Detailed information on CNT30384324


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30182501Triticum turgidumSecale cereale5.4624.6295.31192reverse complement
CNT30292299Triticum turgidumTriticum aestivum10.5978.1598.12372forward
CNT30437799Triticum turgidumAegilops tauschii8.7910097.09309forward
CNT30670129Triticum turgidumTriticum dicoccoides12.8933.4394.26453forward

Expression of CNT30384324

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (28 aa)
MKLFAKFLEKEDHLYEYANGLKRVLDQLL

>peptide 2 (32 aa)
MLKCSRTYRFVWLRYSFKMRYIYMEHESITVC*

>peptide 3 (31 aa)
MSSSTTTTSTPRARCCVSWKMEEEESLFLLN*

>peptide 4 (34 aa)
MFFLATYPKPLNPFYLNLLVMFWSLEFLNQYLSD*

>peptide 5 (36 aa)
LPPSPPLWQDPACVLPLLDLDRGTSSPRLRLPLSPT*

>peptide 6 (36 aa)
MILCRVVSFLSPFTQGHLVVSMAVLPFQVLCMCICT*

>peptide 7 (36 aa)
MAMRNEIILQLIILVSCWRNCCTTSCFYCVLDSRCG*

>peptide 8 (98 aa)
PSSLPSPLARSSVRPPSPRSRSGHLVAPPSSPSVSHLMEPAVGGSEGPNTRFQHTRSRLPLPSPHHSSASSPRRRIWIEAAVVGGGSGLGTMSAVLAI*

>peptide 9 (47 aa)
MYCLSCLSISVYFSFSNGNTSRNLGYSSFKSPSGRVLCSWESPSRHA*

>peptide 10 (64 aa)
MQQVPFMNEDMGMYLDDELIHHYHLDSACKVLCVLEDGRGRKLIFVELNFLYFVLLYVSFDSFV*

>peptide 11 (41 aa)
MATQAGTLATPRLSPQVVGFSVHGSHHLGMLDASPECCIVL*

>peptide 12 (47 aa)
MLVSDTVILMLIYVPRFVCFESISIRLINDHGELDPNKQDTYINLAL*

>peptide 13 (91 aa)
MLLSRWSSQALLRWLERASSTLPPPLPPGLPRGRASCRDHLYYVTVVADLQCDRCIASNLFGEHFTSASLLCLDPVTEPHSVACRLLLVWP*

Sequence

>CNT30384324
CCTTCCTCCCTCCCCTCCCCTCTGGCAAGATCCAGCGTGCGTCCTCCCTCTCCTCGATCTAGATCGGGGCACCTCGTCGCCCCGCCTTCGTCTCCCTCTG
TCTCCCACCTGATGGAGCCCGCGGTGGGGGGAAGCGAGGGGCCAAACACCCGCTTCCAACACACAAGGTCTCGGCTTCCCCTCCCATCGCCGCACCACTC
GTCCGCTAGCTCCCCACGCAGGCGGATTTGGATCGAGGCGGCCGTCGTCGGCGGCGGCAGCGGGCTGGGTACCATGAGCGCTGTGCTCGCCATCTGACAC
CATCCTCCAGTGGTGGGGATTCAACATCGCCGTCATCAACAAGCGGGTATTCTAGATCTTGCCACACTGGGCATCAGGACCGCTGGATGCTTCTCTCACG
GTGGTCAAGCCAAGCTCTCCTACGGTGGTTAGAACGGGCGTCGTCAACCCTGCCGCCCCCTCTTCCGCCGGGTCTCCCAAGAGGTCGTGCATCCTGCCGC
GACCACCTCTACTACGTGACGGTGGTGGCCGACCTGCAATGCGACCGCTGCATCGCCAGTAACCTCTTCGGTGAGCACTTTACCTCTGCCTCCCTCCTCT
GCCTAGATCCCGTGACTGAGCCACACTCTGTAGCATGTAGATTACTGCTTGTATGGCCATGAGGAATGAAATAATTTTGCAGCTAATAATTCTAGTTTCT
TGTTGGAGGAATTGCTGCACCACTAGTTGTTTCTATTGTGTGCTGGACAGTCGATGTGGATAGCCTGCATGCTGTTTCTTAGGACATTAAGCTACGGAAG
GATAAACTGACATAAGTATGCTAGTCTGAAGGGTCGATAACTCACATTTGTTTCTGAATTTAGTTGGTTTATCTGTCTGTGGTCCTCAATGTATTAAATG
ACAGCCAAAGGTATCCATCTATAGAGGCTTATCTACTAACTGTTGGACCTTGGAGGCTTATAGTGCGATGAAGCCAAATTTATCTAACTAGCCAGTCGAC
AGGCTAAAACAACTAGCTATAAAATGACATCAAGTTCTGGTTTACATGCTATTCTCGTCGTTCATGCCGACAGACCTTCTGTTGTAGTGTTTAGAGTAGA
