Detailed information on CNT30219749


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30183145Hordeum vulgareSecale cereale15.6324.7680.711332reverse complement
CNT30286817Hordeum vulgareTriticum aestivum6.7124.484.62572forward
CNT30660461Hordeum vulgareTriticum dicoccoides5.036585.55429forward
CNT30130408Hordeum vulgareLolium perenne1.1735.2185100forward

Expression of CNT30219749

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (85 aa)
ASSLSLRSSRFGPRLRPSRLLASPRLFPSSFFLVPHLDSFRIAFDFCSAPRRLCFLCSQGIRPASGGSDPIDRSMGDSIDFASRV*

>peptide 2 (85 aa)
MAVLFLWLNLLDLPYSIFIRTQQTLVFPALAIFSSCRSCLARDKNWNPCCLPDLHSGDRLTHPLPSHSSVLSFLILLVFPLLKHL*

>peptide 3 (77 aa)
MRRCMNLRTIRSFQLMAHPTTEIDSSFFLLHLATWPCLRYKFLLLPSFWLQIFSLAQAMWLMTQNLFNVLIRCFRHS*

>peptide 4 (64 aa)
MIKILFNSFFSTVSIILPRILIRIVCWLSRIWNYTGLAAAPILAQHGGSFSVAKPFGPSLFNIH*

>peptide 5 (37 aa)
MNRKGGGLVSDMVRVYVWCWTEVLDRSSTWNLISMFR*

>peptide 6 (43 aa)
MLEVSNKGPEWKYQFILSLYSRLSNFDLAINYLVTILFQEVRL*

>peptide 7 (50 aa)
MNLPMVHEQYCEGDLRQVSFPCLVTLVSVTSDLSGYTFKFFDLSLSDGST*

>peptide 8 (56 aa)
MIGSKDRMYMSSECSKNVHTFIYELVILGFVGLLFFILLSMIALLTQNQILVCTYF*

>peptide 9 (47 aa)
MITLYMLVYILIFKIEVLNHPHPIRIPILVLEFIAFFCVTHYCLVIL*

>peptide 10 (50 aa)
MCFRFVGLLGLLFAVYVGISGCSLYLESGQCLVCLHCKISPVLSSSMANQ*

>peptide 11 (44 aa)
RLLPLSSELSFRAAPPPESPPRVSATVSFLFLSRPSSRFVSNRL*

>peptide 12 (47 aa)
MTFVNKNTAIPARRRIFGRRFSRMSLIFKEKYQYGYISCVCIYVTSS*

>peptide 13 (43 aa)
MAQHEYCYPLIRGGFLLVLAVTADLACGMCLFSFRCRRAMVVE*

>peptide 14 (43 aa)
MAVPISWLNFFELSYYSISLIRTHQTLVFPALVILSSCRLQGI*

>peptide 15 (98 aa)
MEWGSENLQTVFGLLTLLNLVSLFARSNLAYNISDINCWFSSYLTFGTSRKVPLGTSCYRRFLRLTSSFLIRFERYISKTWFSLPLVTMCPCRYCDER*

>peptide 16 (90 aa)
PPPSLFGALVSGRASARVASSRLRDCFLPLSFSSLISIRFESPLIFAPLLAGFASCARRGFGPLPGVAIRSIDRWGIPSISLPASDSVRP*

>peptide 17 (62 aa)
MVIFCFRLPVVADCLAQAMLVTSQNLSSFWFVISLVYFVISPIHVFPFCWPARFVVCSICWN*

