Detailed information on CNT30220549


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30438383Hordeum vulgareAegilops tauschii22.5114.6879.681324forward

Expression of CNT30220549

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (88 aa)
RALASSLSLRSSRFGPRLRPSRLLASPRLFPSSFFLVPHLDSFRIAFDFCSAPRRLCFLCSQGIRPASGGSDPIDRSMGDSIDFASRV*

>peptide 2 (93 aa)
ALSPPPSLFGALVSGRASARVASSRLRDCFLPLSFSSLISIRFESPLIFAPLLAGFASCARRGFGPLPGVAIRSIDRWGIPSISLPASDSVRP*

>peptide 3 (77 aa)
MRRCMNLRTIRSFQLMAHPTTEIDSSFFLLHLATWPCLRYKFLLLPSFWLQIFSLAQAMWLMTQNLFNVLIRCFRHS*

>peptide 4 (85 aa)
MAVLFLWLNLLDLPYSIFIRTQQTLVFPALAIFSSCRSCLARDKNWNPCCLPDLHSGDRLTHPLPSHSSVLSFLILLVFPLLKHL*

>peptide 5 (98 aa)
MEWGSENLQTVFGLLTLLNLVSLFARSNLAYNISDINCWFSSYLTFGTSRKVPLGTSCYRRFLRLTSSFLIRFERYISKTWFSLPLVTMCPCRYCDER*

>peptide 6 (61 aa)
MKLQTSGTSYNQKKLKPLVLLFLFHSAICLLRLSRQFSALVDTDMEMIQLQFGTGVVVRQP*

>peptide 7 (64 aa)
MIKILFNSFFSTVSIILPRILIRIVCWLSRIWNYTGLAAAPILAQHGGSFSVAKPFGPSLFNIH*

>peptide 8 (32 aa)
MGIREFANCVWIIDPPQFSFFVCTVEFSLQHL*

>peptide 9 (31 aa)
MSSIQVFAPALLLVADFFFSPGHVANDAESV*

>peptide 10 (50 aa)
MNLPMVHEQYCEGDLRQVSFPCLVTLVSVTSDLSGYTFKFFDLSLSDGST*

>peptide 11 (47 aa)
PRSRLLPLSSELSFRAAPPPESPPRVSATVSFLFLSRPSSRFVSNRL*

>peptide 12 (43 aa)
MAVPISWLNFFELSYYSISLIRTHQTLVFPALVILSSCRLQGI*

>peptide 13 (43 aa)
MAQHEYCYPLIRGGFLLVLAVTADLACGMCLFSFRCRRAMVVE*

>peptide 14 (43 aa)
MLEVSNKGPEWKYQFILSLYSRLSNFDLAINYLVTILFQEVRL*

>peptide 15 (37 aa)
MNRKGGGLVSDMVRVYVWCWTEVLDRSSTWNLISMFR*

>peptide 16 (36 aa)
MVIFCFRLPVVADCLAQAMLVCCLQYMLELVDVPCI*

>peptide 17 (32 aa)
MQTFAVCISRCQVLRSVTVGSFCVGLHGLVAG*

>peptide 18 (30 aa)
MMSSFGPNQENARSLKQGSGMEISVHTQFV*

>peptide 19 (30 aa)
MYKIRRLLWSFNVDGTSYNRKNSVLSIFIS*

Sequence

>CNT30220549
CCGCGCTCTCGCCTCCTCCCTCTCTCTTCGGAGCTCTCGTTTCGGGCCGCGCCTCCGCCCGAGTCGCCTCCTCGCGTCTCCGCGACTGTTTCCTTCCTCT
TTCTTTCTCGTCCCTCATCTCGATTCGTTTCGAATCGCCTTTGATTTTTGCTCCGCTCCTCGCCGGCTTTGCTTCCTGTGCTCGCAGGGGATTCGGCCCG
CTTCCGGGGGTAGCGATCCGATCGATCGATCGATGGGGGATTCCATCGATTTCGCTTCCCGCGTCTGATTCCGTGCGACCCTAGGTCAGTTTCTCGAACT
CCATCGGTCGGGTCGGGTCGGGTCGGTTCCTTGGTTCCGTCGCCTGCCTGCGTCCCTCGGTGATTTCAGAAGATTTGGATTCAACGGCCGTCGCCCGTGC
GGTCTCCCGGTTCTAGGTTCCCGATCGAGTATGTATCAGTTAACACGAGGTCGATTCTTTGAGGCCCTCGTGGATTCTTACTACTTTACCAGCTGATCCC
GCTTTTGGTATGTGTGCTCTCATCTTGGATACACAAGCAAGATGGCGAGCGGTAGTTCTGAAGTGATGGTAGGTTATTTAGAAGGGCGGAGTTGAGGTTT
GATTTCTGTTCATGGTTATTTTGATTGATTGATTGGTTGATTGGCTACGGTTCAGCGGTTACTCTGTTATGGTCAGATATTCTCAGGGCGATCAATTGGA
