Detailed information on CNT30630696


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30499788Vigna unguiculataCoffea canephora2.0923.1597.3375forward
CNT30403020Vigna unguiculataBeta vulgaris2.0627.1197.374forward
CNT30611088Vigna unguiculataArabis alpina1.9820.9495.7771reverse complement
CNT30653503Vigna unguiculataRosa chinensis2.231.2397.4779forward
CNT30205405Vigna unguiculataHelianthus annuus2.0633.3310074forward
CNT30342067Vigna unguiculataEragrostis tef1.9821.0790.1471forward

Expression of CNT30630696

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MILALGARGPDFDSRNAPFFFLYACCLHV*

>peptide 2 (34 aa)
MAYPGKQIWYSVCNLTIRTEENVACIYNFIIKLT*

>peptide 3 (35 aa)
MPPFYLHMFLSRHKEKHCILRHDIILAVVSLPTVF*

>peptide 4 (39 aa)
MGISLFSHLSLCDLIRRRLPLCSNSFILFLIHLNSLIML*

>peptide 5 (41 aa)
MDFSYLNLLNSSISTTKASTCCKLECQQFYLCHVVEVRYTS*

>peptide 6 (44 aa)
MCCKSKLMIKIYPETMVLTPLMLHSALNTIVSKNRISVARKVYT*

>peptide 7 (35 aa)
MFFQIAYMNKDGGNCCSWCLPPKSIKFFKTIDGHI*

Sequence

>CNT30630696
CGCGGAATGTAAATAAGCTCTCCTAGGTCAGCACCTACTTTCAGAAGAAGTGGAAAAAACGAGCGTTTGGTCCAGATGAGTCGTGCTTGGGGTGCGACAG
GTTCCAACTTCATTTCCGAGTGCCCCTTTTTTGTTTCTTGACGATTCGGAAACTGGCAAGATTGAGAAGGTAATCGCTTTAGTTAAATACCAGCCTACGA
GCATCAGGTTTGATTTCTCAATTTTAGCCCCTTTCTACTTCCGGAAGTTGACAAAGTTGACATGTTAGTTCGTTTAGTTAAATAATAATAAACATCAGAG
GTTGCATGTGATAGTGTTGGGATGAATGAATTGCAGATCGATAACTTTATCTGAAAATTTTCGGTGTAAGTACCAGCTTGCCTATGAAAATTTAATACAA
TAATGTGTTGTAAGTCAAAGTTGATGATTAAAATATATCCAGAGACAATGGTACTCACACCTTTAATGCTCCATAGTGCATTGAACACTATTGTCTCTAA
AAATAGGATATCTGTAGCGAGAAAAGTATATACATAAAACCAAGAGTGATAAATTGTAAATTCACATCGATAACTTGACTAGAAAAGAGGTTACCTTGAC
TTACATGGCCTATCCAGGTAAGCAAATCTGGTACTCTGTATGCAATCTTACCATTAGAACTGAAGAGAATGTGGCATGCATATACAATTTTATTATTAAA
CTGACATAGTTTTGGATTTGCCCTAAGTCTCCCAATCAGGGCATTTGGTCTAGTGGTATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAGGTCCCGAGTTCAATTCTC
GGAATGCCCCCTTTTTATTTACATATGTTTTTGAGTAGGCACAAAGAGAAGCACTGCATTCTCAGACACGATATAATACTTGCAGTTGTTTCTCTTCCAA
CTGTCTTCTAAAAGAACAGGAGAAGATGCAAATCATAGTCTAAGTAGCTGGCTGTATAAGCCTTAGGTTGGGCTCCAAGACAATTTGTCACAAGGCAGTT
AGCAGTTGTTTTGATTTCTCTGCCTTTCCACTAGTTAGCAAGCATCAGTCACAATTCTGAGATTGTGGTATTTGATCTTAAGTATGCCATATGAACTCTG
TATTCTACAATGAAGTAAAAGTATTGGTTAATCAAATATGTTTTTTCAAATTGCATATATGAATAAGGATGGTGGTAATTGTTGTTCATGGTGCCTGCCA
CCCAAAAGTATCAAATTCTTCAAAACAATTGACGGACACATCTAATTAGAAAGTATCTTATTAGCATGTTTAGTTAAATAATAATAAGTGTCAGAGTTTG
