Detailed information on CNT30384453


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30181605Triticum turgidumSecale cereale6.7577.4882.76203forward
CNT30687187Triticum turgidumTriticum urartu51.26100.0696.31542forward

Expression of CNT30384453

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (70 aa)
MYCLSCLSINIYFSFSNGNTSRNLGYSSFKSPSGRVLCSRESPSRHACCFTRMLHCSLAVDCLCRLTVSS*

>peptide 2 (93 aa)
MLLSFIMQARPDAPLALGTQCQAGCGCPEPQGRPCYSSCSCPGHAQLRSWSVAAVMFIDDLHLYQCIMLLFGNSVSHCMWILNLYSKLTYLHM*

>peptide 3 (56 aa)
MMYCILLYLRRLVEFGPGHSGIWLLFEINLSEPLESVQGWICPFIVQRIFYLPLVY*

>peptide 4 (66 aa)
MPGRLWMPRTSRPAMLLQLLLPRPCSTSLLVSCRSDVHRRPALVPMYHAAIWQFSFTLHVDLKLIQ*

>peptide 5 (43 aa)
MLPSLWAPNARQAVDAPNLKAGHATPAAPAPAMLNFAPGQLPQ*

>peptide 6 (41 aa)
MATQAGTSATPRLSPQVVGFSVHGSRHLGMLAASPECCIVL*

>peptide 7 (51 aa)
MLHHVLVLVYLFLLVSTLVCACVSCLCICFCLFKLMLDVQTCMCCCVYLAK*

>peptide 8 (47 aa)
MLVSDTVILMLIYVPSFVCFESISVRLITDHGELDPNKQDTYIDLAL*

>peptide 9 (38 aa)
MSQATIVFLSLNCSLVLLWPYAPWSMMRVVYILKPKLE*

>peptide 10 (34 aa)
MLFLATYPKPLNPFYLNLLVMFWSLEFLNQYLSD*

>peptide 11 (41 aa)
MLTKCYVGLPPHVDGIISKHLIMFLFGHQDQDLMLFRLLLL*

>peptide 12 (40 aa)
MRTTVLVDVAPCFGACVSVFACKYTCMCLCIVLVYLFLLV*

>peptide 13 (34 aa)
MPCFVFSLLQNIYVVYLISYVVEECLSLTLLFLC*

>peptide 14 (29 aa)
MTSSSGLHAILVVNADRPFAVVFRVDCVC*

Sequence

>CNT30384453
ATCTAACTAGCCAGTCGACAGGCTAAAACAACTAGCTATAAAATGACATCAAGTTCTGGTTTACATGCTATTCTCGTCGTTAATGCCGACAGACCTTTTG
CTGTAGTGTTTAGAGTAGATTGTGTCTGCTAGCCCTCCTTTTTGTTTTTGTTCTTATTTTGGACAGATGCTTGGGGGTGCATACTTTCTAGAATCAGCAT
TTGGATTTGCAGTTCGTGTTGTCAAAGAAAATTGTCGATTGTTTGATTGATGTTCTGACTTTTATGTGGACCAGTCGTCCATTCTCTAAATCATTCTTTT
AATCCTGCTACCCTTTTTGTATCCATGTACTGTTTATCTTGTTTAAGCATTAATATATACTTTTCTTTCAGCAATGGCAACACAAGCAGGAACCTCGGCT
ACTCCTCGTTTAAGTCCCCAAGTGGTAGGGTTCTCTGTTCACGGGAGTCGCCATCTAGGCATGCTTGCTGCTTCACCAGAATGCTGCATTGTTCTTTAGC
TGTCGATTGTCTGTGTAGATTGACTGTATCGAGTTGAGGGCTTGAGGCAGGCTGTAGGTGATTAGAACAACCACCTGTTAAGTAAGATCGACTGTAGTGT
ATGCTTTGAACATAAGCTTGTGCTGCTGCCAGTGTAGTGTATGCTCTGAACACAAGATCCTTTACTTGCTCTGGTTTGGTTAAGACTTATGATGCCGTGG
ATAAGAAAACAATTTAAAAGGTCTGTTGAAACAAGGTGGAAGCATGCTCTTTCTTGCAACGTACCCTAAACCCCTAAACCCTTTTTATTTGAACTTGTTA
GTTATGTTCTGGAGTCTGGAATTTTTGAATCAATATCTATCTGATTAGTGCATGCCTTGTTTTGTTTTTAGTTTGTTGCAAAACATATATGTGGTGTATC
