Detailed information on CNT30554585


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT005704, E-value = 4e-86

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30596779Oryza glaberrimaOryza meridionalis8.410098.6358reverse complement
CNT30105381Oryza glaberrimaOryza longistaminata8.8948.998.94379forward
CNT30102896Oryza glaberrimaOryza rufipogon4.8195.7999.51205forward
CNT30577470Oryza glaberrimaOryza barthii24.9454.5199.911063forward
CNT30117360Oryza glaberrimaOryza nivara35.9683.6399.541533forward

Expression of CNT30554585

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (54 aa)
MGAKVPLYDKYFAVIQTILLFFFVFFNCTLFLNNSIESSLKCPIVTCNWQGLRL*

>peptide 2 (53 aa)
MLVIVKKVLECYQISYGYCQYFGSNPNQSNYYLNCQTIGRAHFGIDPKWPILD*

>peptide 3 (72 aa)
MIPTKSGWISRNFDIPTRFESRNRLRFREVSSKFKFELIKKREKQIKSYKYYDIHRTYWDINIKKKCIVCIY*

>peptide 4 (60 aa)
MISIGLSPKPTGFQELVNKLREFVFKFWFMKFVRNIPVFHRISRNSEFRQCPKWKGLSES*

>peptide 5 (49 aa)
MIERDVWICKYFYASGQILSEHKASQPAMAMTRWFYPYFPTCHVRLGWA*

>peptide 6 (46 aa)
MHFFFYKCKNLQVDTYLAGEFVSYGHIFHWKICPYVGAISPVLSLE*

>peptide 7 (29 aa)
MTGPFVSGTGGIQNFAKSGGKPVNSEQIS*

>peptide 8 (31 aa)
MRWLKIIPMIFLQVMQLLPQACCLLLPKLVK*

>peptide 9 (37 aa)
MYCVYLLKLTSGKKKKIKKLKKKKNTYMGRIACTRPS*

>peptide 10 (95 aa)
MIHLQQALIYHHDESEESDCQVTPSTIYSPPKTATTVCCFLRILSYLYGEKAVTMLKDGFEGTTRHASSYNRAVTRIQASKTLGRLSFRRCQHNA*

>peptide 11 (74 aa)
MNIIVFIGFYLFFSFFINSNLNLDQSPRNLRRFLLSSLVGMSKFCEIRFYFVGIVNPGDSNNLRLRSTYPIQQL*

>peptide 12 (95 aa)
DKLVVVVPCGAAPATRRAMPPLLRPPDLGFYWSRRAQRPADHGRGRGDQICNWGQQARGGNCIICKKLWNPLSVIIAIKKPPHEATSSSFHTDGP*

>peptide 13 (35 aa)
MRTILFKLSCWVLVFTCYFQLFHKSIQKYSHFSME*

>peptide 14 (32 aa)
MMSQKNPIVKLRLLPYTPHQKQLPLFVVFYES*

>peptide 15 (33 aa)
MLHNSNCNELRKKGHWNVLVLYPTNSMVVPKSR*

Sequence

>CNT30554585
GATAAACTCGTTGTCGTCGTCCCGTGCGGTGCGGCCCCCGCTACCCGCCGCGCGATGCCCCCTCTTCTCCGCCCGCCTGATCTAGGGTTTTACTGGAGCC
GCCGCGCGCAGCGACCAGCCGACCACGGACGAGGACGAGGGGATCAGATATGCAATTGGGGGCAGCAAGCTAGAGGTGGCAACTGCATAATTTGCAAGAA
ATTATGGAACCCACTTAGCGTGATTATTGCTATAAAGAAGCCACCACATGAAGCGACATCGTCAAGTTTTCACACAGATGGTCCCTAAATGCGTTGGCTG
