Detailed information on CNT30286609


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30183145Triticum aestivumSecale cereale23.2728.192.331512reverse complement
CNT30660461Triticum aestivumTriticum dicoccoides7.117091.56462forward

Expression of CNT30286609

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MGTFRKVLCFVSPCYRRFLLLTSIFPDLL*

>peptide 2 (33 aa)
MYMSSVCSKRSPYTLGFVGLLYHIYLSTLGLFI*

>peptide 3 (53 aa)
MVVQKLELHGLAGGPNLPQHGGSFCGSNFFNLSYCHDIRFSLPWSVILSSCRY*

>peptide 4 (46 aa)
MCITSLNQASLSPLLYLFTFLAFSKMVRHHGLLFIAGVLDNFTTEI*

>peptide 5 (36 aa)
MVTLIGYGSMADYKLGSCVLSNLAYNISDMDCWFSS*

>peptide 6 (61 aa)
MLVAIQNMLPFWFLTLLSVLPIHVFLLVCWPAGLVLCSICWNWWVCPVESGQCLVCSQCKN*

>peptide 7 (71 aa)
MLNAFFNSLSSSNYVLTFLQETSSILIIFGLFIDHSCWKIVELESLATRQLVGGFGEANGSSASRMFLTSD*

>peptide 8 (63 aa)
MKLPMVYNSMVKGTFEAGQFPMFGHTGLLYPSSVLGDKRFKWLYLEFFNLSLSVAHQYGCASI*

>peptide 9 (63 aa)
ASRHASAAKPCPVRNRLAPGRLPLLHRLCAGYKRRPRCALCTPRCGLLPLFLSELSPSGRASA*

>peptide 10 (39 aa)
MQMWHTMRIIQTNVHNFTKPGFPISLAIFVHILSFLKNG*

>peptide 11 (90 aa)
RKPPRQRGEAVSGKEPVGARPAPPPPPPLRRLQKAPQVRPLHPALWPPPSLPFGAFSFGPCLRLSRLLASPPPSPPPCPSILDSFRINRV*

>peptide 12 (74 aa)
MQTCCLYVSRGQVSVLTVGSFLLASMGWLQDWILYVEIPGMLYVKGDLRQVRCEWLSLVWFSRSHQEFHNHQLI*

>peptide 13 (67 aa)
MLELVGVPCGVRSVFGLLSMQKLALFLFFNLQWLINDSVCHVIQGEFHLVYDMRICSFRYETVEIVL*

>peptide 14 (32 aa)
MIKSSGMIKLSTSYQPRLEYTICVWIIYINPS*

>peptide 15 (34 aa)
MSCCVKFIFGDLLISHFSIDKLENQLAVKSEYSN*

>peptide 16 (33 aa)
MVFSALGNYVSLQILTWMRDNIVRYLELVLLPN*

>peptide 17 (50 aa)
MICAFVPSDTRQWRSYCRVEVWVIHGLAVRMISYKFGIGIVGHARIVEDS*

>peptide 18 (48 aa)
MYKIRRLLWDILQPKKFGALYNRKTILCRVPEETSAILVAFCLIKSCW*

>peptide 19 (37 aa)
MVFCSLQVYLTILQQKSDVMLREIYFWRPSDFTFFYR*

>peptide 20 (34 aa)
MESGQCLVDGLFVSFVSATSMSWLAGLDLDLAWT*

>peptide 21 (61 aa)
MCFCWSVGLLGLFFAVYVGIGGCALWSQVSVWSALNAKISFVPLLQSPMANQRFCLSRNTR*

>peptide 22 (66 aa)
MQQKQEGSGSAEMSRRVEVWFLIQMDRSFRRTVFWCSTPTCDPCLDDLKFSITLTFNLLVFICEVQ*

Sequence

>CNT30286609
CCGCAAGCCGCCACGCCAGCGCGGCGAAGCCGTGTCCGGTAAGGAACCGGTTGGCGCCAGGCCGGCTCCCCCTCCTCCACCGCCTCTGCGCCGGCTACAA
AAGGCGCCCCAGGTGCGCCCTCTGCACCCCGCGCTGTGGCCTCCTCCCTCTCTTCCTTTCGGAGCTTTCTCCTTCGGGCCGTGCCTCCGCCTGAGTCGCC