>peptide 18 (61 aa)
MKLQTSGTSYNQKKLKPLVLLFLFHSAICLLRLSRQFSALVDTDMEMIQLQFGTGVVVRQP*

>peptide 19 (30 aa)
MMSSFGPNQENARSLKQGSGMEISVHTQFV*

>peptide 20 (31 aa)
MSSIQVFAPALLLVADFFFSPGHVANDAESV*

>peptide 21 (30 aa)
MYKIRRLLWSFNVDGTSYNRKNSVLSIFIS*

>peptide 22 (32 aa)
MGIREFANCVWIIDPPQFSFFVCTVEFSLQHL*

>peptide 23 (32 aa)
MIPADYFQHMAVCFILAHPGLRQKVLTYLTVL*

>peptide 24 (36 aa)
MDMIFRSDVLVVGASRVGSGFFSASYWFAGNFLVLS*

>peptide 25 (32 aa)
MQTFAVCISRCQVLRSVTVGSFCVGLHGLVAG*

Sequence

>CNT30219749
CGCCTCCTCCCTCTCTCTTCGGAGCTCTCGTTTCGGGCCGCGCCTCCGCCCGAGTCGCCTCCTCGCGTCTCCGCGACTGTTTCCTTCCTCTTTCTTTCTC
GTCCCTCATCTCGATTCGTTTCGAATCGCCTTTGATTTTTGCTCCGCTCCTCGCCGGCTTTGCTTCCTGTGCTCGCAGGGGATTCGGCCCGCTTCCGGGG
GTAGCGATCCGATCGATCGATCGATGGGGGATTCCATCGATTTCGCTTCCCGCGTCTGATTCCGTGCGACCCTAGGTCAGTTTCTCGAACTCCATCGGTC
GGGTCGGGTCGGGTCGGTTCCTTGGTTCCGTCGCCTGCCTGCGTCCCTCGGTGATTTCAGAAGATTTGGATTCAACGGCCGTCGCCCGTGCGGTCTCCCG
GTTCTAGGTTCCCGATCGAGTATGTATCAGTTAACACGAGGTCGATTCTTTGAGGCCCTCGTGGATTCTTACTACTTTACCAGCTGATCCCGCTTTTGGT
ATGTGTGCTCTCATCTTGGATACACAAGCAAGATGGCGAGCGGTAGTTCTGAAGTGATGGTAGGTTATTTAGAAGGGCGGAGTTGAGGTTTGATTTCTGT
TCATGGTTATTTTGATTGATTGATTGGTTGATTGGCTACGGTTCAGCGGTTACTCTGTTATGGTCAGATATTCTCAGGGCGATCAATTGGATCTCAATCA
ACCTGCAACTTCGATCTGCACTTGGATAACAATATAAATCAAAACCTCCCAATTCATCTATTTGGTTTGCACAGCGCGCAACATATCTGATTTTGGTTCG
TTGATTGTTGGTTCTCCAGAAATTGGGATTACACGGCTAAGCGGACCGGACCGGAGCGACCTATCTTTGGCTGATTTGCGTTTGGATGAATAATATTACT
ACCTCTATTTAATTACTTCCTCTCCTGAGTTCAATTTTAGCCTCCCAGCAATTCTGATTTCGATTTGCTTCTCACTGTCCAGAAATTGGGATTACTTGGC
CTAGTGGGAGCGGCTTACTATCTTCTTGCTGACCTGTGTTTGGATGACCCAACTCTGTTTTAATTTCTTCTTCTCCACTGTTCAATTATTCTCACAACAA
GTCTGATTTGGATTGGTTGTTGCTTGTCCAGAAACTGGAATTACACGGGCCTAGCGGGTACTCCTATGATCCCTTGCCAGCATGGCGGTTCCTATTTCGT
GGCTCAACTTTTTTGAACTTTCTTATTACTCAATATCATTAATTAGAACTCATCAGACATTAGTTTTCCCTGCCTTGGTCATTCTTAGCTCTTGCAGATT
