGGTCCTAATTGACTATTT
TGGTCCAACCGATGCGGATTTATCTGTTTGAAGATCTTCTAAACCCTACACCTTTCCAATTCATTGCAATTTGTTCAACATATAAATTATCTTATGGAGA
CAATTTGAACATTCAGATTGATTTGTTGGATAGATTCGAAGGTTTCTCTGGGGCTTCAGTCTAGATGGGACATCCTACATCCGAAAAAACTCGGTGCTCT
CCACAACCGAAAATTATCTTATGCTGAGTTATCTCATGAAGAAACTACTGTTGTCTTGGTTGCCTTTTGCTTGTAGCATTGATCAAGCCATGCTGGTAGC
CATTCAAAATATGTTACCTTTTTGGTTTCTGATCCTCTATGTGGTTTACTTTGTTATCTGTACTACCCATCCATGTGTTTCTGTTGGTTTGTTGGCCTGG
CCTGGTATGCGCATTTGTTCCTTTAGATAAAAAAGACGGTGGAGATCATACTGAAGGGTAGAGGTTTGGGTGATTCATGGATGTTCTTTAGCTGTTTGGA
TGATATCTTAAGTTTGGGATTGGAATTGTTGGTCATGCCTGCATGGTTGAGGATTCATAAGCGTCTTGAGGCGTGACTGGACTGTTTAGATATATTCTCC
TCTTTGATTTCTCCATGTGAGCAGTTTGGTTTCTGTTCTGAGTATTATTTGGATTTTTTGGTTGTTCTCCAGCATTTGAGCATAGGCTTGCCCGGACTAC
TTTTTGGCTCAATAATTGGAATGGTGCAGAGCTCTAGGAGATTCTTCGTGATTCGATCTTGTCAAACTTCTCTATGTTAATAACTTCTAACATTCCAAAC
ATTGATCTTTCTTGTCAGTAACTCTTAGTTCTATGCAGATATGACATACAATGAGGATAATTCAAACCAATGTGCATAACTTCACTAAACCAGGCTTATC
CCCATCTCCCTTGCTATATTTGTTCACACGTTTTCGATGTTGAACAGCTTTCTCCAAAATGGTTAGGCATCATGGTCTTTTGTTCATTGCAGGTGTACTT
GACAATTTTACAGAAGTCTGATGTCATGCTGCGTGAAAATTTGTTTGGAGACCCTCTGACTTCACATTTTTTATTTAGTTAGCTAGAAAACCAATTAGTT
GTTAAGTTTGAGTATTCAAACTGATCCGCAGAGGTGAAGAGTTCTAAAAGCTTGTTTGGCAACTTCGTTCTGGATAGAGGAGTCTTCTACAACCACAAAC
TTATACCTATGCTGCATCCTTGTTTCGACTCATTGTCCAGTTCTAATTATGGTCTGACTTTCCTTGAAGAAACTTCTAAGTATGCCGATTATATTTGGGC
TGTTCATTGATCGGCACTTTGGAGGTTTTATTGGAAGATTGTAGAATTGGAAAGTCTAGCAAAACGTCAGTTGGTGTGAGGACTCGGTGAAGCCCGGGAG
GTTTTGACTAATGATTAATCCTGATCCTGAAGCATATTACTCCCTCCGTCCGGAAACACTTGTCCTAGAAATGGTTGTATCTAGACTTATTTTAGTTATA
GATACATCCATTTTCAACCATTTCTAAGACAAGTATTTCCGGACGGAGGGAGTACTTGATTTGGTATTTGTGGCAGCTTCTTTCAGTGGTAGTTTGGAGT
TAGTAGTGTGCACATCTGATTCTTCCAACCGTCCTGAAGCATCTTATTACTTGGTTTCTGTTGTGCCATCCTACTGATTATGACATCTGCTTCAGATTGC
ATGTGGTTTGGACGGAATATGATCTCAGCTTTTGCTTCGAATCAACAAAATGCTAGAAGTAACGTTGTCCTAACTGGAAGTTCCTTTAGTCTCAAACAAG
GGTTCAACAATGGAAATATCAGTTCATACTCAAAGTTTGTATAGCAGATTATCAAATTTTGATTTGGCTATAGATTAATTGGTTGACATACTGTTTACGG
AAGTTGGGGTTTTAATATTAGGCTGATTGTATCTATAATTTTATCTCTAGCAGTACATGAGCTCTGAATGCAGTAAAATTCTACATTTTCTTGTCCACAC
TTGGTTTTCGTTTAACTATTTTCCTGGTGAGTTCTTTAGGATCATCTTATGACACACAATCAATTCTTTATGTGCACAGATTTTTAACTTCAGTGATAAA
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CTAAAAAATATGGAGAGTTGAAGCTTCTGAACTGAAAGCTAACTAATAGTTTTCCCTGAACACTCTACTCTTGATGTCTTAGATTACTTATATGATTCCG