AAGATCATACCGATGATATTCTTGCAAGTTATGCAGTTGCTGCCTCAAGCTTGCTGCCTCCTGTTGCCAAAGCTAGTAAAATGAAAACATTAAATTAGTA
TAGCTGGACGGTTTTTCTTGCAGCCTTATGTTCTTCTCTTCAGCTCATGAATTTCTATTTATCATAGGTAGAAAGTGGCAACAACATTAGTATGAGCTTT
CCAGTCAAAAAAAAAAACATTAGTATGAGCTAGCAACACTTTTGAGTTTACATGTTCTGAAAATGCATAAGGATTTCAGATTAGTGAAATTAAGTATTCT
CTAGTCAAATATATTAGACGTTGGGAGGACAAAACTTAGCTCTCCCAACATCAATTATATTTGACTGGAGGGAGTATTTGGGTTTTTATTTTTTAAATTT
CTGGTGGTACATGTTTGAATCGTCAAACCGGTAGTTGTTCCTTTGACATCATTTGTCATCCTTCTTTAATTAACTAGAATATTCATCTTATGAACTACTC
TGATAATATTCTTCTTAATTACATCAATTTTTTTCTTTTCCATCTTTTGTGATGAGAACCAGGGTTTATGATTCCGACGAAATCCGGTTGGATTTCGCGA
AATTTCGATATTCCGACGAGGTTCGAAAGTAGAAACCGTCTGAGATTTCGAGAAGTTTCATCCAAATTCAAATTTGAATTGATAAAAAAAAGAGAAAAAC
AAATAAAATCTTATAAATACTATGATATTCATAGAACCTATTGGGATATAAATATTAAAAAAAAATGTATTGTGTGTATTTACTGAAACTTACATCAGGA
AAGAAAAAAAAAATAAAGAAATTAAAAAAAAAGAAAAACACTTACATGGGCCGGATTGCATGTACTAGGCCTAGTTAGTAGTTGGTCCAAATTACAGATT
ACAGATCGAAATTTCGATGATTTCGATCGGACTTTCGCCAAAACCGACCGGTTTTCAAGAACTTGTTAACAAACTCAGGGAATTTGTATTCAAATTTTGG
TTTATGAAATTTGTTCGGAATATACCGGTTTTCCACCGGATTTCGCGAAATTCCGAATTCCGCCAGTGCCCGAAATGGAAGGGCTTGTCGGAATCGTAAA
TCGTAAACCCTGATGAGAACTATTCTTTTCAAGCTTTCTTGTTGGGTGCTTGTATTCACTTGCTATTTTCAGCTGTTTCACAAAAGCATACAAAAATACT
CCCACTTCTCTATGGAATGAATTAAGATGATAGAACACGGAAATCTTTGCACAGTAAATTAAATAAAACATTGAGTGGGGGTTGAAGTAGCAGAAAACCC
CCCGTGTTATGGCTTGTGAATTGTTGGCCTTGTGGCCATAATCTTCGATTTTATGGTTAAAGTTTTGACAAAACCCTAATCCATCCAAACCCTAAGTCTC
ATGGGGGCCAAGGTACCACTTTATGATAAATATTTTGCAGTGATCCAAACCATCCTTTTGTTTTTCTTTGTTTTTTTTAATTGTACATTGTTTCTTAATA
ATAGTATAGAATCAAGTTTAAAATGTCCAATAGTAACTTGTAATTGGCAGGGTTTACGATTATGACAGGCCCTTTCGTTTCGGGCACTGGCGGAATTCAG
AATTTCGCGAAATCAGGTGGAAAACCGGTAAATTCCGAACAAATTTCATAAACTAAAATTTGAATACAAATTCCCTGAGTTTGTTGACAAGTTCTCGAAA
ACCGGTCGGTTTTGGCGAAATTCCGGTCGAAATCATCGAAATTTCGATCTGTAATCTGTAATTTGGACCAACTACTAACTGGGCCTAGTACATGCAATCT
GGCCCATTTAAGTGTTTTCCTTTTTTTAATTCTTTATTCTTTTCTTTCCTGATGTAAGTTTAAGTAAATACACACAATACATCATTTTTTTTTGAATATT
TATATCCCAATAGGTTCTATGAATATCATAGTATTTATAGGATTTTATTTGTTTTTTTCTTTTTTTATCAATTCAAATTTGAATTTGGATCAAAGTCCTC
