Detailed information on CNT30319150


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30146591Asparagus officinalisMedicago truncatula0.9922.3193.158reverse complement
CNT30416518Asparagus officinalisPapaver somniferum1.9727.4288.79116reverse complement

Expression of CNT30319150

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (68 aa)
MFFYLRMKQYWSVAYRRHCFPCTLSSYMSTASFLIPLSIFKYLPLSLYILNFPTRLQIERFYMSGSQF*

>peptide 2 (54 aa)
QTLELESEKRLGFSGLKIALRLPCLVLVKMSYFLYNLVNSLFVPIWLGKVYPSS*

>peptide 3 (45 aa)
MAVDEVVKSLISSVTFFIFYVFSYNIICLFINFFFKKRKIINFFI*

>peptide 4 (53 aa)
MYLIYILVVYFVKASCLKRLRVGIRAMGYYKPNESLFVHDQMKLIIYIYVSNK*

>peptide 5 (41 aa)
MAVCLFDQYKLYFVLDNIMSLSTLIILGINKFYTLSIHHFS*

>peptide 6 (45 aa)
MTILYRSDNSLSFLLALINKLDCLSTTLTLGSTSSVLHGSPYVLN*

>peptide 7 (40 aa)
MTAFCHLEAKCTRDEKRIIIDFLFSQMILKIVELDAILLF*

>peptide 8 (40 aa)
MLFKETHYAMNIIDLIEKSMSYIVYLHDISSPCQHIRFFI*

>peptide 9 (36 aa)
MVHLMFLISSCLFGLYILPQLLNNALSILLSVCTCM*

>peptide 10 (37 aa)
MLSSWLKISSQSVAANNSIFQLGVKVAIQGVISNLQS*

>peptide 11 (54 aa)
MKESTKINLILCSSIHSVEGSCNWPCIKHLVCYMLQCSLLICTVEGHLFIFGCL*

>peptide 12 (33 aa)
MKKNVRLVKPNVLQFISVYVGSKINLVYFFWINT

>peptide 13 (31 aa)
MYIYCIYGSLVQNFSPKKLESQGGYHTLLIF*

>peptide 14 (35 aa)
MALDPLTIFYLGRISVEHFRAEGCLQFVFVFIGSR*

>peptide 15 (34 aa)
MLELYKNIIIIILVSPNGSLAMKFPRTSFCHLSF*

>peptide 16 (29 aa)
MLSFDFVQVHLIFLISCCFCVISVASTFI*

>peptide 17 (29 aa)
MYTKLIYVNSILSYTFIYFQISSFIIIYS*

Sequence

>CNT30319150
CTCAGACACTCGAGCTTGAGAGCGAAAAGAGACTAGGGTTTTCGGGGTTGAAAATTGCCCTTCGATTACCCTGCTTAGTGTTGGTAAAAATGTCATATTT
TTTGTATAATTTGGTTAATTCTTTGTTTGTGCCCATTTGGCTTGGCAAAGTCTACCCTAGTTCTTAATTAATTGCCCACATTGTCAATTTGTTCTGACCT
CTCATGTAGATATTCTAATGGTTGCCATCATTTGTATATAAAATTTATGTAAGGTGATGTTTTAGATCACAAAGGAGTTAAATGCTTGAATAGAATTCTA
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TCAGTTTGGATCGGGTGAAGCCATAATCGAACCTTGCTGGTGTGGGTAAATTTCCATAATTTATGATTTGATCCAGATTTTACTTGTTTGCTTTGTGCAA
ATTATGTTTTTTAGAAATCAATGTACATATACTGCATTTATGGCTCATTAGTTCAAAATTTTAGTCCAAAAAAATTGGAAAGTCAAGGAGGTTATCACAC
TCTTCTTATTTTTTAGTTCAATTTTTTATTTCATTCTTCTTATTAGCACTTATCAAGAAATTAAATTTTTAATCTAATCCTCGCAGTTCGTATCAAAGTC
AAAATTTTCCCTAGCATTAGCCCGTACAACTTCCGTACTTCATGCTTTCGTTTGATTTTGTCCAAGTCCACCTTATTTTTTTAATTAGCTGTTGCTTTTG
TGTTATATCTGTTGCCTCAACGTTTATATAATGCATTATTATTCTACTATCTATTTTTGCATGTGTACATTATTATAGAAATTGAATGTTTATAAGATAT
CACAATCATTAAAGTCTTCAGCTTGATGAGTTGCACCTGATCTTATAATATGACAAGTTATTAAAGCCACTAAAGTTCCAAGTAACCTCACATTTTTCAT
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GCATTCAGCCATTTATTAATCATTCGATTATGTAGTATGTTATCTAGCTGGCTGAAAATTTCTTCACAATCCGTCGCTGCCAATAACTCAATCTTTCAAT
TAGGAGTGAAGGTTGCGATTCAAGGAGTAATTAGTAATTTACAGAGCTGAAGAGAGAAGGATTCTGGTTCATGTAAGTGTAGATGATATCAAAAGAATCT
CGTCAAATTTGGGATCTTCTTCCTGTATTGTGGAGACGCTTCATATACTTCTAGTTTATTTACAAATAACAAACAAAACATCTGTCCTCTTTTTTTTTTT
TTTTGTAGTGGGGTTTATAAACCATGATTAAACTCTAAACCTTACGCTGTTGGTATATTGTTTATCTACGCCATGGTGCCATCATCTGCTACAATTTTAT
ATAAGCTATCAAAAATTTAATGTTTTGTTACCAAATTGGGTTCTTTGTTTTTTGTCTGTTTTGACTTGGAAAAGTCTAGCTTAATTCTTAGTTATTTGTT