GTTTGGTGGTATGGAATTGATTTTCAGAAAATGATGTTCTTCTCATTGGTGCTTCTCCAGTGGGATATCTTCAATTCAATGCATCTTCTCGGTTTGCTGG
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AGACAAAAAGCGTTCACAACATAATTTGATCTGGTTTATGGGATCTTCAACCACATATTCTCAAATCTTTAATTACATAATCTCGGTTTTCTGGGAACTC
CGTAATTTCAATTTCCTTGGCAACTAGCAAAATTACTAATTAGAAGATTCATGCCAATTGCATACTCTTGACTAGGGATGCAGTGCGGCGTCCCGCATAA
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GCATCCTGGATTTTGAAGACACAAAAGTATCTCCTCTGACCCTATAATAATGGGATAAAACTGTGAATTCTTATTTTCAAGATTGAAGGTTTGAATCACC
TCACCCCACTATAGAAATTAGTCACTCTCATTCAGGTTCTGGAATTTATAGCTTTCTTTGTTTGCGACACTATGTCTGTCTTTTGATATTGTGCAATTGT
CGTGCAATTTTTTTCTTTTTCCTTTGGTTGATGGTGTGGCTTGTATGCTTAGCTGAAATAATTGGTTGTAGTGTTTGCTAGTTTTTGTGTTTAGTAGTTT
TGTAGTTTAACACTGCCTTTGCCGGTCCAAGCCCGGATGAGAAAATGTGGAGGGAACTGCATCATTTGCATTAGAACTGCATCCGAATATTTGATATTGA
TTAACAGTGAATGAAGTGAGTATAAGCTACAGTCCTTACTGGCCTGATCGTATAGTGTGGTACGTAGCATATGATTCAAGCTTTGAAATGCATCCTTTCT
GTGGTCGGTGTTAGAAGTGACTGTCTCGCTGATTCCTTTCTGAAGCTGTACTAGGTCGGTGTTTTTCTTACGATCCCAAAAGGAAAGTGAGTGTATAGAT
TTGCATGAAGCGCCTCGTGTACAACAACTATCCAGAAATATGTAGTTCAGCTGTTTTGGGTAACTAACTTCCCTAGAGAATGCTATGGTAACCTGCAGTT
TGCTGGACGAGAGATACGTAGTAGGGTAATGGATAAGCTTGACCTGCAGTGTAGCAGATGCAAGCAAATGGGGATGGTTCATGAGTTCACTGGTAATTTC
AGTTGTACTCCCTCCGTTCCTAAATACTTGTCTTTCTAGGCATTTCAAATGACTATCACATACGGATGTATGTAGACATATTTTAGAGTGTAGATTCACT
CATTTTACTCCGTATGTAGTCATTTGTTGAAATGCCTGGAAAGACAAGTATTTAGGAACGGAGGGAGTAGTATACTACTAGGGTGTTGCTGTAGACATGT
CTAGTGTTTTAAGTTCATGTTGAAATATCCAAAACATCTTTATCATAATAGCGAACGAAGGGAGTACATTGCTACTTTACTAGCTGTCCAGTCCTTTGGC
TTGAGTTGATCGATGTGGTTCTCGTTCTCATGTTCCAAGGAAGTCAGAGATGCAGATATATGGTGGTTCATTTTCAGGGTAGGAATTCAGGTCCGACGAA
ACTGAAGCTTCAACCACTGCAAGCCTCAACAGGCGACGGCTATCCTACGGTCAGGTGAAAAACCCTCTACAGACAAGCTGCATCCCTTCACCGCTCCTGT
GTACTAGACGTTTATGCCTCTGTTCATTTTATTTAGGCACGCCGACAGTAAGTTTCGCGCACTAGATGCTACCACAGTGCAGCTGTATATTTCTTCAGCA
CAGATGCTTCTTTTAATCTTTGCTGCTAGTAATATACTGTATATTGTTGAACAAACATTGGCCTGCTTGTCGAGTGGGTATTGCTTGTCCACTACTCTAA
GCAAGCATGCTGGGCGCTGCTGAGTGGCAATGTCATGCGACTCTGGACTATTTAGCATAAGCAGCCCTTTGGTGGATGCTGCTTGATTGAATGGTTTTCC
ATGCTTATCATATATACTGTTAATTTCTCGATCTAGTATGCTGAGTATTGTCCCGGGCATGACCAGCGTTGCTTGCTTGTGTGAGCAGTCGGGTGTTTTT
TCCTTTCTAATAATCTTTATCTTGACGGTCAAGCGCATTGCCAATCGGGCGGCTGATGAGGCAGCTGATCTTGCGCTGGATCAGCTGGCTGAACATTTTA
ATACATGGCAAATAATTTTATCAAGCGTTCAAACATTCTTTTATACAGTATATTTCAAAAATGAACAAATATTTTAAAAACCACAATAATATATATTTTT
CCTGTTTTCCGGAGCTGGCA