GAAATCTCAGACGGTTTCTACTTTCGAGCCTCGTCGGAATGTCGAAATTTTGTGAAATCCGATTTTATTTCGTTGGAATCGTAAACCCTGGTGATAGTAA
CAATCTTAGGTTGAGATCAACATATCCAATCCAACAATTGTAACCTACTTGGTACATATGCTCCATAACAGTAACTGCAATGAGTTAAGAAAAAAAGGTC
ACTGGAACGTGTTGGTTCTCTACCCTACCAATTCAATGGTAGTGCCAAAATCTAGGTAAATTTTGACACTACCAATTATTTGGTAGGGTAGAATTCATAT
AATGTGTTTGGTTTGCTACCATTTGCTACCAATATGCTTGTTATAGTGAAGAAAGTTCTAGAATGCTACCAAATTAGCTATGGGTATTGCCAATACTTTG
GCTCTAATCCAAACCAATCAAACTACTATTTGAACTGCCAAACAATTGGTAGGGCACATTTTGGCATCGATCCAAAATGGCCCATTTTGGATTGAAGCCA
AAACATGACCTTACCAATCTATTGGTATCTTGAAGATATTGTATGGTTGGATTAAAGCCAAATCATTGGTAATGCCCATTAACAATTTGGCACTAATCTA
GAACTTTCTTCTCTATATCATCAATATTTGGCTTTATATTGGTAGCAATTCAAATATGTACCATGCATCTCTACCCTACCAAAGAATTGGTAGTGCCAAA
ACATGCCAAAAATTTGGCACTAGCAAAGATTTGGTAGGGTAAAGAACCAAACAGCTTTTGTTTCAGTCAGAAAGTTAAGTGGGGCAAAAAGATTGCCCAA
AATATTATGAAATACCTCTCGATATACCTTTGATTTCACAATATGTTGTATTAATTTATGTTTTACAGGCATACAACAGATCCAACTTTCAATGACATGT
TTATTGTTTAGTTTAGCTACAATAATTGTTGGGTAGTTGTAGAGCAGCACATGGTACATATGCCACAAGCCCGCAAATAAAATAATTCGCATTTGCTCAT
CCTAATTCATGCTAGCATCTCTATTGCAGAACAATTTTGATACTATTTTTTTTTTTAAAATTAGCCTTGAAAATGCCACTTCCCCTAAGGAATGACAAAT
GCATTTTTTTTTTTACAAATGCAAAAACTTGCAGGTAGACACATATTTGGCAGGTGAATTCGTGTCATATGGACATATCTTTCATTGGAAGATATGTCCA
TATGTTGGAGCTATTTCACCAGTTCTTTCATTGGAATAATGTTAGCATTTAATCAGTGATATAGGAGATGATTCACCTTCAACAAGCTCTCATTTATCAT
CATGATGAGTCAGAAGAATCCGATTGTCAAGTTACGCCTTCTACCATATACTCCCCACCAAAAACAGCTACCACTGTTTGTTGTTTTCTACGAATCTTGA
GCTATTTGTATGGAGAAAAAGCAGTGACAATGCTAAAAGATGGTTTTGAAGGCACTACAAGACATGCCTCAAGTTATAACCGTGCTGTTACGAGGATCCA
AGCATCCAAAACACTTGGAAGATTAAGCTTCAGGCGTTGTCAACATAATGCATAATTAGTTGCATACTTGCGTTGTAAGTTGTAACAGGGAGCTTTGCTC
CAGTAACTCAGTATCATTGTCCAATAAATCTCACTTAGAAGTTAGAATGTGCATTAGGTGTGTGGTCGACTCAGCACTTAACATGATGTAATCAGTTGGA
ACTCAATTCAGTACCTGTTCCTATTAAATTGATTTATTAAACGTTTGTTCATGCATTTGTTACAAAACTGAGTAATTTTTGTGCTCCCAAAATACATTCA
GTGGATGATTGAACGGGATGTTTGGATATGCAAATATTTCTATGCATCTGGACAAATACTTTCTGAACACAAAGCAAGCCAACCTGCCATGGCCATGACA
CGATGGTTCTATCCATATTTTCCTACTTGTCATGTACGGCTGGGCTGGGCCTAGCACCAAAAC