TTGAGTCTGCCAGCCCTCCTTTTTGTTTTTGTTCTTATTTTGGACAGATGCTTGGGGTGCATACTTTCTAGAATCTGCATTTGGATTTGCAGTTCGCATT
GTCGAAGAAAATTGTCGATTGTTTGATTGATGTTCTGACTTTTATGTGGACCAGTCGTCCATTCTCTAAATCATTCTTTTAATCCTGCTACCCTTTTTGT
ATCCATGTACTGTTTATCTTGTTTAAGCATTAGTGTATACTTTTCTTTCAGCAATGGCAACACAAGCAGGAACCTTGGCTACTCCTCGTTTAAGTCCCCA
AGTGGTAGGGTTCTCTGTTCATGGGAGTCACCATCTAGGCATGCTTGATGCTTCACCAGAATGCTGCATTGTTCTTTAGCTGTCGATTGTCTGTGTAGAT
TGACTGTATCGAGTTGAGGGCTTGAGGCAGGTTGTAGGTGATTAGAACAACCACCTGTTAAGTAAGATCAGTTGTACTGTATGCTCTGAACATAAGCTTG
TGCTGCTGCCAGTGTAGTGTATGCTCTGAACACAAGATCCTTTACTTGCTCTGGTTTGGTTAAGACTGATGATGCCGTGGATAAGAAAACAATTTAAAAG
GTCTGTTGAAACAAGGTGGAAGCATGTTTTTTCTTGCAACGTACCCTAAACCCCTAAACCCTTTTTATTTGAACTTGTTAGTTATGTTCTGGAGTCTGGA
ATTTTTGAATCAATATCTATCTGATTAATGCATGCCTTGTTTTGTTTTTTAGTTTGTTGCAAAACATATATCTGGTGTATCTGATTAGTTATGTTGTAAA
AGAATGCTTGTCTCTGACACTGTTATTCTTATGTTGATATATGTGCCCAGGTTTGTGTGTTTTGAATCAATATCTATCCGATTAATTAATGACCATGGTG
AGCTAGATCCAAACAAACAAGACACTTACATTAACTTGGCACTTTGAGTCCTTGTAATTCTGATAGTGTGGAACTATATTTTGTACACATAGTCAACTAG
TTTTCGTTTTATATTTGCTTGCTTATGTGGAACTATATTTTCTCATTTTTCTAATTATGACATGGATGATATGAAATATCAGAATTGTTTCTGTTACATG
GTGTGCTGCAGGAAAGCCCCTGTGTAGGTTTATTGTCTCGTAATTGGGCAATTATTTTCTTGCAGGGGGCCACCCGTTCTAGCTCGCTTTGACCCTCTTT
TGCTCTGTAGTGGTCTTGGTACATGAAAAGCAGGTCCTTTTAAATGTTTTGCTTCCTTGGTTGCATTCTGCTGTACACTCAAAAATATTTTCAATTTAGT
GACAAGCAAACAATAAAATAGTCAAAAGGCTTTTATTTAATGTGCTTTTCGAAAATGACAATGTGTTGTGATGTTCTCCTCTTTCTGTTGACATGTATGT
TGAGTAATATCAAGCCATAATTATAGTCACTCCAAGACATGCTCAAATGTAGTCGCACGTACAGATTTGTGTGGCTGAGGTACAGTTTTAAGATGAGATA
CATATATATGGAACATGAAAGTATTACCGTTTGTTAGGACATGATGACTGTTTGTTTACTACTTTATGATTTTGTGTAGAGTTGTGTCCTTCTTGTCCCC
TTTTACCCAAGGCCATCTTGTTGTGTCAATGGCTGTGTTGCCGTTTCAAGTTTTGTGTATGTGCATATGTACATAGCAGTAGACTAGACTGTTGTGATCG
TATATTACCTTCACCCCTTCTTAGATTTATCTAGATACGGATGTATCTAACACTAAAATGTGTCTATACATCCGTATCTAGACAAATCTAAGACAAGAAT
TTTGGGACGGAGGCAATGTTTTCGTGTTGTTGAGTCGTTCTGGGGTAGCGACTCTTGACGAGTTGTGCCTGGCTGATCGACTAGTCTCTACTAGTCGAGA
GGTTGAGTCGACATCTGGCAGTGCAGCTCGTCGACTAGTCGCGTGGATGGAGGGAGTACTTGCTTTGCAGCCCGACAAGACAATATTGTGATTGCTGGAA
ACTGAACTCTCTTTTATGTTTGGTTGATGCAGTTCCTTCCATTCATTTATTTGTTTCTTCGATTTGGATGCAACAGGTTCCCTTCATGAACGAGGACATG
GGCATGTACCTCGACGATGAGCTCATCCACCACTACCACCTCGACTCCGCGTGCAAGGTGTTGTGTGTCCTGGAAGATGGAAGAGGAAGAAAGCTTATTT
TTGTTGAACTAAATTTCCTGTATTTTGTTTTGTTGTATGTATCATTTGATAGTTTTGTATAGGAACAAGTGATACTATTTTGAAGGGCTTTATGGCCGGT
GATGTAAACATATTTAGTGCTGAAATATGAAATTATTTGCAAAATTTCTTGAAAAGGAGGATCATTTGTATGAATATGCGAATGGGCTGAAAAGAGTATT
GGACCAACTCCTGG