Detailed information on CNT30395992


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30223326Triticum turgidumHordeum vulgare6.7446.4487.1124forward
CNT30258796Triticum turgidumAvena sativa7.2330.8687.97133reverse complement

Expression of CNT30395992

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (33 aa)
MLQVNIPNHWTALLIVGYVATIQFRSMQLLSVF*

>peptide 2 (38 aa)
MQDLYPHDFGFLVGRVDVESLVAWHGKSMYSVTCPASI*

>peptide 3 (29 aa)
MTPTRSFHLRHGFFVFNPFVSSVINWNFS*

>peptide 4 (30 aa)
MYISGKLLYFLISDAARKLLLFHDCSLLAY*

>peptide 5 (40 aa)
MLLYFFTEGVRNTLFFSKKIVTVILLMNEEMRSCCYTNVN*

>peptide 6 (40 aa)
LDSLFILVLLFFITVYSCVIFPSFHGFFGQEFVLYFFIFT*

>peptide 7 (58 aa)
MLLESCSFFMIVPSWLTDIFSNFVVPMCSSVRSLKTLVCIISFFPHAMQSNLCEPKTL*

>peptide 8 (51 aa)
SGLPFYFSSFIFYYSLFLCHFSFFPWILWSRICLVFFYFYLIECVCDERRN*

>peptide 9 (60 aa)
MPCNLTFVNRKLSSRRGQLALGAVMEKNYPGGHYQLEGSRLSGFFFEMVQGVRLVMRNNL*

>peptide 10 (58 aa)
MFSPRTLSRKLQIRTHSLMSMPVILFGRLNSVSQLSLYGFLPVQFLQYNVFRILSDLL*

Sequence

>CNT30395992
ATCTGGACTCCCTTTTTATTTTAGTTCTTTTATTTTTTATTACAGTCTATTCTTGTGTCATTTTTCCTTCTTTCCATGGATTCTTTGGTCAAGAATTTGT
CTTGTATTTTTTTATTTTTACTTGATTGAATGTGTATGCGATGAAAGAAGAAATTGAATTAGACTACTTCCTTACTATTTCAATTTACTAATCTGTTCTA
TGTAGATTTGAAGATAATACAATCTAGCACACTTTATGACTCCAACCAGATCCTTTCATTTAAGACATGGTTTTTTTGTATTTAATCCCTTCGTTTCTTC
AGTGATTAATTGGAATTTCAGTTAATCATTTTGGCTGACTACTTTTACATAAGGATGTTGCAAGTTAACATACCCAATCACTGGACTGCATTATTAATTG
TTGGTTATGTTGCTACTATTCAGTTTAGAAGTATGCAGTTATTATCAGTATTTTAGGTGAATACCTCCTGTAAACTGAGTCAGTGGGCTATGCAAATTTT
ATACTCTCACTGTAGAAGATTGATTGGTTTCTAGATTAGTTTTTATGTTCTCCCCCAGAACACTATCTAGAAAATTACAAATACGAACGCACTCACTAAT
GTCCATGCCTGTAATTCTGTTTGGAAGATTAAATTCGGTTAGCCAACTTTCTTTGTATGGATTTCTACCAGTTCAATTTCTACAATATAATGTTTTCAGA
ATTTTGTCCGACTTGCTCTAAGAATATGAAACACAAATAATTGTCTCCTCGGATTGGTTAAGCTAGCTAACTTAGTTTTTTCCCCATTGTTTTGTTGATT
TAATACCGTTTTTACATTCATGTCGGTTTTTTTGGACACAATTAAGTCAAGGAATTTTCTGTTTCCTTGAAACCGGTTTTTTTGGATTTTTTTTCATGTA
CCTTGTGATACATGCAAGATCTGTATCCACATGATTTTGGATTTCTTGTAGGCAGGGTTGATGTTGAATCCTTGGTTGCTTGGCATGGCAAGAGTATGTA
CTCCGTAACTTGCCCTGCAAGCATCTGAGATCTTGTGGATTGATGAAGGCGAGCGCATGTTAGCTAAATAAGGCATGTGACCTGAAATGTCTTAATGAAT
GTACATATCTGGAAAGTTGCTCTATTTTCTAATCTCTGATGCTGCTAGAAAGTTGCTCCTTTTTCATGATTGTTCCCTCCTGGCTTACTGATATTTTTTC
AAATTTTGTTGTGCCTATGTGCTCAAGTGTACGTAGCCTAAAAACTTTAGTGTGCATTATTTCCTTCTTTCCGCATGCCATGCAATCTAACCTTTGTGAA
CCGAAAACTCTCTAGTCGGAGAGGGCAGCTAGCCCTAGGTGCTGTCATGGAGAAGAATTACCCCGGAGGCCACTACCAATTGGAAGGGTCGAGGTTATCA
GGATTTTTCTTTGAGATGGTTCAAGGTGTCAGGTTGGTAATGAGAAACAATCTGTGAATTTCATTGCAGGCTCTTGCAAACGGTATGAACGAACGATTTA
AAGTGAAGACAATCTGCTGAGAGTTATCAACAATCAGAGATCAAGAACGTTCAAGGGAAATGTTAGCTGCTGCTTTTGGTTTAGTTCCACACTAGCCCTT
CTTTTTGCTAATATGTACTCCCTCTAAAGAAATGCAAGAGTGTTTAGATCACCACTTTGGTGATCTAAATGCTTTTATATTTCTTTACGGAGGGAGTACG
TAATACTCTTTTTTTTTCAAAAAAAATTGTAACTGTAATACTCTTGATGAATGAGGAGATGAGGTCTTGCTGTTACACAAATGTAAACTGAAAGCTAGAA
CTGGCAATTATCCTTTTTACTCCATGAGTTGGAAGTCAG