Detailed information on CNT30335891


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30515578Cynara cardunculusJuglans regia2.423.7487.580forward
CNT30152144Cynara cardunculusPrunus persica1.4422.5410048forward

Expression of CNT30335891

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MWQFFTALLTQSTHFLLKXCNMNFCILQL*

>peptide 2 (32 aa)
MSCSSSLRVIHTLSFLSPMERSGPGNQVLICL*

>peptide 3 (32 aa)
MNLLLREPIFEWPIDWFLWWFKECMYKTWWVS*

>peptide 4 (33 aa)
MMESVRFHPLDSFIGNTSDIQWMIRWXXIXPVC*

>peptide 5 (42 aa)
PNPNRSGINHSAASRRESHPPATMSRLHPPLSLPSLPLSAEV*

>peptide 6 (65 aa)
MLEPYKICQSELEQNHLIVLKPNMESTSLIDNHNFILALTLSITKCTIEQKTTVIYILFNNIINP*

Sequence

>CNT30335891
CCCAATCCTAATAGAAGTGGGATAAATCATTCAGCCGCTTCCCGTCGTGAATCACATCCGCCGGCGACTATGAGTCGATTACATCCGCCCCTGTCCCTGC
CCTCACTGCCGCTGTCTGCCGAAGTCTGAACGCCGAATGCTGTGAACGGCCTTTCTAGTAAATCGCCGTTACTTACATATTTTCACTTATGCTAAATTGG
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TCCTTTTTGTGAGTAACATAACATGGTATGTGAATATGAACCTTCTTTTAAGAGAACCAATTTTTGAATGGCCCATTGATTGGTTTTTATGGTGGTTCAA
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CATATTCAATCTCATTTCCATTTCTATTTTTTAAAATGAACTAGTCGCCCCCTTTATGGTTGAATAGCAACAATCCTAGAAGGATGATAATTCTAACTTT
CTSAAATGTTGTACTCTTATAATTTAATTTAAGTGCATTAGTTAGACCTAGGTTTCAATGATATATGCTGGAACCATATAAAATATGTCAATCCGAATTG
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TTTTTGAAGAGATAAGATGGTATAAGAACATTAATCACCCCTAAATCGTATGAAACAAGAAGATTTTTTACTTGTAGCTCATTAAGTCGATGGTCATTTT
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TGGATGTTGGATTTTGCCAACCGATCCTATCCGATTAACATTGGATAACCGATCCAATCCATTTTTGTTCTTTCATTCCACTCATCTTGGGGTGGGCTTA
CTACTTAGATGCTGCCAATCCGATCCAATTGATGATGGAATCGGTTCGGTTCCATCCATTGGATTCTTTTATTGGAAATACATCGGATATCCAATGGATG
ATCCGATGGGRTTRGATCYATCCAGTGTGTTAATTCAATCCAATTCTTTAACAATGATACAAATTAATTAATCACTTTTAATATGTGTTAAAACCAACAC
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TGGACCTTCAACCAAGCATTCTACCTTTGTCGAATCGGAACCAATACCACTGTGTCCGCCCTTAGGTCGCCAAACTACGACAAAAGTTTCGCAATAATCC
ACAAAATAGTAATAGGAATTAGACCTAACACGATTTCTAATGTCTGTTGGAGCWAATTGAATGATTGGGCTTGTTTGATACGTTAGGTTGGATTGTTGAG
AAGTTAATAATGTCTTGTTCTTCAAGTTTGAGAGTAATTCATACTCTATCTTTTCTTTCTCCAATGGAAAGAAGTGGGCCTGGAAATCAAGTTTTGATTT
GTCTATAGACTAGTGGTGTTAATTGCACGGATATTAAAC