TCCTCGCGTCTCCGCCACCCTCTCCTCCCCCTTGTCCATCAATTCTCGATTCGTTTCGAATCAATCGCGTTTGATTTCGCTCCTCGTCGCCTCTGCTCCC
TGTGCTCGCAGGGGATTCGGCCCGTCTCGTCCGCCTCCGGGGAGCGATCGATCGATCGACCGGGGAATCCCTCGAGCCGTTCGGTTTTGCCTCTGCGTCT
GATTTGATTTCGGGTGACCGGAGGGCCGAAGCAAGGTCAGTTTCTCGCGCTCGATCGGTCGGATCGCTTCCTTGGTTCCGTCACCTGCCCGCGTTCGTCT
CGTCGGTGGTTTCAGATTTGAAATTGAATTGAACGCCGTCGACCGTGCGGCCTTCCGGCTCTATTGTTCCCCGATCGACCGCTCTCGTCCCGAGTTCCGT
CGTCATCAGTTAGTTAATAATACGAGGTGGATTCGAGGCCCTCGTGGATTCTTACTTTACCGGCTGATCTGCTTTTGGTGTATGTGCTCTCATCCTAGAT
GCAGAACCAAGAGGGCCAGCGCTTAGTTCTGGAGAGATGATACAGATGAAGGGGTGGCGGAGGTTTGATTTCTGTTCATGGTTATTCTGATTGATTGATT
ACAGTCCAACGGTTAGTTTGATTGATTGATTACAGTCCAACGGTTATTCTGATATGATCAAATCTTCTGGGATGATCAAGCTTTCGACCTCTTACCAACC
CAGGCTGGAATACACGATCTGCGTTTGGATAATATACATCAATCCCTCCTAATTTAGTTTCTGGTTCAATTTAGCCTACTACAGTACAATTCTGATTTGG
ATATTTTGCTGGTTATCCTGAAACTGGGATTACAGAGGGCCACTTCGAGCCACCCGCCTTCTTGCTGACCTGCGTTTGCATGATCACTCTCTGTTTAATT
TGTTCTTCTCCACAATTCAATTAGTCCCCCAACAACTCTGATTTTGATATGCTGCTGGCTCTCCAGAAACTGAATGACATAGCCTAGCGGCGGGTGGTCC
TAATTTGGCTCGGCATGGCGTTTCTTCTTATGGGGATAAACTTTCTGGACCTTTCTTATTGAAATAATTATATCTCAGCAAACATTAGTTTCCCTGCCTT
AGTCATTCTCAGCTCTTGCAGATGGTGCCTTGCAAGGGATATAATTGGAGCTTGTCTACCTGACCTTCCCAGTCGATACAGGCTTACTTTATTTTATCTT
AACTCGTCATCATTTAATCTAGTTCTCTTCCTAACTGAAACATTTATAGAAAGGTATCTTGCTCGATGCAGGTCCTAGTTCACGAACTCAAGGCCACCAA
CTTGATGTGAGCATGCGGTTCTTCTAAATCTATCTTCTCAATTTCTTAACTTAGATAATAGTACTAAGATTTCTTACTAGGCAATATTTCAAATTCAGAT
TAGTTGCAAAGGTGCAAGAATGAAGCTTCAAATTAGTGGCATATCCTAGAACCAGAAAAAACTTAAATCTCTTATTATCCTCTTATTTTTATTTAATTCA
GCTATATGTTCATGTCTTTGATTTAGGTTTTTTCTTCTGCCCTCCATGTCGTTGCAGATTTATTTTGGCCTAAGACAATACTGGCAGTGAGCCTGAATCT
GTTAAAATCGTCTGGTTTGCAATCTATCTCCTTGTGGTTTGATTGGTTATCTGTACTCTTGATCCCTGCGTTAGTATTCCTGCCCATTGCTATCTGATAT
ATTTATAGGAAATCTGGTCCTACATGCAAACCTGTTGTTTGTACGTGTCACGGGGTCAGGTCAGTGTCTTGACGGTTGGTTCATTTTTGTTGGCTTCCAT
GGGTTGGTTGCAGGACTGGATCTTGTATGTGGAGATCCCTGGGATGTTGTATGTCAAAGGGGATTTGAGGCAGGTCAGATGTGAATGGCTATCACTCGTG
TGGTTTTCTCGTTCTCATCAGGAGTTCCATAATCATCAGCTAATATGAGGTGGATTCGAGGTCCTAGTGGATTCCTATTGTAGCAGCTGATTTCGCTTTT
GGTGTGTGTTTGTGCTCCTTTAGATGCAGCAGAAGCAAGAGGGTAGTGGCTCTGCAGAGATGAGTCGAAGAGTTGAGGTTTGGTTTCTTATACAAATGGA
