Detailed information on CNT30618238


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30499788Sesamum indicumCoffea canephora1.2626.5498.8486reverse complement
CNT30403020Sesamum indicumBeta vulgaris1.1228.2198.777reverse complement
CNT30611088Sesamum indicumArabis alpina1.0420.9498.5971forward
CNT30653503Sesamum indicumRosa chinensis1.0528.4610072reverse complement
CNT30205405Sesamum indicumHelianthus annuus1.1736.0498.7580reverse complement
CNT30342066Sesamum indicumEragrostis tef1.0425.1887.3271reverse complement

Expression of CNT30618238

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MCFSFDFMMSKSFFNLFHPFFFHSLFTIY*

>peptide 2 (58 aa)
MMSKSFLNLFPPFIDHILLTILPDLSVFITSCSLNFWYSISKLLTLIQVRLFIHHIFI*

>peptide 3 (48 aa)
MFILHFVIEMRLSNLFLLMTVLLWLYDEQKFSELISAIYRSYFAYNFA*

>peptide 4 (78 aa)
MLSFEPSGNLMSSLRNALLVDFVKCVTGNPLEFDCSFPLFPCQQKFSNQINEDRSLFCDMLCYYEVIELLNILLLYEL*

>peptide 5 (70 aa)
MHYLWFLSNVLLEILWSLTAASLFPFPMEVQHSNILYSGLLLIYYFEKKKNQYIIQQEDILRTVLTSWLG*

>peptide 6 (71 aa)
MPCLTELLCFVYLYFALLALLVIGKKYGIRGWNKKCVMGAFRESNSRPLAPKARIIPLDQMPNLPYKIRAL*

>peptide 7 (32 aa)
MHYLWFSSNGLLANPLEINSAFLCFLALELQQ*

>peptide 8 (32 aa)
MLFKNYISSHVKLAYVSVKLGAYSSNMCQLGS*

>peptide 9 (34 aa)
MNKKQKPGAFRESNSGPLAPKARIIPLDQMPSCL*

>peptide 10 (33 aa)
MWWWNVQLRHLVPAFCVGWKLEMYQTEVKMQVK*

>peptide 11 (38 aa)
MKHVNNLLRLQQKGAHFLSFCCNFPRLQLASISMILLA*

>peptide 12 (35 aa)
MGHSENLTQDLSHPSENHTTRPNAQTFILHLYLSS*

>peptide 13 (41 aa)
MMCISCSLLHFVIEMPLLLSELSEVAYQFCFISECASLLIL*

>peptide 14 (41 aa)
MDLTSTISLLLPEKWGALSAACPRVHSPMTMIVDYGETTIT*

>peptide 15 (42 aa)
MPLLSFNSHTEIMIHFHGFDVDHFLASARKMGCLVGCLSPSS*

>peptide 16 (48 aa)
MSFVKVNEQETKTWGIPRIELGTSRTQSENHTTRPNAQLFMINLYLLC*

>peptide 17 (52 aa)
MIGEKGNQENALTVFNIGAFRESNSGPLAPKARIIPLDQMPNLIYSLYLLRY*

>peptide 18 (50 aa)
MHYLWILSNVLLEILWSLTVASPFSRANRSSAIKSMRIVVYFVICCVIMK*

>peptide 19 (52 aa)
MYSKVGAFEVCIPVNIASLINIYCFVFVYFFSPGSWSCISGTNKICSIPMGD*

