Detailed information on CNT30634402


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9LYQ2|LAC13_ARATH, E-value = 2e-15

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT3093762Capsicum annuumSolanum tuberosum4.2830.0985.98164forward

Expression of CNT30634402

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MSQLCNFLSSFSSFSGLAALSFFSLPCNI*

>peptide 2 (38 aa)
MSQPLLALERVCWSALDCIKQQHIPITIPQTGAYRRYR*

>peptide 3 (45 aa)
MGKSNKIGMLECAMAPAQGCNTNQEMIQTFQIVHVISSSRSCSLI*

>peptide 4 (84 aa)
YGRDACFQEQLSLFIKFFCVILYDFHVVVDGGSDKITKRARSFSAVLLTFRSLATIAKPKSIDVSSSSKSVKLFICWWFELNFR*

>peptide 5 (31 aa)
MIWTQRDLFASAIHASALGHFAILILCVIVL*

>peptide 6 (31 aa)
MAHKKKVEGKDRTKPIFLLLIFHLKGFKNAF*

>peptide 7 (32 aa)
MVTEKIQYSYWHRIEFHLDLDSYWRVHRSVSY*

>peptide 8 (34 aa)
MVIGILSATFLRSKLLCYNILCQTSKIRRQYYNL*

Sequence

>CNT30634402
GTTACGGTCGTGATGCCTGCTTCCAAGAGCAATTAAGTCTTTTTATTAAATTTTTTTGTGTCATCTTGTATGATTTCCACGTAGTGGTAGACGGTGGTTC
AGACAAAATCACCAAAAGAGCACGTAGTTTTTCTGCAGTTCTTTTGACATTTCGCAGCCTAGCGACAATCGCAAAACCTAAATCGATTGACGTCAGCAGC
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CTTAATTTACTTTTAATCTCGGTGTCTAGGACTTCCTGATCACCGAAGTGGAAAAGAACTAGCCATTAGATGTCCTGGAATATTTTTTGATCAATGATAT
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GGTTTTACGTGTTATTGGTTCGGTTTATCGGTTTTCGGTTTTTAAATATGTAAAACCAATAACCAATCAATAAGATATTTTCTTATCGGTTTCAGTTTAT
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TAGTGTCATCAAGAAAGCTCATGAGTCAGTTGTGCAACTTCCTAAGCAGTTTTAGCTCCTTCTCTGGTCTTGCCGCCCTCTCTTTTTTTTCTCTGCCATG
TAATATATAGCTGGTTGTTCATCAGCTTTGATTAGGACATCAGTTGTCCGAGTTGGTCCCACCATAAGAACCGACATTGTGAAGGGTTTAACATAAGAGG
CATCTGCTCCAAGGACTGTAAATTTGTAGTTGGCCACAGTGAAGAAAAGTTGCTGGCTCATTCCAGCGTTGATAACTCGAAGAAGGTTGGAACTTAGTGA
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