Detailed information on CNT30337374


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30615958Cynara cardunculusSesamum indicum2.3621.9381.65109forward
CNT30564033Cynara cardunculusActinidia chinensis3.3329.3381.82154forward
CNT30120586Cynara cardunculusCitrus clementina1.926.3585.2388forward

Expression of CNT30337374

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (43 aa)
MEITTFLGRQRSQTLIMVPLFNSSNYFILNWKRNSQNIMVGYL*

>peptide 2 (50 aa)
MMEEGGGASDDGGEVTAERGGGWGAMRVGSGEGGGGKPNREKGHGWKVDI*

>peptide 3 (35 aa)
MCPIGMTALSTRNFFFWYVIAFTPWFSGAAWKSYK*

>peptide 4 (82 aa)
MFLFDDRHRNYTYNVLVLIVVLSKIIYGDYNLLSYQVIVFVLDFFMLVFADFFQIPWPILCYPCCFPFYLTHTHTQGHVVPL*

>peptide 5 (74 aa)
SEGRKPKSFISLVVHLTLCVDFLDHSFAPHLLPCLIDSKFGLCDSKLPSINRMREEDLPGRKNDQIEFVHHLRR*

>peptide 6 (64 aa)
MWVVCNYGTILCLVWDLCCGCLCQVNFFTQTDLCYILHFNQLCFVFVFVFVFVFVFVGYVKEKF*

>peptide 7 (62 aa)
MSITVQHCPKESILEISCLGLHSVCVCLSCCFVSTFFRHIKSVCVCATAATSVLIWAMDVSL*

>peptide 8 (62 aa)
MSVTSICECYRANGLLSLNDKNYTNYTSIASSPAIRNAPHPLCLTSCKIYPELFPLRTSTHG*

>peptide 9 (31 aa)
MEDQMYLSHIYSSKYIFSLSFFLGLSRFFII*

>peptide 10 (31 aa)
MVRCRARTVYSATTSGNIFIQRSYCQKDGKK*

>peptide 11 (34 aa)
QRVESPNRSSHSSFISPSASISWITPSLLICCLV*

>peptide 12 (31 aa)
MKHLRQSLKLYVDMERDVYNMKDIGTPYSVH*

>peptide 13 (30 aa)
MAIFSSITRQCHSEMFINSDQYDYDILPKE*

>peptide 14 (29 aa)
MSIRLALTEFELASTKSELFLMKDEVPEL*

>peptide 15 (51 aa)
MSQYDYTSNPKSMKQIWKTKCIYPIYILPNISSLCLFFWVSLVFLLFKKLF*

>peptide 16 (47 aa)
MRYLINIYVINMFCFMISVVLMLPFIMDMVIVMKMRPGYRFEILLLK*

>peptide 17 (37 aa)
MAYFVLPLLFSILSYTHTHTRSCSSFITWFMCVLCPL*

>peptide 18 (43 aa)
MVGKWISDLGKHDFLAVLVSDRSTPWSVLGQHLGRFSVRMVFW*

>peptide 19 (56 aa)
MNAYKHRAQNWQIRQIILQFKPPMKVAVQLQIFVQMSSRFKSMSAAMELINQLLLR*

>peptide 20 (56 aa)
MFECQSLSNIVQRNQYLKSAVWDCILSVCVCLAVLFQHFLDILSLCVFVLLLLHQS*

>peptide 21 (35 aa)
MQLWYNSMLSMGFVLWLLMPSEFLYPNRPVLYTAF*

Sequence

>CNT30337374
GTCAGAGGGTAGAAAGCCCAAATCGTTCATCTCACTCGTCGTTCATCTCACCCTCTGCGTCGATTTCTTGGATCACTCCTTCGCTCCTCATTTGTTGCCT
TGTTTGATCGATTCCAAATTTGGGTTATGTGATTCCAAACTCCCAAGTATAAACCGTATGAGGGAAGAAGATTTACCAGGGAGAAAAAACGATCAGATCG
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AAATTGGCTTTGTTGCGTCATAGAAGCTAAATCGTGATGGTTGTAACTCAAAATCAGAAGCAAAAAAAGTTAAATATGCCTCAAAATACGAGATAATATA
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TCCCAAGTTAATGAAAATAAATTGAAATGCACCTAAGTGGGCCTGAATTACCAAAGAAAATACTAAAGTTTTGGTAGTTCTGTTACCAGTGTTAAATATG
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TTAATTCCATTCTACTTCAGACAAAGATATTAATCACACCAAGAGCCTAAGATATATATCTATTGGTTTCCCTAAATAGATCTCAGTTACTAGTTTAACT
TGTAGCTAGATGACAATTAACATTGCTGATTCTTGTCGTAACATATATATATTTCAGTTTGTTTTTATGCCATGTATATTAGTAATTTGTAAGTGAATTT
GGGTCCTTTCCATGCTCATCCCTAAGGTAAGTGACACCGGTAAGCGTTTGGTAAACGACCCCTTATTCTAACCACATCAATTCAGTGTTCATTTCCCAAT
