Detailed information on CNT30267382


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONCQUT007317, E-value = 3e-73

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT3042841Chenopodium quinoaPrunus dulcis4.1521.382.64121forward

Expression of CNT30267382

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
MIMPPKLLQTSYSIENYKFTILQFHVYLLLFFNVL*

>peptide 2 (40 aa)
MLFDYILLIFFYCKKNKKVIVFLNCYSSIMIFLSLFEECT*

>peptide 3 (40 aa)
MVKFKDLGSSRISASSWIVLLQMKFFLLRRLLIKYAMYLV*

>peptide 4 (49 aa)
MVVQVSISTSNVFISGHHSSSFLSPWPFSRISFHQSCSSGSLAIMSSDL*

>peptide 5 (49 aa)
MDCIASDEVFFIKEIVNQICDVFSLKVCTYSGILIFLGITCKCCLTIFY*

>peptide 6 (56 aa)
MKPKQCMKTCIKTCIKQCIKTNNALSKCHTKTRDIETEILCSSSNIISDESTTTFK*

>peptide 7 (31 aa)
MSSFLATTPRLSCHHGPFPGFLSTNLVVQDH*

Sequence

>CNT30267382
CAACAATAAAATCACAATCAAATAAAATCAGAATAATGGGTATCATAAAAACACAAAAAATGGGTTTATAATCAAAGAAAAATAGAACAAAAGATTACAG
AAAATTACCAGGATCAGTATTTGTAAGTTGTAGAATGCATAAAGACTTACTTAAAAACATAAAGGGAGGTGAAATGTGACATGGGGTAATGAGTGACTTG
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CTCCTCGTCTTTCTTGTCACCATGGCCCTTTTCCCGGATTTCTTTCCACCAATCTTGTAGTTCAGGATCATTAGCAATCATGTCATCAGATTTGTAGTAA
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AGCTTTCCGGGTCCTTGACTGCCATACCTCTGTGAAAAAGGCAGTGAGGTACTAAATATGTTAGTATAACAATCACATTAGCTTGTCATAAGGACACCAG
AACAGTAGCTTATGCT