TCTCAATCAACCTGCAACTTCGATCTGCACTTGGATAACAATATAAATCAAAACCTCCCAATTCATCTATTTGGTTTGCACAGCGCGCAACATATCTGAT
TTTGGTTCGTTGATTGTTGGTTCTCCAGAAATTGGGATTACACGGCTAAGCGGACCGGACCGGAGCGACCTATCTTTGGCTGATTTGCGTTTGGATGAAT
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TTACTTGGCCTAGTGGGAGCGGCTTACTATCTTCTTGCTGACCTGTGTTTGGATGACCCAACTCTGTTTTAATTTCTTCTTCTCCACTGTTCAATTATTC
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CTATTTCGTGGCTCAACTTTTTTGAACTTTCTTATTACTCAATATCATTAATTAGAACTCATCAGACATTAGTTTTCCCTGCCTTGGTCATTCTTAGCTC
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CTAGTTTTCTAATCCTAGTTTTCCCCTGACCGAAACATTTATAGAAAGGTACCTTGCTCGTTGCAGGTTTACGAACTCAAGGCCACCAACCTGATGCTAA
GTTTGCAGTTCTTCTAAAACCACTATCTACTCAATTCCTTAACTGAGATAATGTTAATAAGGTCTCTTACCAGGCAATATTTTTAATTCAGATTTAGCTG
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GCTATCCATCTCTTTGTTGTTTGATTGGTTATATTTGTACTCTTGATCCCTGTGTTGGTCTTCCTATACGTGTGTGGGTTGCACTGCAGGATATATTTAC
GAAGTCTGGGCCTACATATGCAAACCTTTGCTGTGTGCATTTCACGGTGTCAGGTACTCAGGTCAGTAACTGTTGGTTCATTTTGTGTTGGCCTCCATGG
GTTGGTTGCTGGATAGTATCTGATATGTCGAAGGGGTTTGAGGATTAAATGCATGTTGCCAGTGTGGTCTTCTAGATCTCATCATGAGTTCCATCATATA
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GCAGGAAGTGGTTCCTCAGAGATGAACCGAAAGGGTGGAGGTTTGGTTTCTGATATGGTCAGAGTCTATGTTTGGTGTTGGACTGAAGTTTTGGATCGCT
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ATTTGTTGCTGATTGTCAGAAATTGGGATTACTTGGCTTAGTGAGAACGACGTACTATCTTCTTGCTGACCGACCTGTGTTTGGATGATCAAAATTCTGT
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TGCTCCTATTTTGGCTCAGCATGGCGGTTCTTTTTCTGTGGCTAAACCTTTTGGACCTTCCTTATTCAATATTCATTAGAACTCAGCAGACACTAGTTTT
CCCTGCCTTAGCCATTTTTAGCTCTTGCAGATCGTGTCTTGCAAGGGATAAAAATTGGAACCCGTGTTGTCTACCTGACCTTCACAGTGGAGACAGACTT
ACTCATCCTTTACCTTCTCATTCGTCTGTACTTAGTTTTCTAATCCTACTAGTTTTCCCCTTACTGAAACATTTATAGAGATGTATTTTGCTCGTTGCAG
GTCATTGTTTACGAACTCAAGACCACCAACCTGATATTGAGTTTGCAGTTCTTCTATATCTAACATCTTCTTAAAATTCCTTGACTTAGATAATAAAAAT
AAGATCTCTTACTAGGTAATATTTCAAACTAAGATTTAGCTGCAAAGGTGAAATAATGAAGCTTCAAACTAGTGGCACATCCTACAACCAGAAAAAACTT
AAACCTCTTGTCCTCTTATTTCTATTTCATTCAGCTATATGTCTTCTCCGCCTTAGTCGGCAATTCTCAGCTCTTGTAGATACTGACATGGAAATGATAC
AACTGCAGTTTGGAACTGGTGTTGTCGTCCGTCAACCATAGCTGAACTTCCTAGCCGCCACATGCTTACTTGTTCCCAGCCCATCGTTTGATCCATGCTT
TAGCTATTTATATAAAAGTAACATTTTCCCCTAACTGAAAATTTATAGAAAGGCCTCTTGCTTGTTGCAGGTTGCAGTTGATGAACTTAAGTCCAACCTG