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TGTTGCCATTACTTTATAAATTAATTTAAATTTTGCTAAATTTACTTTTGTGAAATTTATATTTGTCACAAATTTATATATCATGTATCTGATGGCTCAT
TCATCCAACTGTTAATGATTGTAATTACCTTTTAAAAGTGGCTATATTCTGAAAGACTTGGATAGTCGTGGAGGTTATCATGCTGTTGTTATAATTCCTT
ATATTTGTCAATTCGTTCATGACAATTTTATACAGGTCAGATAATTCATTATCTTTTTTGTTAGCCCTTATCAACAAATTAGATTGTTTATCTACTACCC
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CAGCTTGATGAGTTGCACCTAATAGTATAGTATGGTAAGTTATAAGAATATGAACTAAGTACAATGCTTGAGTTGTATAAGAATATAATTATAATCATCC
TTGTGTCACCAAATGGAAGCCTTGCTATGAAGTTTCCACGAACCTCATTTTGCCATTTATCATTTTAAGTTAGGATACTGGACTTGTGTTCTTAATGTGA
TTTATTATTTAGATTTTTTTATATGAAAATTTATCAAGTGTTATAGATGAAAGAGTCTACGAAAATTAATTTGATATTGTGTTCCTCTATCCATTCAGTT
GAGGGTTCATGTAACTGGCCATGTATTAAGCATTTAGTATGTTACATGTTACAATGTAGTCTTTTAATTTGTACAGTTGAAGGCCATCTCTTTATTTTTG
GATGTTTGTAAGTCATCTTTCTGACCTCGGCGATGCTAAATATAGTTAAACTTTGTTTTCTGTCAGAATCCAGTTCAACTCTAGAGAACTTTTGTTACTT
TTAATGTATTTAATATATATTTTAGTAGTTTACTTTGTGAAAGCGAGTTGCTTGAAAAGGTTACGCGTAGGAATTCGAGCGATGGGATATTATAAACCGA
ATGAGAGCCTGTTCGTTCATGATCAAATGAAACTCATAATTTACATCTATGTTTCGAACAAATAGAGTTTAGACGAATCCGACGCCCCAAGCCTATTGAA
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CAACTGTTATTATTGGAAGTCACAAGGTTTGAAGATTTCCCGCCCTGACGTCTCTCTTTTGCCTTAAGAACGGTCCATTGCCTTTGGACGACTAAGTCAG
CTCGGTTTAATCTCTTTCTCAGCCAGTGACTAATCTAATCTCCCCAAATCGTGCAACAGTAAGCACCACTGGGAAGGCACATCGAACTATAATATAATGA
GTAGGGCCTGCAGAAGGAAAGCAATCAATTCACATAGTAGGGAAGCGCTGCTATCAATCTTCATAGGCTAGTGCTAGTCAGCTATGAATAGTGTATCATA
TTTTTCTTATCTGTTGCATATTTTTTTATCAATTCCATGTTAATTTCTTCACAGTAATGAGATGGCATTGGATCCTTTAACCATATTTTATTTGGGACGG
ATAAGTGTTGAACATTTTAGAGCTGAAGGTTGTCTTCAGTTTGTATTTGTCTTCATTGGGTCTCGTTGATGTTGTTAATCACTATCTTTTCCATAATTAT
CTCGGCTATAGTTGCCATAAGTTTATGATTTAATATAATTTCTTAGTTTACTTTTGTGAAATTTATGTGTACCAGAAATTTATCATGTATATACTTTTGC
ATGTTATGGCTCTTTAGTTCAAATTTTAAGTCCAAAAAGTTGTGAAGTCAAGGATGTATATGTATTGTTCTTGACGTTGCTTATCTCTGTCAGGTCATTT
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GTTTACACGTGCGCCAATGCTTTTCAAGGAAACCCATTATGCAATGAACATAATTGATCTTATTGAAAAATCGATGTCTTACATCGTGTATTTACACGAT
ATCTCCAGCCCTTGTCAACATATTAGATTCTTTATCTAATACTTGCAGTTCACATCAAAGTCAAATTTCCCTACCATTAGCCAGTACAAGTTCCCTATTT
CTTGGTTTGTTTTGGTTTTGTACAAGTCCACCTTATGCTGTTAATTGTCAGGGTTGTTTGGATTATATATATTGCCTCAACTTTCAGATAAGGCATACTA
CCCATTTGTACATGACATATAGTTGTTTATATTACATATAGAAAGCAGAAAGTTATAAAATATCATTGTCATTAAAGTCTTCAGCTTGATGACCGCATTT
TGCCATTTGGAGGCCAAGTGTACTAGAGATGAAAAACGTATTATCATTGATTTTCTATTTTCACAGATGATTCTTAAGATTGTAGAGTTGGACGCTATCC
TTCTCTTTTAGGTTTGTGCTAAGTCATCTTCTGACCTCTGTGATACTAGAGATAGTTAATTTTGTTTACTGTCATAATTCAGTTAACTTTTAATGGACTT
TTTGTTAGTTTACTGCTTAACTTCATGTTTTTCTATCTGCGGATGAAACAATATTGGTCTGTTGCATATCGTAGACATTGCTTTCCATGTACACTAAGCT
CATATATGTCAACAGCATCCTTTCTTATACCTTTATCTATTTTCAAATATCTTCCTTTATCATTATATATTCTTAATTTCCCTACCAGGTTGCAAATTGA
GAGGTTTTATATGTCTGGTTCACAGTTCTGAAGGCGTAGGAACTCCGCAAACGGAGACACAAAACTCTATGAAAGTAGAGAAAGAGGAAGACAGATGAAG
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CAAATGTTCTGCAGTTCATATCAGTTTATGTTGGAAGTAAAATCAATTTGGTATACTTTTTTTGGATCAATACGTG