Detailed information on CNT30633047


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30492211Capsicum annuumOlea europaea14.8241.4489.55201forward
CNT30286056Capsicum annuumTriticum aestivum7.9649.7786.11108forward
CNT30220912Capsicum annuumHordeum vulgare7.9620.6186.11108reverse complement
CNT30116403Capsicum annuumOryza nivara9.4456.6483.59128forward

Expression of CNT30633047

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (33 aa)
MCENFRAYLRRCSFHGVLKPFSVSPPLKLSFKT*

>peptide 2 (32 aa)
MSFDFEEYFFKVRFNYIILMFLLSYYFVVVYS*

>peptide 3 (90 aa)
MKLLIITGFIADPMQLVFEYSTRYNQNSHWLQVSHSKENHFQPHVQKVKLLHPFADNFQIQGVIADPFSFLSDSRLGKTTKEKIYSISKK*

>peptide 4 (58 aa)
MREGFEPSIVLCSKLYRFSRSGLSTTQPSLRKTIFILFLQIEHGYRGGYPHYLQKDLR*

>peptide 5 (34 aa)
MSISFEEILGVKVRFNCIALMFLLLYCFVIIYRW*

Sequence

>CNT30633047
CTCTTGTTTCCTTTTCATCTTCTCCGACTAGATGTGTGAGAACTTCAGAGCTTATCTCCGTAGATGTAGTTTTCATGGCGTCCTAAAACCATTCTCTGTT
TCTCCACCACTCAAGCTAAGTTTCAAAACTTAATCATCCTTCTTTTCTTTCCTAGCTCGATGGATTGAGCTTCTTTAAAAACTAATACCACCATCCCTAC
TAGAAAATAAAGTTTAATAGATAAAGATTTAAATACTTTGTTAGTGTAAAAATGAAATTGCTAATCATTACGGGATTTATTGCAGATCCGATGCAGCTGG
TGTTTGAGTATTCAACCCGTTACAACCAAAATTCTCACTGGCTGCAAGTATCCCACTCAAAAGAAAATCACTTCCAACCCCATGTTCAAAAAGTGAAGCT
TCTCCATCCATTTGCAGACAACTTCCAGATTCAAGGTGTGATAGCCGATCCATTCTCCTTTCTTTCGGATAGCAGATTGGGCAAAACAACTAAAGAAAAA
ATCTATTCAATTAGCAAAAAATGAGAGAGGGATTCGAACCTTCGATAGTTCTTTGTTCAAAACTATACCGGTTTTCAAGATCGGGGCTATCAACTACTCA
GCCATCTCTCCGAAAGACTATTTTTATTTTATTCCTCCAAATAGAACATGGCTATAGGGGTGGATACCCCCACTATCTGCAGAAAGATCTCAGGTGATAG
ATGAACGTTGGTCGGCTTCAAGAATTTTTTTTTAGGTAAAGATTAGGTTTAATTATATTGTTTTAATATTTCTATTAGTGTATTATTTTGTGTTAGTTTA
CAAGTTGTAGATGAATGTCGATCAGCTTTGAGGAAATTTTGGGTGTAAAAGTTAGATTTAATTGTATTGCTTTGATGTTTCTTTTATTGTATTGTTTTGT
AATAATTTATAGGTGGTAGATAAATGTTGGTCGGCTTTGAGAAATTTTTGAGGTAAAAGTCAAGTTTAATTATATTGTTTTGATATTTCAACTGTGAGAA
TTTTTTTGTGTAAAGGTTGGGTTTAGTTGTATTATTTCGATATCTCTATTATCGTGTTATTTTGTTATAATTTACAGGTGGTAGATGTATGTCGTTTGAC
TTTGAGGAATATTTTTTTAAGGTTAGATTTAATTATATTATTTTGATGTTTCTATTATCGTATTATTTTGTTGTAGTTTACAGCTGACAGATGAATGTCA
AGAGAATTTTTTTTGGTGAATGTTAGGTTTAATTAAATAAATTCTCTACCTTTATATATTCAAAAGATGTTGAATTGAATTATTGTATTCATTTTTATTA
TTTAAACAAATGTCATATTTAATGTAATGTTTGAACTGATTAAATTAAGGTACACG