TAGATCTTTCCGGAGGACGGTGTTTTGGTGTTCAACTCCAACTTGTGATCCGTGTTTGGATGATCTCAAATTCTCGATCACTCTGACTTTTAACTTACTC
GTATTTATTTGCGAAGTACAATAATTTACTCCAAGAGATTCTGATTTGGATTGGATCTACAGAAATTTAGATTTGGCTTAGCGACAGGGGTGATTTGTCT
TCTTGCTGATTGCTTTGGATGAATCATTACTTCCTCCATTTCATTTATTTCTCTCCATAGCTCACCTTGAGTCTACGATAATCCTGCTTTGCATTTGTTG
GTGGTTCTTCAGAAATTGAGGTTATACGGCTTAGCGGGAGCACCTATCGTCTTGGTGATCTGCAGTGGATGATCATTACCTACTCAGTTTAATTTCTTCT
TCTCCAGAGTTCAATTAGTCACCCAACAATTCTGTTTGTGATCTGTTGATGGTTGTACAGAAATTGGAATTACACGGCCTAGCGGGCGGTCCTAATTTGC
CTCAGCATGGCGGTTCCTTCTGTGGCTCAAACTTTTTCAACCTTTCTTATTGTCATGACATTAGGTTTTCTCTGCCTTGGTCGGTAATTCTCAGCTCTTG
CAGATACTGACATAGAAAGGCTATAACTGCACTTTGGAACTGGTGGTGTTGTCGTCCGTCAACCATAGCTGAACTTCCTATCCGAGACAGGCTTACTTGT
TCCCGCCCCATCGTTTGATCCATGCTTTGGCTATTTATAAGTAACATTTTTCCCTAATTGAAAATTTATAGTAAGGTCTCTTGCTCGTTGCAGGTTGTAG
TTGACGAAACTCGAGCCCAACCTGATGATGAATCTGTTTGCAGATCTTCTAAATCTACTAGTATACCTTCAATTCATTGCAACTTACATAACCAACAAAT
TATCTTACTAGGCAATATTTTATAATACAGATACATATGCAAAGGTGCACGAATCTAAGGATAATCCGAAGCTTTTGACTAGTGGCACATCCTACAACCG
AAAAAACTCTTGCCATCCTTCTTTTAATTTCATTTAGCTACTTGGCCATATCTTTGATATAGGTTTTTGCTCCTGCCTTTACTGTGGTTGCAGATTTTTT
TTAGCCCAGACCATGTGGGTAATGACTCGGAATCTGTTCTAATATTTTGGTTTGCGATCTAGCTCTCCATTGTTTGATTTGTTACCTTTAACTCTTGATC
CCTGTGTTCTATTGGTCTTCTGCAAGTGTTGCAGGATATAATAGTTAGGAGTTTGTGCCCAAACCTTTGCTCTGTACATGGAGTCAGGTCAGTGTCTTGT
AGATGGTCTGTTTGTTTCATTTGTTAGCGCCACCTCCATGAGTTGGCTTGCAGGACTGGATCTGGATCTGGCCTGGACATGAAGCTCCCTATGGTGTATA
ACAGTATGGTGAAGGGGACTTTTGAGGCAGGTCAGTTTCCCATGTTTGGTCACACTGGTTTACTGTATCCCTCATCTGTGCTCGGTGACAAAAGATTTAA
GTGGCTATACCTTGAGTTCTTCAATTTATCTTTGTCTGTGGCTCATCAGTATGGCTGTGCCTCAATATGAGGTGAATTGGTTCTCGTTGTAACAGCTGAT
CTCGCTTGTGGTATGTGTTTGTGCTCCTTGAGATGCAGGATGTTGTGGAGTGATGAATCAAAGGATTAAGGTTTGCTTTACTGTTCATGGTTACTTTGAT
TGGTTATGGCTCAATGGCTGATTATAAGCTAGGATCTTGTGTGCTGTCAAATTTAGCTTACAACATCTCTGATATGGATTGTTGGTTCTCCAGCTAGTGG
ACTTATGGGGACTTTCCGGAAGGTGCTCTGTTTTGTTTCACCATGTTACAGGCGTTTTCTTCTGTTGACTTCAATCTTTCCTGATTTGCTTTGAACATTG
TACTTCCTATGGTTTTCTCTGCCCTTGGTAACTACGTGTCCTTGCAGATATTGACATGGATGAGAGATAATATAGTTCGCTATCTGGAACTGGTGTTGTT
GCCTAACTGATCTCTCCCAGCCAAGCAGGCTTATCCTATCCCCTCACTGTTTTGATGCATCATTTAGCTGTTTATAAGTAGCTTCGTCTCCCCAAAGCAA