>peptide 20 (61 aa)
MLSIESSDHLMSSLRNALLVVFVKRVTGNPLEFDCSFPFSVSNGSSAFKHLIFRPSTNLLF*

>peptide 21 (55 aa)
MMIAPFIIDFGFCKLIKKSVNRRKDNQENALTFLRDGAFRESNSGPLTPKRESYN*

>peptide 22 (60 aa)
MLQSGYNFLLSGWIMDTSCAILLYWCLLECFSIWLHMLFDLWLCYVHLGEWQWIIVVEIT*

>peptide 23 (56 aa)
MQYKKTAVQYIAKPPKTFQEFLQRLKKMKQYPIYIVPSCNQFCLIKSSCNASTQLPF

>peptide 24 (29 aa)
MNYEVVKVKVKWWRGKKMGRKKQTNTCHL*

>peptide 25 (49 aa)
MMFNFIFVILMILTLASCIVDLLADLFNNFLLLLFNTKLLFGLYMVLTI*

Sequence

>CNT30618238
GTCCCTTGACACCCTAACAACGGTAAACTAAACGACGCTCCTCGTTCGCAAACATTCCCTACCGCCACTTTCGTCTTTTGCCGCCATTGCGCTCTCACGG
CCGCTGGTGAGCTATTTCCCCCTCTCTCTAAAAACGAAACAAGTTCTCAAATTTGCTTTTTCCTTTCACCATATTTCCTTTAACTTTCGCATGCCGAACT
GAGTGGGAACAGTTTCCTGCGAAGAAAGGAAGTATTTTCACTCTAGTCGATTGAGACCCAGTTCAGTTTCAGTGTTTATGTTAATGGAAGATTCACATGA
TGTTTAATTTTATATTCGTAATACTGATGATTCTGACATTGGCGAGCTGTATCGTTGATTTGCTTGCTGATTTATTTAACAATTTTCTGCTGTTACTGTT
TAATACTAAGTTACTGTTTGGACTTTATATGGTCTTGACTATCTGAGCGCACACAGTATTTTATTGGGTAATAGCTTTTGAGGAATTGATTGCCCGTCGC
CTCCGGTTCGTCTGGCAGTTCTTAATTAATTCAGAACATGGGTTCTCTGTTAATTCTTTGAATTTGAAGTATAGAGATGGCTGCTGCTTTAATTAATAGT
ATATGTCACTTGCTTAGTCATTTTCTTTATTCTGTGCTTATTTAAAAAGTAGTTAAGTGAGGATCATAGTTTATTTTGTGATACTCCGTGTTATTGTGAA
GTGATTGAACTGTTAAATGTATTATCATTATGTGAACTAGGAAGTAGTTAGGACGAAAGAAGCGGCTGAGGAGAAAAATGGAAAAATGGGAACAAAAAAA
CAGAGTATTCTTGTGAAATTCAATAACAAGAAATAAGCACTGGGGCATTCCAAGAATCTAACTCGGCACCTCTTGCACCCAAAGCGAGAATCATACCACT
AGACCAAATGCCCAGTCATTTTTGCTTAATCTGTATTTGCTGTGTTGGTTTTGTATAAAAAGTTGTGGTTCAAGTCCAAGTCTAGATACTAGTCTCTTAG
GTTGGTTGTTGTGTACTTAGGTTCTTGCATGCTCTCCTTTGAACCCTCAGGCAATCTAATGAGCTCATTAAGGAATGCACTACTTGTGGATTTTGTCAAA
TGTGTTACTGGAAATCCTTTGGAGTTTGACTGTAGCTTCCCCCTTTTCCCGTGCCAACAGAAGTTCAGCAATCAAATCAATGAGGATCGTAGTTTATTTT
GTGATATGCTGTGTTATTATGAAGTAATTGAACTGTTAAATATATTATTATTATATGAACTATGAAGTAGTTAAGGTGAAAGTAAAGTGGTGGAGGGGGA
AAAAAATGGGAAGAAAAAAACAGACAAACACATGTCATTTGTGAAAGTCAATGAACAAGAAACAAAAACCTGGGGCATTCCGAGAATCGAACTCGGGACC
TCTCGCACCCAAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCAGTTGTTTATGATTAATCTGTATTTACTCTGTTGATTTTGTGTTAGAAGTTGTGGTT
CTAGTCTAAGTCAAGATACAAGTCTCTTAGGTTGGTTGTTGTGGAGTTAGGTTCTTGCATGCTCTCTATTGAATCCTCAGACCATCTAATGAGCTCATTA
AGGAATGCACTACTTGTGGTTTTTGTCAAACGTGTTACTGGAAATCCTTTGGAGTTTGACTGCAGCTTCCCTTTTTCCGTTTCCAATGGAAGTTCAGCAT
TCAAACATCTTATATTCAGGCCTTCTACTAATTTACTATTTTGAAAAAAAAAAAAATCAATATATTATTCAACAGGAAGATATTCTTCGAACTGTGTTGA
CCTCCTGGCTTGGATAACATATGCCGTTAGTCACATTCTTCCTAGTTCTTTGATTCATTTTAGAATCATAATGATGTGTATATCATGTTCATTTTACACT
TTGTGATTGAAATGCGCTTATCAAATTTGTTTTTATTAATGACTGTCCTCCTTTGGCTTTATGATGAGCAAAAGTTTTCTGAACTTATTTCCGCCATTTA
TCGATCATATTTTGCTTACAATTTTGCCTGACTTAAGTGTATTTATCACTTCCTGTAGTTTGAATTTCTGGTATAGCATCAGCAAATTGCTAACTCTTAT
TCAAGTTAGACTATTTATTCATCATATTTTTATCTGATCATGCTACCAATATCTGAGAAGTTTCTTGGTTGGGTTTGGATTTATAATTTTAGAACAGTAT
AAACAAATGGAACCTAAACTGAAATCTGTTTGGCTAGTAGTTGCAGTTATATTTCCGCATCACTCAGCTTTTATAACAGCTGGCTAGTTGGCAGCGCCTA
CTTGTATATGTTCCTAGCTCTTTCATTAACAATTTACAAGTGTCTGAATATGATTTGGTTTCACAAATGATGATTGCTCCATTCATAATTGACTTTGGTT
TCTGTAAGTTGATTAAAAAGTCAGTTAATAGGAGAAAAGACAATCAAGAAAATGCATTAACATTTTTAAGAGATGGGGCATTCCGAGAATCTAACTCAGG
ACCTCTCACACCCAAGCGAGAATCATACAACTAGACCAAATGCCCAGACGTTTATACTTCATCTGTATTTGTCATCTTGATTTTGTGTTCGAAGTGTAGT
CCTAGTCTAAGTGTAGATACAAGTTTCATATGTTGGTTGATAAATTTTTTGCATGCTCTCCTTTGAACCCTAAGACAATCCACTAAGCTTAACAAGTAAT
GCACTACTTGTGGTTTTCGTCAAACGGTTTACTGGCAAATCCTTTGGAGATCAACTCAGCTTTCCTTTGTTTCCTTGCTTTGGAACTTCAGCAATAAGTG
TCTTATATTATTAACTATTTTGAAAATTAGAGATCAGTATATTATTCAATAGGAAGATATTCTTCAAACTGTATCGATCACCTGGCATGGGTAACACATG
CCATTGGTCACATTCTTCCCAGTTCTTCAATTCATTTTAGCATCATAATGATGTGTATATCATGTTCACTTTTACACTTCGTGATTGAAATGCCCTTACT
CTTGAGTGAGTTATCAGAAGTGGCTTATCAATTTTGTTTTATTAGTGAATGTGCTTCTCTTTTGATTTTATGATGAGCAAAAGTTTTTTTAATTTATTCC
ACCCATTTTTCTTTCATAGTTTGTTTACAATTTATTGACGGATTTCAATATAGATAGCAGTTTCCGTAGTTTGATATTTGATATACTATCACCTAATTGC