GCAAGGGATATAATTGGAACCTGTAGTTGTCTACCTGACCTTCCCAGTTGACACAGGCTTACTCATCCATTACCTGCTCACTCGTTTGTACCTAGTTTTC
TAATCCTAGTTTTCCCCTGACCGAAACATTTATAGAAAGGTACCTTGCTCGTTGCAGGTTTACGAACTCAAGGCCACCAACCTGATGCTAAGTTTGCAGT
TCTTCTAAAACCACTATCTACTCAATTCCTTAACTGAGATAATGTTAATAAGGTCTCTTACCAGGCAATATTTTTAATTCAGATTTAGCTGCAAAAGGTG
CAAGAATGAAGTTTCAAACTAGTGGCATATCTTACAACCGGAGGAAAACTTAATCTCTTACCCTCCTATTTTTATTTCATTCAGCTACATTTTCATGTTT
TTTATTTAGGTTTTTGCTTATGCCCTCCATGTCGCTGCAGATCTGTTTTGCCTAAGACAATGCTTGTAGCAAGTCAAAAAACTTCTGGTTCGCTATCCAT
CTCTTTGTTGTTTGATTGGTTATATTTGTACTCTTGATCCCTGTGTTGGTCTTCCTATACGTGTGTGGGTTGCACTGCAGGATATATTTACGAAGTCTGG
GCCTACATATGCAAACCTTTGCTGTGTGCATTTCACGGTGTCAGGTACTCAGGTCAGTAACTGTTGGTTCATTTTGTGTTGGCCTCCATGGGTTGGTTGC
TGGATAGTATCTGATATGTCGAAGGGGTTTGAGGATTAAATGCATGTTGCCAGTGTGGTCTTCTAGATCTCATCATGAGTTCCATCATATAATCAGCTAA
TATGAGGTGGATTTGGGGTATTGGTGGATTCTCATTGTAGCAGTTGATCTCGCTTGTGGTCTGTGTTTGTGCTCCTTCAGATTCAGCAGAAGCAGGAAGT
GGTTCCTCAGAGATGAACCGAAAGGGTGGAGGTTTGGTTTCTGATATGGTCAGAGTCTATGTTTGGTGTTGGACTGAAGTTTTGGATCGCTCATCAACCT
GGAACTTGATATCCATGTTCAGATGATCCCTCTGAATTTCACTTCATTTGCTTTGGATTCGTTCAGTTTTAGCCTCACAACTTTGATTTGGATTTGTTGC
TGATTGTCAGAAATTGGGATTACTTGGCTTAGTGAGAACGACGTACTATCTTCTTGCTGACCGACCTGTGTTTGGATGATCAAAATTCTGTTCAATTCGT
TCTTCTCCACAGTTTCAATTATTCTCCCAAGGATTCTGATTCGGATTGTTTGCTGGTTATCCAGAATCTGGAATTACACGGGCCTAGCGGCTGCTCCTAT
TTTGGCTCAGCATGGCGGTTCTTTTTCTGTGGCTAAACCTTTTGGACCTTCCTTATTCAATATTCATTAGAACTCAGCAGACACTAGTTTTCCCTGCCTT
AGCCATTTTTAGCTCTTGCAGATCGTGTCTTGCAAGGGATAAAAATTGGAACCCGTGTTGTCTACCTGACCTTCACAGTGGAGACAGACTTACTCATCCT
TTACCTTCTCATTCGTCTGTACTTAGTTTTCTAATCCTACTAGTTTTCCCCTTACTGAAACATTTATAGAGATGTATTTTGCTCGTTGCAGGTCATTGTT
TACGAACTCAAGACCACCAACCTGATATTGAGTTTGCAGTTCTTCTATATCTAACATCTTCTTAAAATTCCTTGACTTAGATAATAAAAATAAGATCTCT
TACTAGGTAATATTTCAAACTAAGATTTAGCTGCAAAGGTGAAATAATGAAGCTTCAAACTAGTGGCACATCCTACAACCAGAAAAAACTTAAACCTCTT
