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Detailed information on CNT30510807


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONSLYT002904, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30635771Solanum lycopersicumCapsicum annuum3.8832.7883.05118reverse complement
CNT3091022Solanum lycopersicumSolanum tuberosum6.8567.5383.65208forward

Expression of CNT30510807

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (83 aa)
MNIIYLSLHKRSKFKKDSMPIFFWVIYGSNFYLLTTLFYDNISLGALKNREEAGLEIIKKIQKRFICASIFILCRSLIFIYIF*

>peptide 2 (61 aa)
VLVTLVFLLNKVNRGEGRGIRLQDGELNIEIMYRIEIEIKYLFEVKVEILRMIVILDQMGD*

Sequence

>CNT30510807
GTCCTAGTGACATTAGTTTTTTTGTTAAATAAAGTAAATAGGGGTGAGGGACGAGGGATAAGATTACAAGATGGAGAATTGAATATTGAAATCATGTACC
GAATCGAAATAGAGATAAAATACCTATTTGAGGTCAAAGTTGAGATTCTAAGGATGATAGTGATCCTTGATCAAATGGGGGATTGATTGAGACGGGAAGC
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TTATCCTTGGTGGCTTCTTTATAATTTTGATTATCGTTTTATTTGTGATAACTATTATTTAGGATGATTTGTCAAGTTATCTATAATATTTTGTCACAAC
TTTCTATATTTTAGTTATTTTTTTCTCTATATTTCTTTGGACTTATTTTTTCTTGAGTTGAGACTCAATTGGGAACTACCTCTTTACTTGTAAAATAGTG
ATAATGTGTATATTCTATCCCTCTAGACTCCACTTATGAGATTACACTGAGTAAGTTCTTGTTATTGCACATTTGAATGATAAATCGTTGTATTAAAAGT
TCAAAAAATGTTAAAATATCATAGTTACGGGTCGCGAG