ATGATGAATTCGTTTGCAGATCTTCTAAATCTATGAGCATTGTTTCAATTCATCATAACTTACATAACCTACAAATTATCTTACTAGGCAATATTTTATA
ATACAGATATGCGAAGGTGCATGAATCTAAGGACAATCCGAAGCTTTCAACTAATGGCACATCCTACAACTGAAATAGACTCCTCCTTTTTTTTACTTCA
TTTAGCTACTTGGCCATGTCTTCGATACAAGTTTTTGCTCCTGCCCTCCTTCTGGTTGCAGATTTTTTCTTTAGCCCAGGCCATGTGGCTAATGACGCAG
AATCTGTTTAATGTTTTGATTCGGTGTTTTCGGCACTCTTGATCCCCGTGTTCTTTTGGTCTTCTCCGAGTGTGGGTTGCAGGATATAATAGTTTGGATT
TGGTGCCCCAACCTCTGTACATGGAGTCAGGTAAGTGTCTCGTAGACGGTCCTGTTTGTTTCATTTGTTCTCGGCCACCTCCGTGAGTTAGCTTGCAGGA
CTGGATCAGGTCTGGAAATGAACCTCCCTATGGTACATGAACAGTATTGTGAAGGGGACTTGAGGCAGGTCAGTTTCCCATGTTTGGTCACACTGGTCTC
GGTGACATCAGATTTGAGTGGCTATACCTTTAAGTTCTTCGATTTATCTTTGTCTGATGGCTCAACATGAGTACTGCTATCCCTTAATACGAGGTGGATT
CTTGTTGGTTCTCGCTGTAACAGCTGATCTCGCTTGTGGTATGTGTTTGTTCTCCTTCAGATGTAGGAGGGCGATGGTTGTGGAGTGATGAATCGAAGGG
TGGAGGTTTGCTTTACTGTTTGTGGTTATTTTGATTGGTTATGGCTCAATGCCTTATGAGAAGCCAGGATCTTGTGTGCTGAAGTTTTCGTTTCGGATTG
AAGTTGGATTGGATCGTTAACCATGGAATGGGGATCAGAGAATTTGCAAACTGTGTTTGGATTATTGACCCTCCTCAATTTAGTTTCTTTGTTTGCACGG
TCGAATTTAGCTTACAACATCTCTGATATCAACTGTTGGTTCTCCAGCTATTTGACTTTTGGGACTTCCCGGAAGGTGCCTCTTGGTACATCATGTTACA
GGCGGTTTCTTAGATTGACTTCATCTTTCCTGATTCGCTTTGAACGTTATATTTCTAAGACATGGTTTTCTCTTCCCTTGGTAACCATGTGTCCTTGCAG
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TGATGCATTATTTAGCTGTTTAAGAAGCTTCGTTTCCCCAAAGCAAAAATTCACAGGAAGGTCTCCTGTCATTGCAGATCCTAATTGATGATTTAGGCCC
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GACAAAATTTGAATATTCAGATTGATTTGGTGGATGTACAAGATTCGAAGGTTGCTCTGGAGCTTCAATGTAGATGGGACATCCTACAACCGAAAAAACT
CAGTGCTCTCTATTTTTATCTCCTGAAGAAACTTCTGTTGTCTAAGTTCCTTTTCGCATGTAGCATTGATGGTGATTTTTTGCTTCCGCCTTCCTGTAGT
TGCAGATTGTTTAGCGCAAGCCATGCTGGTTTGTTGTTTGCAGTATATGTTGGAATTAGTGGATGTTCCCTGTATTTAGAGTCAGTACAAGGTGAATTTT
ATCTCATTCATGGTATATGCGCCTTTAGAGACAAACCAGCGGAGATTGTATTGGCTGTTCCCTTTAGCTCATCAGATGATATCTTAAGTTCAGGATCGGA
GTTGTTGGTCAGGCCTGCACGGTTGAGGATTCAAATGTGTCTCGAAGCGTGACTGAACTGTCTGGATATATTCTCCTCCTATTTGATATCTCCATTGGTG
GAAGTTTTATTGCAAGATTGTAGAGTTGGAAATTCGGCTAGTGCGGGGACTTGCTGAAGCTATCAAATTGGTTTGGACTTCTGATTAGTGATACTGAAGC
ATATTACGTTATTTGGTCTTTGTGGTAGTTTTCAATTTGAACTTGCACTCGGTGGCCTCATCTCTTTGGCGCAGCTTGGAGTTGGTAGTGTGCACATCTG
ATTCTTTCAACTGTCATGAAGCATCTTACTTGGTTTCTGTTGTGTGACATCTTGCTGATTATGGTATCTGCTTCAACTTGCATGTGGTTTTGATGGAATA
TGATGTCATCTTTTGGTCCGAATCAAGAAAATGCTAGAAGTCTCAAACAAGGGTCCGGAATGGAAATATCAGTTCATACTCAGTTTGTATAGCAGATTAT
CAAATTTTGATTTGGCTATAAATTACTTGGTTACCATACTGTTTCAGGAAGTTAGGCTTTGACATTTGGCTGCTTGTATCTT