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Detailed information on CNT30274936


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30655402Chenopodium quinoaRosa chinensis3.4221.7698.6574forward
CNT30621619Chenopodium quinoaCajanus cajan2.3122.9410050reverse complement

Expression of CNT30274936

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (45 aa)
MTSLIISQTYLHNVANVQSLRKEIFLVVSDTNLLEIRKQNKRRKR*

>peptide 2 (40 aa)
MEIVVTFCMMFVISAVATDSKSVCFLFYSSIIIFNNNLIS*

>peptide 3 (37 aa)
MILTIINIRKRIKGIILLIILNIKVTLYMILGIKITI*

>peptide 4 (29 aa)
MQPQTLRLNVSPISYDIFYIFFVKQYLYI*

Sequence

>CNT30274936
TGAAAAAAGTGACGAACCCATTTCGGTCATAGGTTAGTCCAAAGAACGAGAGTCGGCTTCCTTAAGTCCGTTGTTCCTCAGTAGCTCAGTGGTAGAGCGG
TCGGCTGTTAACTGACTTTCAGTAAAATTAATTTCAATTGAGTAAAAATAATTTAAGTTCAGCAAAAAAAATTTCAATATAGTAAAAATAATTGCAATTC
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GGCACCAAGGCCTGGGGTTGGACGCCAAAGTGGTTTTCCACGCGTTTTCGAAAATCTGATAAATTTCCTGTACTAGAAGATAAAATAATATTACAATCGT
TATAAATGTTTAACTCATTTTCTTAAAAAAAAAAAAAAAACAAAAAAGTGCATGCAACCTCAAACTCTTAGATTAAATGTTTCACCAATAAGCTATGACA
TATTTTATATATTCTTTGTCAAACAATATTTATATATCTAGTGTTGAAAAGGCTTTTCGTATCAATTTTTAGGATTTAGTGGCGATTGTAAATGATACGA
TGATATGACATCCTTAATTATTTCACAAACATACTTGCATAATGTAGCGAATGTACAATCGCTACGAAAAGAGATTTTTCTTGTAGTGTCTGATACCAAT
TTGTTGGAAATAAGAAAGCAAAATAAAAGAAGAAAACGTTGATAAATGCTACTGCTTTTCTCATTCAAATAAAACAACTAAAATTACTAACTTTGAAGCA
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TGATTATTGGCAACAAATTCTGATTGTGACAATTTTGAATAAATGTTACCAGTATAATAAAAGTTGAATACATAAATCTAGATTAAGTTTGTGAAAATTC
TCCAAGTAAATTAGCTTTACAAACAATAAGCTAATTAAGCTTGACAAAAAAATATGTAAACAACTTTGTTTATGGGTATAAATGTACAAGACAACTAACA
TTAATGCATGAGAGAAAATATGTACATAATTAAATATTTTAGAGGGTATAATTGTCCAAACACTATTCATTAAAAAACTTTGTACATATTAATGAGGGTA
TATATGTAGATACACATTTTAAAGGGTATAATTGGCATTATACATTAATTAAGTTGTAATTAGATGAACTCCGATTTTTTTTTTTCTTCTTTCTTTGGAC
TCAATTGAAAATAAGATGAACATATAATACGAGTAACACGTAAAGTCGAAAAGGAATGTAATTGACTGATTGCAATATATACGTGTGTACATGTACAGGT
TCCTGCATATGCATTAGCACACATAACAGGAGCAATATCAGCAGCATTTACGTTGAAATACTTGTTACACCCAATAAAACTACTAGGCGTTACCACTCCT
TCTGGAACAACTCCTCAAGCTTTGATAATGGAGATTGTTGTTACTTTTTGTATGATGTTCGTCATTTCAGCCGTTGCAACTGACTCCAAATCTGTATGTT
TTCTTTTTTATTCTTCAATCATTATATTTAATAATAACCTAATCAGTTAAAAACACGAAACG