TGATTAGTTATGTTGTAGAAGAATGCTTGTCTCTGACACTGTTATTCTTATGTTGATATATGTGCCCAGTTTTGTGTGTTTTGAATCAATATCTGTCCGA
TTAATTACTGACCATGGTGAGCTAGATCCAAACAAACAAGACACTTACATTGACTTGGCACTTTGAGTCCTTGTAATTCTGATAGTGTGGAACTATATTT
TGTACACATAGTCAACTAGTTTTCGTTTTATATTTGCTTGCTTATGTGGAACTATATTTTCTCATTTTTCTAATTATGACATGGATGATATGAAATATCA
GAATTGTTTCTGTTACATGGTGTGCTGCAGGAAAGCCCCTGTTTAGGTTTATTGTCTCGTAATTGGGCAATTATTTTTTTGCAGGGGGCCACCCGTTCTA
GCTCGCTTTGACCCTCTTTTGCTCTGTAGTGGTCATGGTACATGAAAAGCAGGTCCTTTTAAATGTTTTGCTTCCTTGGTTGCATTCTGCTGTACACTGA
AAAATATTTTCAATTTAGTGACAACCAAACAATAAAATAGTCAAAAGGCTTTTATTTAATGTGCTTTTCAAAAATGAAAATGTGCTATGATGTTCTCCTC
TTTCTGTTGACATGTATGTTGAGTAATATCAAGCCATAATTATAGTCCCTCCAAGACATACTCAAATGTAGTCGCACGTACAGATTTGTGTGGCTGAGGT
ACAGTTTTAAGATGAGATACGTATATGCGGAACTCATGTAAGGGAATTAGAACTAGAGAAATATATATGTACGGGTACCTCGGCTATTGGAAATACCAAC
TATAAAATCATCTTGTTAATTACTACACATCATATAGATTTTGTAGTGTATTAATCTCACTGGGAAGAGTGGCCTACTTATACACTTTTATTGACTTCGT
TGGTTGCTGATTACTTTCGACCGAATAGCACATGTCTCAAGCAACTATAGTATTTCTTTCCCTGAATTGCTCCCTTGTTTTGCTGTGGCCGTATGCTCCG
TGGTCAATGATGCGTGTTGTATACATATTAAAACCGAAATTGGAGTAGTTTCAGTCGTGCATATTAGAACTGAATTATGCTCTGTTTTGTTGTAGTTGTA
TGCTCTTATTGCTGAATTGTTTAGTGGGTTGTACAAACTAAACTCGTCCAGTCAGTTTGCTATGATGTATTGTATATTATTGTACTTAAGACGTCTTGTA
GAATTTGGGCCTGGGCACTCTGGAATTTGGTTGTTGTTTGAGATTAATCTTTCTGAGCCATTAGAGTCAGTTCAAGGATGGATCTGCCCATTCATTGTGC
AGAGGATCTTCTATTTACCACTTGTCTACTAATATATTAGTTATCATTAGCTACATGCTCCCTTCTCTGCAAAGTAAAGACTAAAGAGGTTCCTTAACTT
CATAGTCAAGTTATGACAGAAGTTTGATATTCCTTTTGCTACCACATGTCCTTTAGTCTTTAACTTTCTGATGCTGCTTTCCTTCATCATGCAGGCACGC
CCCGATGCTCCCCTCGCTTTGGGCACCCAATGCCAGGCAGGCTGTGGATGCCCCGAACCTCAAGGCCGGCCATGCTACTCCAGCTGCTCCTGCCCCGGCC
ATGCTCAACTTCGCTCCTGGTCAGTTGCCGCAGTGATGTTCATCGACGACCTGCACTTGTACCAATGTATCATGCTGCTATTTGGCAATTCAGTTTCACA
TTGCATGTGGATCTTAAACTTATACAGTAAGCTTACTTATTTGCATATGTAAAATATGTTGACAAAGTGTTATGTTGGATTACCGCCTCATGTTGATGGC
ATTATCTCTAAACATTTAATAATGTTTCTTTTTGGTCATCAGGATCAAGATCTAATGTTGTTTAGGCTGCTTCTACTGTGACGGAAGACCAGAAGAGGCA
TTGAGATGCGCACCACAGTTTTAGTTGATGTTGCACCATGTTTTGGTGCTTGTGTATCTGTTTTTGCTTGTAAGTACACTTGTATGTGCTTGTGTATCGT
GCTTGTGTATCTGTTTTTGCTTGTTTAAGTTGATGTTGGATGTGCAGACTTGTATGTGCTGTTGTGTGTATTTGGCTAAATGATTCTGAATTTAATCGTT
TAATCAAG