TCAGCGTTTGGTAAGCTTCAATTTAAGCAGACTTTAATTTGCCACATGAATTGCACCATATGCCTTTGTGATTGGTGACTTTTGAGAAAGTAATCATTTG
GTTACTTTTAAAGGTGACTTTTGAGAAAGTATACATTATGATACCAATATTCTGAAGTGTATTATAATACTAATTTGCAAAGTACACGTAACTTCTTACG
TTTTGATGTTTTGATGTTTCAACTTAAGACTTATGTTTTGAAAGGATGTGGTGATCCATAATGTGTCCAATTGGCATGACTGCATTAAGTACACGTAACT
TCTTCTTCTGGTACGTTATAGCCTTTACACCTTGGTTTTCTGGTGCTGCATGGAAGTCTTATAAATGAGTAAACCTAGAGGGAAGTCCTGAACTCGATGC
TTTAGTGCATGCAGCAGTAGCTTTTTCTAATATCTGGAAGGTGCATTATTGTGCCTAATTTTTTAGCATTACAGTAGCAGCAGCAGCCTGATGCAAATCA
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GTGTGTTTGTGCTACTGCTGCTACATCAGTCCTAATTTGGGCTATGGATGTTTCTCTTTGATGATAGACACAGAAACTATACCTATAATGTGTTGGTGCT
CATTGTTGTTCTTTCCAAGATCATTTATGGTGATTATAACCTTTTAAGTTATCAAGTTATTGTTTTTGTTCTTGATTTTTTTATGTTGGTATTTGCTGAT
TTCTTTCAAATTCCATGGCCTATTTTGTGTTACCCCTGTTGTTTTCCATTTTATCTTACACACACACACACACAAGGTCATGTAGTTCCTTTATAACTTG
GTTTATGTGTGTGTTGTGTCCTTTATAACTTGGTCATGTAGTGACTGCTCTCAATTTCACTGCAACATTCCCAAAATAAGATAAAAAAATTAATAGAGGA
TCTTGTTTTGATGAAAATTTTAACCTGATATACACATGAGATCATGAAGCATTTAAGACAAAGTCTAAAACTATATGTAGACATGGAAAGAGATGTTTAT
AATATGAAAGACATAGGAACTCCATATTCTGTCCATTAAGTTTGCACATGTCCGTTACAAGCATATGTGAATGTTATAGAGCTAATGGTCTATTAAGTCT
TAATGACAAGAATTATACAAATTATACATCTATAGCATCTTCTCCCGCTATAAGAAATGCCCCACACCCACTTTGTTTGACGTCATGTAAAATATATCCT
GAATTGTTTCCTCTTAGAACTTCCACACATGGGTGAGGTTAGTGCCCTACATCACTATGGCCATCTTTTCCTCAATCACTAGACAATGCCACAGTGAGAT
GTTTATCAATTCTGATCAATATGATTATGATATACTACCTAAAGAGTAAAGTTCACTTAGATGTAAATATATAGCCATGTCTCAATATGATTACACTTCT
AATCCAAAATCTATGAAACAAATATGGAAGACCAAATGTATCTATCCCATATATATTCTTCCAAATATATCTTCTCTCTGTCTTTTTTTTTGGGTCTCTC
TCGTTTTTTTATTATTTAAGAAGTTATTTTAACATAACTGCTTGATCAATTTCTTTTTAAATCTCTAAAGTTTTTAAATCTCCATGGCTTCTTTCCCTTG
TATTGGTTCATGGCATTGAGGTTGACAGTAGCCTCCTCCTCACTCTGACCACCTGACAAGAACATAGCAGCTGGGACAGCTGGTGGCATGGTTCGTTGCA
GGGCACGGACTGTGTACTCTGCCACTACTTCGGGAAATATTTTCATTCAGAGAAGCTACTGCCAGAAAGACGGAAAGAAATAACTGATTATGAACGCATA
TAAGCACCGTGCACAAAATTGGCAGATCAGACAAATTATACTCCAATTCAAACCTCCTATGAAAGTAGCAGTACAGCTTCAGATATTCGTGCAAATGTCA
TCCAGGTTTAAATCAATGTCTGCAGCCATGGAACTAATTAACCAGTTGTTGTTAAGATGAAGGCACATGCAATAGTAAATCAGTTGAAATAAGGAATTAC
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AGCCGAAAGGGGAGGAGGATGGGGAGCGATGAGAGTCGGGAGCGGTGAGGGAGGGGGAGGAAAACCTAATCGTGAAAAGGGGCATGGTTGGAAAGTGGAT
ATCTGACCTGGGTAAGCATGATTTTCTTGCTGTTTTGGTAAGTGATCGGTCAACACCTTGGTCAGTTCTCGGTCAACACCTTGGTCGGTTCTCGGTCAGA
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CGAGATGTCTATTAGACTTGCTTTAACGGAGTTCGAGCTTGCTTCAACCAAATCCGAGCTCTTTCTTATGAAGGATGAAGTCCCTGAGTTGTGACAAATG
GTGAGGTCAATTGTATCCGGCTGGTAAGTTCCAAGTTTTTCATCTTCATTAACTGTTCAAGACCAAAGTTTGGAGACTCAAGATCGTTAAACATGCTATG
ATGATTTTGGATGTTTTTTTGTTGATAAATTTAGACGATATATGAACTAGTTGAAGATTAAATTTGGATGGTTCTTATATATATTAAATTGTTTTGAGAT
TATTATTAATTTGTTCCTGATTAA