Detailed information on CNT30267807


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONBNAT005910, E-value = 2e-45

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30438126Chenopodium quinoaAegilops tauschii8.4830.990.53169reverse complement

Expression of CNT30267807

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (34 aa)
MVLRSDFLASFCLFNFIYWLFIYSIMYIFLILDE*

>peptide 2 (30 aa)
MPKENNTASPSLLLTIISLHRVSQIGPCAL*

>peptide 3 (42 aa)
MIFWGEVIVYSLHVLISVTLTKCGRILISVTLPFFFWQKATF*

>peptide 4 (52 aa)
MSKCNIFYVSNIISYIHSNYCCTNQNHTVLTTSICPKKITCNSIIDVSKYFLY

>peptide 5 (71 aa)
MKAEFIRRMIDSVMLKGAKNLIGDVAATIASVGAAIIGSFLALAGATWSLDLTFLLLSAYLILSIGYLYIV*

>peptide 6 (35 aa)
MYFIVGLYLPQVSNVHYLLLQFSNTSTTSPTFYFI*

>peptide 7 (39 aa)
MSIIFFYNFLILQLLHLPFILFKSIILPKTMCRSKSNTN*

Sequence

>CNT30267807
GTGAGGTAACTATTTTGGGGTAAATAATTTGTTTAGGGGTGAGGTAATTGTATATGATTTTTAAGGATGATCAGATTCTTTATGGGTGAACAAACTATTT
AGGAGTAAACAATTTATTTAGGGGTGAGGTAATTGTATATGAATTTTAGAGGTTAGCAAATTATATAAAGGTGAACAAATTTTTAGAGGTAATTGCATAT
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GGGTGAGGTAATTGTATACTCCCTCCATGTTTTAATAAGTGTTACACTTACCAAATGCGGTCGTATTTTAATAAGTGTTACACTTCCTTTTTTTTTTTGG
CAAAAAGCTACATTTTAATATTATATTTTTCTCATTCATAGTCCCCACCCAAACCCACCACATTTTTTTTTATTATTTCTTTTCTCTCACATTTATCGCT
TTTCAATAAACTATTATGGCTATGGATGATTAATTTAATGCTCTAACTAAAAATAAGATGTGGGATTAAGTGCCCCGTCCTTTGGTCTAAGTGGATTTTC
ATACACAAGGTGGATTTTCATACACAAGAAAAAGGATGACGGTCCTTTTGAGAGGCATAAAGCCAGACTTTTAGGTGTGATGGTGCAGGTCAACAAGTTG
GCGTGGACTGTGGAGAGACTTTTAGCCCGGTAGTCAAACCGGCCACCATATGATTTGTGATAAGTCTTGCTCTCTCTAAATCTTGGTCAATTCATCAGTT
GGATGTAAAGAATGTCTTCTTACATGGTGAATTGAAAGAAAATGAGACCAAAGAGCCCCTCCTTACCACTTTAGGGGGTGGGGGTGAAGGGGGGTTTACA
TTCAACTGAGGCAAAGTGCACTATACGAGGGAAATGAAAGCAGAATTCATTAGGAGAATGATTGACTCCGTTATGTTAAAAGGTGCAAAGAATTTAATAG
GTGACGTGGCTGCTACAATTGCTTCGGTAGGAGCTGCTATAATTGGTTCTTTTCTTGCTTTGGCGGGAGCTACATGGTCCTTAGATCTGACTTTCTTGCT
TCTTTCTGCCTATTTAATTTTATCTATTGGTTATTTATATATAGTATAATGTATATCTTTCTTATTTTGGATGAATAATCGCCCTCTTTTGATAGTTATA
CGATTCCATAAGATGATCTAGAATTGGGTCAATCATGTTTATTAGAAGTGGACAATAGTGGTTGTACCAGCCAAAACTCATATACGTATCATCATTATAA
CACCTAGCTGATGTACTTCATAGTTGGGTTGTACCTTCCTCAGGTGTCAAATGTCCATTATCTTCTTTTACAATTTTCTAATACTTCAACTACTTCACCT
ACCTTTTATTTTATTTAAATCAATTATATTGCCTAAAACTATGTGCCGTTCAAAGAGTAACACTAATTAAACAAACGGAGGGAGTATGTTTTTTGTAAGG
GTGAGCAAATTATTTTTGGTTGAAGTAATTCGTTTCTTTTTAGGTGGCACGTTCAATTTAGGCACACTTTAAGGAGAAGAGAAAGAGTGTTAAAGCTAAA
TTTTGCCATGCTTAAGTGTTGCATACACTTGCTATGTCCAAATGTAATATATTTTACGTGTCAAATATAATTTCATACATCCACTCAAATTATTGTTGCA
CAAATCAAAACCATACAGTCTTAACAACTTCGATATGCCCAAAGAAAATAACATGCAACTCTATCATTGATGTTAGCAAATATTTCTTGTACC