ATATTCATGGGAAGAGGTCTGTTGGTCGTTGCAGGTCCTAATTGACTATTTAGGTCCAACCTGATCCGGAGTTATCTGTTTGAAGATCTTCTAAACCCTT
TCCAATTCATTGCAATTTGTTCAACATATATAAATTATCTTATGGAGACAATTTGAACATTCATATTGATTTGGTGGATGTATAAGATTCGGAGGTTGCT
CTGGGACATCCTACAACCGAAAAAATTCGGTGCTCTCTACAACCGAAAAACTATCTTATGCCGAGTTCCTGAAGAAACTTCTGCTATCTTGGTTGCCTTT
TGCTTGATCAAGTCATGCTGGTAGCCATTCAAAATATGTTGCCTTTTTGGTTTCTCACTTTGTTATCTGTACTCCCAATCCATGTGTTTCTGTTGGTCTG
TTGGCCTGCTGGGCTTGTTCTTTGCAGTATATGTTGGAATTGGTGGGTGTGCCCTGTGGAGTCAGGTCAGTGTTTGGTCTGCTCTCAATGCAAAAATTAG
CTTTGTTCCTCTTCTTCAATCTCCAATGGCTAATCAACGATTCTGTCTGTCACGTAATACAAGGTGAATTTCATCTCGTTTATGATATGCGCATTTGTTC
CTTCAGATACGAGACAGTGGAGATCGTATTGTAGGGTAGAGGTTTGGGTGATTCATGGCTTAGCTGTTCGGATGATATCTTACAAGTTTGGGATTGGAAT
TGTTGGTCATGCCCGCATAGTTGAGGATTCATAAGTGTCTTGAGGCGTGACTGGACTGTTTGGTTTCTGTTCTGAGTATTATTTGGATTTTTGGTTGTTC
TCCAGCATTTGAGCGTAGGCTTGCCCGGACTACTTTTTGGCTCAATAATTGGAATGGTGCAGAGCTCTAGGAGATTCTTCGTGATTCATTTCTCTGTTAA
CTTTTAACATTCCAAACATTGTTCTTTCTTGTCAGTAACTCCTAGTTCTATGCAGATGTGGCATACAATGAGGATAATTCAAACCAATGTGCATAACTTC
ACTAAACCAGGCTTCCCTATCTCCCTTGCTATATTTGTTCACATTCTTAGCTTTCTCAAAAATGGTTAGGCATCATGGTCTTTTGTTCATTGCAGGTGTA
CTTGACAATTTTACAACAGAAATCTGATGTCATGCTGCGTGAAATTTATTTTTGGAGACCTTCTGATTTCACATTTTTCTATCGATAAGCTAGAAAACCA
GTTAGCTGTTAAGTCTGAGTATTCAAACTGATCCGCAGAGGTGAAGAATTCTAAAAGCTTGTTTGGGAGCTTCGTTCTGGAGGGAGTACCTATGCTCAAT
GCTTTTTTCAACTCATTGTCCAGTTCTAATTATGTTCTGACTTTCCTTCAAGAAACTTCAAGTATTCTGATTATATTTGGGCTGTTCATTGATCATTCCT
GTTGGAAAATTGTAGAGTTGGAAAGTCTAGCAACACGTCAGTTGGTGGGGGGATTTGGTGAAGCAAATGGATCATCTGCTTCCCGGATGTTTTTGACCTC
TGATTAACCCTGATCCTGAAGCATATTATACTTGATTTGGTCTTTGTGGCAGCTTTCAGTTTGAACTTGCATTCAGTGGTAGTTTGGAGTTAGTAGTGTG
CACATCTGATTCTTCCAACCGTCCTGAAGCATCTTACTTGGTTTCTGTTGTGTGCCATCGGCTTCAACTTGCATGTGGTTTGGATGTCTCATCTTTTGCT
CCAAATCAACAAAATGCTACAAGTATTGATGTCTTAACTGGAAGTTCCTTTAGTCTCAAGGGCCCAACAATGGAAATACCAGTCCGTACTCAAAGTTTGT
ATAGGAGATTATCAACTTTTGATTTGGCTATTAATCACTAGATGGTTGCCATACTGTTTCCGGAAGTTAGTTTAATATTAGGCTGCTTGTATCTATAAAT
TTATCTCTAGCAGCAATATCTTCAGCTGCAAATTTATCACCTATGTACATGAGCTCTGTATGCAGTAAAAGATCTCCATATACACTTGGATTTGTCGGTC
TACTATACCACATATATTTGTCCACACTTGGTTTGTTTATTTAACTATTTTCCTGGTGAGTTCTTTAGGATAAAGATCCCACCTAGTTTGCTGGCTC