Detailed information on CNT30145848


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30708325Medicago truncatulaGlycine max11.0424.0981.82132forward

Expression of CNT30145848

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (36 aa)
MVVSRSLLMVGLMVLLGLKGLLVVSRSLLTEGLMVL*

>peptide 2 (34 aa)
HVPVPVGDGAGRKGGVGKVGVNGVPGSIGGLPLP*

>peptide 3 (51 aa)
MGLDCNFHHLTVVMELDCNFHCLKGVMMIHDHGHGHDDYDRDRDREKVKTH*

>peptide 4 (38 aa)
ACTSTSGRWCRKERWCGESGGQWGARIDRGATTSISWW*

>peptide 5 (64 aa)
CMYQYQWEMVQEGKVVWGKWGSMGCQDRSGGYHFHKLVVSCSTLLMEGLMVLLGLKGLMVLLGL*

>peptide 6 (53 aa)
MELECNFHQWVVMGLDHNFHRTGEMTVLDCNFHHHLVMGLDQNFRHHLRVVMG*

Sequence

>CNT30145848
TGCATGTACCAGTACCAGTGGGAGATGGTGCAGGAAGGAAAGGTGGTGTGGGGAAAGTGGGGGTCAATGGGGTGCCAGGATCGATCGGGGGGCTACCACT
TCCATAAGTTGGTGGTGAGTTGTAGTACCCTCCTGATGGAGGGTTTGATGGTGTTGTTGGGGTTAAAGGGTTTGATGGTGTTGTTGGGGTTATAGGGTCT
TGTGGTGGTGAGTTGTAGTACCCTCCTGATGGGGGGTTTGATGGTGTTATTGGGGTTATAGGGTCTGATGGTGGTGAGTCGTAGCCTCCTGATGGTGGGT
TTGATGGTGTTGTTGGGGTTAAAGGGTCTGCTGGTGGTGAGTCGTAGCCTCCTGACGGAGGGTTTGATGGTGTTGTAGGGGTTATAGGGTCTTGTGGTGG
TGAGTTATAGTACCCTCCTGATGGAGGGTTTGATGGTGTTGTTGGGGTTATAGGGTCTGATGGTGGTGAGTCGTAGCCTCCTGATGGAGGGTTTGATGGT
GTTGTTGGGGTTATAGGGTCTGATGGTGGTGAGTCGTAGCCTCCTGATGGAGGGTTTGATGGTGTTGTTGGGGTTATAGGGTCTGATGGTGGTGAGTCGT
AGCCTCCTGATGGTGGGTTTGATGGCGTTGTTGGAGTTGAGGGTGTTGTTGGGCTTGTAGGATCTTGTGGGTGGACAGTCGCTAGCTGGGGGTGTCGATG
GAGTTGGAGTGTAACTTCCATCAGTGGGTGGTGATGGGGTTGGATCATAACTTCCACCGGACGGGGGAGATGACGGTGTTGGATTGTAACTTCCATCACC
ACCTGGTGATGGGGTTGGATCAGAACTTCCGCCACCATCTGAGGGTGGTGATGGGGTAGGAGTTGACGGGGTCGGAGTGTAACTTCCACTACCTGATGGT
GTTGATGGGGTTGGATCAGAACTTCCACCACCATCTGAGGGTGGTGATGGTGTAGGAGTTGATGGGGTTGGACTGTAACTTCCACCACCTGACGGTGGTG
ATGGAGTTGGATTGTAACTTCCACTGCCTGAAGGGGGTGATGATGATCCATGACCATGGCCATGGCCATGATGACTATGACCGTGACCGTGACCGTGAGA
AGGTGAAGACCCACTAGAGGGTGGAGTGCCACTGCTACCACAACCACCTCCAGAGTGGTGAGATGGTGGACTATGTGAACCTTCAACAATTCAAAA