TAACTCGTATTCAACTCAAACTCTGTTTATTCATCATATTTTTATTTGATCTTGCTAACAATATCTAAGTTTCTTGGTTGGCTTTGGATTATATAATTTT
TAAACTTGGTATAAATAAATGGAACCTAAACTCTGAAATCTGTTTAGGCAGGGTACTATTGTGCATTTATGTTTCTGTATCACTCAAGACTCCTTGCTAG
CTGACATTGCTTGCCTGTATATGCTCTTAGTTCTTTTATTAACAATTTACATGTTTCTGAGTTTGATTTGGTTTCATAAATTATTTGTTCCATTCCTATA
GATGATAGGAGAAAAAGGTAACCAAGAAAATGCATTAACAGTTTTTAATATTGGGGCATTCCGAGAATCGAACTCGGGACCTCTCGCACCCAAAGCGAGA
ATCATACCACTAGACCAAATGCCCAATCTTATCTACTCATTGTATTTGTTGCGTTATTAAGTTTGTGGCTTAAGCCAACAGTTATTGTTTTGAACATTTA
TTCTTTTTGTATCTCTCAATATTTTGCAATGAGGCATATTGGGAAAATTATAAATGCAGTCACCACTTAAGGAATAATTCTGCAGTGGATCCCTTTTAGC
ATTACCTCAATGAAACATGTGAATAATCTGCTGAGACTTCAGCAAAAAGGGGCACATTTTTTGAGTTTTTGTTGCAACTTCCCTAGGTTGCAACTTGCAA
GTATCTCGATGATTTTGCTTGCGTAGTGTTTTGACTTTTGATGCATGTAGCTCTAGACGGACAGGCAAAACTTGTGGTTTTGAAACTTTAACTAGCTACT
ACATTTAAATTGCCAACATAGAAAATCTGTAACAGATGCTACAGAGTGGCTACAACTTCTTACTTTCTGGTTGGATCATGGATACTAGTTGTGCAATTTT
GCTGTATTGGTGTCTATTAGAGTGCTTTTCCATTTGGTTGCATATGTTGTTTGATCTGTGGCTGTGCTATGTACACCTTGGTGAGTGGCAATGGATTATT
GTAGTTGAAATAACATGAAAACCAAATATGTATAGTAAAGTAGGAGCATTTGAAGTCTGCATACCAGTAAATATTGCATCTTTGATAAATATTTACTGTT
TTGTATTTGTTTACTTCTTTTCACCAGGCTCTTGGTCCTGTATTTCTGGAACAAACAAGATCTGTTCAATCCCTATGGGTGATTAACGCAGTTCCTGCAT
TCAGAGGCTACATCTAAGATCAAGATCTGCCACTGATTCTGATGCTGCCAATGCTTAATTTTTGCTTTGTCACATACAGCATTGGAGTTATGGTATTCCC
ATTTTTTTATTAATTGTTTTGGTTGTTGGTGCTGCTGCTGCTGCTAATATCTTTTTCATGCTTAAACCTACCATTCAGACCTAAGTCTTACACCTGTGGT
AATAATTGACTTATCCTGAGCATCATCTTTAGCAGTACCTTTTAGAAGATCTCTCTCACACAAATGGCATAAAGATAGAATTGCCTTTCATTCTTATTTT
CTCCTAATAGCCCAAAAACTTTGAAAATAAATAGTTTTAGGATTTAAAATTACTTGTTTGATTGGGGCATTCCGAGAATCGAACTCGGGACCTCTCGCAC
CCGAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCAGCTTGCTGGTCGTTAACATGCTGCTTTATTAGCCTGTATCCATCTTTGCTGAGATGGAAGGTTA
ACTGGTCTTGGATGGTTGATTGGTTACTTTAAGTAATCAGAGACTTTGTTGAAGTAGGGAAAGATAGTGGCTTGCTTCTATGGAGTTTCCTGCTGCCGCC