GTCCTCTTATTTCTATTTCATTCAGCTATATGTCTTCTCCGCCTTAGTCGGCAATTCTCAGCTCTTGTAGATACTGACATGGAAATGATACAACTGCAGT
TTGGAACTGGTGTTGTCGTCCGTCAACCATAGCTGAACTTCCTAGCCGCCACATGCTTACTTGTTCCCAGCCCATCGTTTGATCCATGCTTTAGCTATTT
ATATAAAAGTAACATTTTCCCCTAACTGAAAATTTATAGAAAGGCCTCTTGCTTGTTGCAGGTTGCAGTTGATGAACTTAAGTCCAACCTGATGATGAAT
TCGTTTGCAGATCTTCTAAATCTATGAGCATTGTTTCAATTCATCATAACTTACATAACCTACAAATTATCTTACTAGGCAATATTTTATAATACAGATA
TGCGAAGGTGCATGAATCTAAGGACAATCCGAAGCTTTCAACTAATGGCACATCCTACAACTGAAATAGACTCCTCCTTTTTTTTACTTCATTTAGCTAC
TTGGCCATGTCTTCGATACAAGTTTTTGCTCCTGCCCTCCTTCTGGTTGCAGATTTTTTCTTTAGCCCAGGCCATGTGGCTAATGACGCAGAATCTGTTT
AATGTTTTGATTCGGTGTTTTCGGCACTCTTGATCCCCGTGTTCTTTTGGTCTTCTCCGAGTGTGGGTTGCAGGATATAATAGTTTGGATTTGGTGCCCC
AACCTCTGTACATGGAGTCAGGTAAGTGTCTCGTAGACGGTCCTGTTTGTTTCATTTGTTCTCGGCCACCTCCGTGAGTTAGCTTGCAGGACTGGATCAG
GTCTGGAAATGAACCTCCCTATGGTACATGAACAGTATTGTGAAGGGGACTTGAGGCAGGTCAGTTTCCCATGTTTGGTCACACTGGTCTCGGTGACATC
AGATTTGAGTGGCTATACCTTTAAGTTCTTCGATTTATCTTTGTCTGATGGCTCAACATGAGTACTGCTATCCCTTAATACGAGGTGGATTCTTGTTGGT
TCTCGCTGTAACAGCTGATCTCGCTTGTGGTATGTGTTTGTTCTCCTTCAGATGTAGGAGGGCGATGGTTGTGGAGTGATGAATCGAAGGGTGGAGGTTT
GCTTTACTGTTTGTGGTTATTTTGATTGGTTATGGCTCAATGCCTTATGAGAAGCCAGGATCTTGTGTGCTGAAGTTTTCGTTTCGGATTGAAGTTGGAT
TGGATCGTTAACCATGGAATGGGGATCAGAGAATTTGCAAACTGTGTTTGGATTATTGACCCTCCTCAATTTAGTTTCTTTGTTTGCACGGTCGAATTTA
GCTTACAACATCTCTGATATCAACTGTTGGTTCTCCAGCTATTTGACTTTTGGGACTTCCCGGAAGGTGCCTCTTGGTACATCATGTTACAGGCGGTTTC
TTAGATTGACTTCATCTTTCCTGATTCGCTTTGAACGTTATATTTCTAAGACATGGTTTTCTCTTCCCTTGGTAACCATGTGTCCTTGCAGATATTGTGA
CGAGAGATAATATAGTTTGCTATCTGGAACTGGTGTTGTTGCCTAACTGATCTCTCCCGGCCAAGCAGGCTTATCCTATCCCCTCACTGTTTGATGCATT
ATTTAGCTGTTTAAGAAGCTTCGTTTCCCCAAAGCAAAAATTCACAGGAAGGTCTCCTGTCATTGCAGATCCTAATTGATGATTTAGGCCCAACCTGTTG
CTGAGCTATCTGTTCGAAAATCTTCTAAACACTACACCTTTCCAATTCATCGTAATTTGTTCCAACATACTCCTATAAACTATCTTATGAAGACAAAATT
