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Detailed information on CNT30687187


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30292299Triticum urartuTriticum aestivum24.2178.3695.98373forward
CNT30384453Triticum urartuTriticum turgidum100.0651.2696.31542forward

Expression of CNT30687187

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (54 aa)
NGNTSRNLAYPSFKSPSGRVLCSRESPSRHACCFTRMMHCSLAVDCLCRLTVSS*

>peptide 2 (47 aa)
MLVSDTVILMLIYVPSFVCFESISIHLITDHGELDPNKQDTYINLAL*

>peptide 3 (76 aa)
MYIWNSCKGIRTREIYMYGYLGYWKYQLYNHLVNYYTSYRFCSVLISLGRVAYLHTFIDSLVADYFRASSTCLKQL*

>peptide 4 (37 aa)
AMATQAGTSPTPRLSPQVVGFSVHGSHHLGMLAASPE*

>peptide 5 (36 aa)
MDALFCFFSLLQNIYVVYLISYVVKECLSLILLFLC*

>peptide 6 (34 aa)
MFFLATYPKPLNSFYLNLLVMFWSLQFLNQYLSD*

Sequence

>CNT30687187
GCAATGGCAACACAAGCAGGAACCTCGCCTACCCCTCGTTTAAGTCCCCAAGTGGTAGGGTTCTCTGTTCACGGGAGTCACCATCTAGGCATGCTTGCTG
CTTCACCAGAATGATGCATTGTTCTTTAGCTGTTGATTGTCTATGTAGATTGACTGTATCGAGTTGAGGGCTTGAGGCAGGCTGTAGGTGATTAGAACAT
CCACCTGTTAAGTAAGATCGGCTATAGTGTATGCTCTGGACATAAGCTTGTGCTGCTGCCAGTGTAGTGTATGCTCTGAACACAAGATCCTTTACTTGCT
CTGGTTTGGTTAAGACTGATGATGTCGTGGATAAGAAAACAATTTAAAAAGGTCTGTTGAAAAAAGGTGGAAGCATGTTCTTTCTTGCAACGTACCCTAA
ACCCCTAAACTCTTTTTATTTGAACTTGTTAGTTATGTTCTGGAGTCTGCAATTTTTGAATCAATATCTATCTGATTAATGGATGCCTTGTTTTGTTTTT
TTAGTTTGTTGCAAAACATATATGTGGTGTATCTGATTAGTTATGTTGTAAAAGAATGCTTGTCTCTGATACTGTTATTCTTATGTTGATATATGTGCCC
AGTTTTGTGTGTTTTGAATCAATATCTATCCATTTAATTACTGACCATGGTGAGCTAGATCCAAACAAACAAGACACTTACATTAACTTGGCACTTTGAG
TCCTTGTAATTCTGATAGTGTGGAACTATATTTTGTACACATAGTCAACTAGTTTTCATTTTATATTTGCTTGCTTATGTGGAACTATATTTTCTCATTT
TTCTAATTATGACATGGATGATATGAAATATCAGAATTGTTTCTGTTACATGGTGTGCTGCAGGAAAGCCCCTGTGTAGGTTTATTATCTCGTAATTGGG
CAATTATTTTCTTGCAGGGGGCCACCCGTTCGAGCTCGCTTTGACCCTCTTTTGCTCTGTAGTGGTCCTGGTACATGAAAAGAAAGTCCTTTTAAATGTT
TTGCTTCCTTGGTTGCATTCTGCTGTACACTCAAAAATATTTTCAATTTAGTGACAAGCAAACAATAAAATAGTCAAAAGGCTTTTATTTAATGTGCTTT
TCGAAAATGAAAATGTGTTGTGATGTTCTCCTCTTTCTGTTGACATGTATGTTGAGTAATATCAAGCCATAATTATAGTCCCTCCAAGACATGCTCAAAT
GTAGTCGCACGTACAGATTTGTGTGGCTGAGGTACAGTTTTAAGATGAGATATGTATATATGGAACTCATGTAAGGGAATTAGAACTAGAGAAATATATA
TGTATGGGTACCTCGGCTATTGGAAATACCAACTATACAATCATCTTGTTAATTACTACACATCATATAGATTCTGTAGTGTATTAATCTCACTGGGTAG
AGTGGCCTACTTGCACACTTTTATTGACTCGTTGGTTGCTGATTACTTTCGAGCGAGTAGCACATGTCTCAAGCAACTGTAGTATTCCTTTCCCTGAATT
GCTCCCTTGTTTTGCTGTGGCCGTATGCTCCATGGTCAATG