TCCTTTTTGCTGTTCTCTTTTTCCTGATCAGTTTGATGTTTAGAGCAACTTTGTAAGCCATCAATTGCTGGAGTTTAGAACAAGACTTAAAAGTGGGTCA
ACTACTGTTTGTAAAAGATTGAAAATGGAATAGTATATTGTCAAAAAAGCAGATGCTGTTTAAAAATTACATCTCATCCCACGTGAAGCTAGCCTATGTA
TCAGTTAAACTGGGTGCTTATTCTTCAAATATGTGCCAACTAGGATCTTAATATTTTGTTCCTGTCATGCATGATGTCATGGTGTGTCCTCTGTTTCCTG
AAAATATAATTGGAAAAAATAAAATGTTGCTACTAGACTATGTTTACTAATCGGTTGGGGCATTCCGAGAATCGAACTCGGGACCTCTCGCACCCAAAGC
GAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCAGTTGCTGATAAACCTGCTGACTACCTTTAACGGTATTACAAAGTTTAGTTATTTACTCTATGGTAGTATTT
GTCTGCACAGTTTTAACGAGCAAATTTGATTAGCTATCTTAAAGTGTTGCAACTTTCACTAGATCATTATGGCACTATAGATATATTCAGCATGGAATTA
CCTAAGTTGCATGACTGATGTGCTGAAGGCTGAGATTACAGGTTTTTTGTGTACATCCCAATATGAGTTCTGAGTGTTTGTTGTTGCATGCTGTAAGTCG
GTTCTTGAAACGTTCGATAGAGTTGCATTTAAGTGTGTTATGAGGGACTTCGACGATTGGATCTCTGGTTACGTGTTATGTGGTAATTTAGTGTAAAGAG
TTTTTCTCACTTAAGTTTTAAAGTAACAAGAAATCTTTTTTGTAATAAGATTGACGCTTGTTTTCCAAGTTTGAATTGTATATGTGGTGGTGGAATGTTC
AATTGAGGCATCTAGTTCCGGCCTTCTGCGTAGGTTGGAAACTTGAAATGTATCAAACCGAGGTAAAAATGCAAGTGAAATAAGATATGGGGCATTCCGA
GAATCGAACTCGGGACCTCTCGCACCCGAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCTGTTTGACGGAATTGTTGTGCTTTGTATACTTGTATTTTG
CCCTTCTTGCTTTGTTGGTGATAGGCAAAAAGTACGGTATTAGGGGCTGGAATAAAAAGTGTGTTATGGGGGCATTCCGAGAATCGAACTCGAGACCTCT
CGCACCCAAAGCGAGAATCATACCACTAGACCAAATGCCCAACCTGCCATACAAAATTCGTGCTTTATAATAGGTTGCTTCTACTTCTCGAATGGAGAAA
GTTTTCAAAAATGCCGCTTTTGAGTTTTAACTCACATACAGAGATTATGATCCATTTCCATGGATTTGACGTCGACCATTTCCTTGCTTCTGCCAGAAAA
ATGGGGTGCCTTGTCGGCTGCCTGTCCCCGAGTTCATAGTCCCATGACAATGATAGTTGATTATGGAGAAACCACGATTACATAATCTATGTAATTGAAG
GATATTAAAAAAAACAATAAAAAGAATAAATCATACTGTTTGATTTCAGGTAATCGTTTCTCGCATTTCTAATTTAACTTTTTAAAAATATAAATGGGTA
TTATATACATATTATGTGTGTAAACTTCTTTTTAAAAAAAAATTACAAATATACAACAACTGTCATTGTCGTTTGAATGCAATACAAAAAAACAGCTGTA
CAATACATAGCAAAACCACCAAAAACATTCCAAGAATTTCTACAAAGATTGAAGAAAATGAAGCAATATCCAATATACATAGTTCCTTCCTGCAATCAGT
TTTGCCTAATCAAAAGTTCATGCAATGCTTCCACCCAACTGCCCTTCAC