CATATGTATGTGTTGGATGAATAAATTGATACATCAACAGTTTCTGCTACAAGTATTTCAGTACCAAGTGACAACTTGCCACTGAAAATCCTGTAAAATA
ATATGTTGCAAGTCAAAGTTGGTCTTAAAATATAAAACCAGAGGGTTACATAAGTAATCTTCCATTGATATCTTGACTAGAAAATCAAGTTATATCTTCA
CTTATAATTGCCCATCCAGGTAAGCAAATCTGGTCATTTGTCTGCAATCGTATTGTAGGACTTTAGAGGATGTGACATACACAATTTTAACGAAACCTAA
ACATAGATTTAACTCACCCTTTCAACAGTGGGCATTTGGTCTAGTGGTATGATTCTCGCTTAGGGTGCGAGAGGTCCCGAGTTCAATTCTCGGAATGCCC
CTATTTTTTTCAGTTTTCATGTATTTATGTTTTAATTGAATAAGGAAGATGAGTTTGAATTGTTGTCGATGCCTTGCACCCAAATACATTATTGATTCAG
TGTAGGCCAGTTAGGAAATGAAAAGAAAAACTAAATGACGTCCACAAGTTGCTTCATTCAGCTTGGTTCAGTCTATAATCCAACTAACAAATAGATTTAA
ATATCTTGACTTTACTTCTTTTGATATAAAAGGCTTTATTATCCAGTCAACTACTGTATGAATATTGATGTAGTTTTTACAAGTAATTGTGAAGCAACAA
ACTTCTCTATCATTGATGCTCGACTTGTGAAATAACCTTGAAAGTACACATAATGTTTCAATTTGTAAAAAAGTAGAATGCTACCATTTACTGATGTCAT
GTGGTAAACAAAGTTAGATGTGCAAGTCAGAAGCAAAGCTTTAAGTTCAGAATCCACCCTAAAATAATTTCACCAAACCAATTTTTTAGTTTTTAATATA
ATTAGCAAACAACATAATTTTCACAAGAGGACACACATTTATTCTTGGAATGCCCTATATTTTAATGGCTTGGATGCTAATAAGCTTAACATGATTTGTT
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GTTAAATAGCAATAAGCATCAGATGCTTCATGTGAGTGCATTAGAATGAATGCTAAGATACATTATTAGTTTTAACTGGAAGGGCTCGTTACCAAATCGC
TACTTGCCCTTGAAAATGTAATATAATTATGTGTTGCAAGTCACAGTTTATCCTAAAATAAAAGACTGGAGGTGAATAAGGAAGCTCTTTGATACCTTGA
CTGATAACCAAATCTGGCCATTTCCCCTCCAATGTGGGCGTTTGGTCTAGTGGTATGATTCTAGCTTTGGGTGCGAGAGGTCCCGACTTCGATTCTCGGA
ATGCCCCTTTCTTTTTTCTTTATGCATGTTGCCTTCACGTTTGACAGAAGTTACTTGATTCTGTTTTGATTCATTAAGCTTGCAAAACTTCAGTTCTTTG
TTTTATAAGCCATTCAATGACTGTATCAATGTTGAGATCAAGAAGCAACAAAATTCTCTTTTGGTGATGGATTTCAGCTACCTGAACTTGTTAAACAGTT
CCATAAGTACAACTAAAGCTTCAACTTGTTGCAAGTTAGAGTGCCAACAATTTTACTTATGTCATGTGGTAGAAGTCAGATATACAAGTTAGAGGCAAAG
TTTCAACTTCATAATACATCCTAAAAGTTTTCGCAAATCAATTTAATAGTTTCTAATATAACTATCAAACTATGAAATTTGCATGATAAGGTTTTTTGTC
TAATGGTCTGACACTGGAAATGCCTACATTTTGATAATTTAGAAGTTTACAAGCTTGACTTGACTTCACTTGTTAATTACCTTTTTTTGAATGCCAATCT
AAAGTAGTATAAATGGTGATAGAGTTTCCGGGGGAGATCATGAAGCACTAAAATTATGTTGTGTTCATTTGAAGGGATTTATTGTTGAGAGAGATTGGAG
AGAAATGATTTGAGGGTGAGTTAGGTATTCAATTATAGGAATTTGAGAATGAAGAAAAGGAAAGAACATGGGAATTTCCTTATTTTCACATCTTTCCTTA
TGTGATTTGATTCGAAGAAGATTACCATTATGCTCGAATTCATTTATTCTTTTCTTAATTCACCTTAATTCATTAATAATGTTGTGATTATGATAATAAT
GTAAAAATATTACTTTTAAAATTATGCTTACATCAATAATTAATACTTGAAAATTCTAAATTGTTTATAAGAAAAGTTGAAGGAGT