TGAATATTCAGATTGATTTGGTGGATGTACAAGATTCGAAGGTTGCTCTGGAGCTTCAATGTAGATGGGACATCCTACAACCGAAAAAACTCAGTGCTCT
CTATTTTTATCTCCTGAAGAAACTTCTGTTGTCTAAGTTCCTTTTCGCATGTAGCATTGATGGTGATTTTTTGCTTCCGCCTTCCTGTAGTTGCAGATTG
TTTAGCGCAAGCCATGCTGGTAACCAGTCAAAATCTGTCATCTTTTTGGTTTGTGATCTCTCTGGTTTACTTTGTTATATCCCCAATCCATGTGTTTCCG
TTTTGTTGGCCTGCTAGGTTTGTTGTTTGCAGTATATGTTGGAATTAGTGGATGTTCCCTGTATTTAGAGTCAGGTCAGTGTCTGGTCTGCCTTCATTGC
AAAATAAGCCCCGTTCTCTCTTCTTCAATGGCTAATCAATGATTCTGTTTGTCACGTAGTACAAGGTGAATTTTATCTCATTCATGGTATATGCGCCTTT
AGAGACAAACCAGCGGAGATTGTATTGGCTGTTCCCTTTAGCTCATCAGATGATATCTTAAGTTCAGGATCGGAGTTGTTGGTCAGGCCTGCACGGTTGA
GGATTCAAATGTGTCTCGAAGCGTGACTGAACTGTCTGGATATATTCTCCTCCTATTTGATATCTCCATTGGTGGAAGTTTTATTGCAAGATTGTAGAGT
TGGAAATTCGGCTAGTGCGGGGACTTGCTGAAGCTATCAAATTGGTTTGGACTTCTGATTAGTGATACTGAAGCATATTACGTTATTTGGTCTTTGTGGT
AGTTTTCAATTTGAACTTGCACTCGGTGGCCTCATCTCTTTGGCGCAGCTTGGAGTTGGTAGTGTGCACATCTGATTCTTTCAACTGTCATGAAGCATCT
TACTTGGTTTCTGTTGTGTGACATCTTGCTGATTATGGTATCTGCTTCAACTTGCATGTGGTTTTGATGGAATATGATGTCATCTTTTGGTCCGAATCAA
GAAAATGCTAGAAGTCTCAAACAAGGGTCCGGAATGGAAATATCAGTTCATACTCAGTTTGTATAGCAGATTATCAAATTTTGATTTGGCTATAAATTAC
TTGGTTACCATACTGTTTCAGGAAGTTAGGCTTTGACATTTGGCTGCTTGTATCTTTGAACTTGCAAATTTATCACCTATGATAGGAAGTAAAGATCGCA
TGTACATGAGCTCTGAATGCAGTAAAAATGTTCATACATTTATATATGAATTGGTCATACTTGGATTTGTGGGTTTACTGTTCTTCATACTGTTGTCCAT
GATCGCACTTCTGACACAAAATCAAATTTTGGTGTGCACATATTTTTAACTTTAATGATAAAGAAAGATCCCACCCATCCACTTGTGTTGGTTTAACTGT
TAACATCAGTGGCCTCCTGTATTTGGGTAATGTTGACCACTTTGAGCAAAAAGAGGTTAGGAGTGATTGCTATATACTAAAACAATGGAGAGTTGAAGGT
TCTGAACTGGAAGCTTGAACGAATATTTTGCCCTTAACACTCTACTCATGTCTTTGATTAGTGTCAACTCCACTAAATATGATTCTGGTTTGTTGGTATG
GATATGATTTTCAGAAGTGATGTTCTTGTCGTTGGCGCTTCTCGAGTGGGATCTGGATTCTTCAGTGCATCTTATTGGTTTGCTGGGAACTTCCTAGTTT
TAAGTTGATAACTAGCAGAACAGTCAGGCTAATTTGATGATTCCTGCTGATTACTTTCAACATATGGCAGTTTGTTTCATACTTGCTCATCCTGGACTTA
GACAGAAAGTACTCACATATCTTACGGTCCTCTAATGGCTAATTTGATCTCTTTACGGCAAACTGCTAATTTGATCTGGATTATGGAATCCTCTATTGTT
AAATTTATATAACTACCACACTGCGTTCACACATCTTATGTCCTCTAATGGCTAATTTATTTTTTGGCGAACTGCTAATTTGTTCTCGATTGTGAATCTT
CAACTATCTTATGGTCTTCTATGGCTATTTTGATCTCTTTACTGCTAATTGCTAACTTGATCTGGATTATGGAATCTTTCATTATCTACTGTTAAATTTA
TAATTACATAGCGTTCACACATCTTATGGTCCTCTAATGGTTAATTTATTTTTCGCGAACTGCTAATTTGATCTGGATTGAATCTTCAATACACATTCTG
AGTTTTCTGGTAACTTCCAGTTTTAATTTGTTGGCAACTAGCAAAAATACACATGTCACCATTCTGTTGCATAATACATATAATACATATTGGATTTTAA
AGACAAGGAGATATTTGTTCATATATATCTATATAATGGGCCAAAACTAGGAAAGCTTTCTCTGTGTCTAGAGACGAAGATGATCACCCTCTATATGCTG
GTATATATTCTTATTTTCAAGATTGAAGTTCTGAATCACCCTCACCCCATAAGAATTCCCATTCTTGTTCTGGAATTTATAGCTTTTTTTTGTGTGACCC
ATTACTGTCTTGTGATCTTGTGAAAACGTTGCGTGAATATTTATTGCCAATAGCGTATCGTGCGTTGTGAATGCTGCCTCTGGTTGATTGTGTGTGGCTT
GTACGCTTAGCTGAATAATTGGTTGTTGTGTTTGCTTATTTATGTGTTTAGTAGTTTTGTAGTTTAACACTGCCTTTGCCGGTCCCAAGCCCGGATGAGA
AAATGTGGAGGGAACTGCTGTTAGCTCCTCTGTATCGTTTGCATTAGAACAGTCCTAGTTGAATACTGGATCGTCTTTGGATGCTATGAAAAATCTGGGC
AAGTTTAGTCAGGCTGTTGATACAATCTTTCCTACAATTTAAAGATCATAATGGTATTCTTCGTTTTCAGATATGACCTTCGTAAACAAAAATACTGCAA
TTCCTGCTCGTAGACGGATCTTTGGTAGGAGGTTCTCCCGCATGTCTTTAATCTTTAAAGAAAAATACCAATATGGATATATTAGTTGTGTGTGTATATA
TGTTACATCATCATAAAAAAATATTATGAACAATGTTTACGTATAAGTTGTGGTACATCTTTGTGCCATTTGATCGACATGCAAACGTTTTCATAAACGT
AGTATGCATATAAATTAGTCTCTGTTTCTGCCTCATGTACTTTATGAAAATAGAATTCAATTAGATAATAAAGCATGATAATGATATTGAAACTAGAATT
AAAGAAATGCGCGGACCTAGCTAGTACTACTTAATTACCTTGACCAGTCGTCAACGTAGTTTCGGTTTCTATTCACCGACAACATCTTTGATGAACCGTT
TTCAAACTCTGCCCGGCAGAGAAAATGAATAAAATAGGTATTAATTTTTTGATATCAGGAAATGAATGAAAAAGGTCGATATATTGTGATAATGATTCAT
ATTACGCGTCGAGCATTTTAACCACGTTGGTGTATTCTTGAGGGTTTTTACCTATGAATCCAAGGCATCAACAGTTTCAGCGTTAACTTTAACGATTAGC
AGGATCCAGCAATACATGCACACATTTATATAAGCAGACATGCATAACTTATCAATTACACTTAACATCGAGTAAGCAAAATAGAACTTGTAGTATAAGA
TAGTAACACTCTTTTGAAGTTGT