Detailed information on CNT3099946


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT004434, E-value = 6e-118

Expression of CNT3099946

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (86 aa)
LGFLSLFLRPPEGSPTAALAPPWPHPAPPAALCSPPFAKRRLDFDPPKPWPPLPAFRSPFGPHRAASPPGPRPGDRAAVDVRRLPP*

>peptide 2 (78 aa)
SVSFPFSFALRRDRQPPPSHPHGPIPRRPPPFALRPSPNAALTSIPLNPGHRCPRSGRRSDPIAPRRHPDRGQEIEQR*

>peptide 3 (68 aa)
MSWITNLIYCQLGKYRDKNLFTSGLEICLSNSLQFFSAKFIFSDLFLFSFHSISMKVIYFSVRGNLVS*

>peptide 4 (49 aa)
MIGFPLFMHQEFVLDDQIAEFLCPRSIYFLMRELYGLLGVKINSVSILD*

>peptide 5 (44 aa)
MIQSNLWPLTWFSAICHDLLLGFMCLTCSPQIEGKNACPPTRSG*

>peptide 6 (43 aa)
MSGSANLQNNQDIFHSHMDHKYASDPFAIPEISLKESIANHVL*

>peptide 7 (41 aa)
RFPFPFPSPSGGIANRRPRTPMAPSRAARRPLLSALRQTPP*

>peptide 8 (40 aa)
MPLPSNPISFKRQVAAAATRFSTGHVKALHEMRGRLNDGG*

>peptide 9 (39 aa)
MHLILLQSLKFLLKNQLQIMYCSFLRSVGPLPNISKYVI*

>peptide 10 (37 aa)
MLRTCHLCMGLVCVGAKLPDRVVPGKSGALFSYLFTL*

>peptide 11 (37 aa)
MVKYSKVLGLYPEGNHPISSNKLVSISYKSIWFCRCV*

>peptide 12 (29 aa)
MEYSITAISRLDSMILLNGEILKSIGAVS*

Sequence

>CNT3099946
CTCGGTTTCCTTTCCCTTTTCCTTCGCCCTCCGGAGGGATCGCCAACCGCCGCCCTCGCACCCCCATGGCCCCATCCCGCGCCGCCCGCCGCCCTTTGCT
CTCCGCCCTTCGCCAAACGCCGCCTTGACTTCGATCCCCCTAAACCCTGGCCACCGTTGCCCGCGTTCAGGTCGCCGTTCGGACCCCATCGCGCCGCGTC
GCCACCCGGACCGCGGCCAGGAGATAGAGCAGCGGTAGACGTGCGGCGTCTTCCTCCTTAATCCGTCACCTCGGTTTCTTAGTTCCTCCCACCATGCCCC
TCCCTTCCAACCCTATCTCCTTTAAGCGCCAAGTCGCCGCAGCAGCAACGAGGTTCTCAACGGGGCATGTTAAGGCTCTGCATGAGATGAGAGGTCGACT
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GGTAAATCTGGAGCTTTATTTTCATATCTATTTACTCTATGAACATTGTCAAATAACTAACTGAATTATATGTTTTGCAAGCATGCTAAGGAACCATTAA
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TCCCCGTATGGCTGTATGGCTAATTTGTTTTTAAAGGCAGTCTGACGGTAATTGTACATTTGTACTGTCATAAACTCATAATCTATGGCCTGCAGAGACG
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TTAGCCAGCTATAGGATAGATATAGTAGGTTGACACAAAACGATGGAGTATAGTATAACTGCAATCAGCAGGTTGGATTCTATGATATTACTAAATGGTG
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GATCCATGGAAGAATCGGCCACTAAAGTCTAAACTCTGAAATAAGGTTTTTGGTATATAGTGGCCTATATATTCTGCACGTCATAGATCTTTCATGTCAC
AGTATTTATGTAAAGGTTGATTAGTACACAAGTACACATACCTTTTTTGTTATCTTGTAGCATACAAAGTTTACACTTAATCACTACACAAAAGCACTTA
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GTGCGGCACCGCTTGGATAGATGGAAGCTGTTTCTTTTCCTCCGCTAATCACACTTGGATACTCTGGTTTATGGCAATAATGAGCAACAGGGCAGCCACG
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CTGAGGTCCGTTGGTCCATTGCCAAATATTAGCAAATACGTTATTTAGTCAGAGTTATGGTATCCTTGAAGGTTCAATGATTGGATTTCCTTTATTCATG
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TCAATTCAGTTTCTATCCTAGATTGAGCAGAGTTAACATGGTCCATTTTTTTATCATAAATTCATGTTTTCCTGTCTAATATTTTTTTTGCTACCAACTG
CATATTCAAATCAACTGTAATTTGATTGCACCATGAACTGCATAGCATTAGCATGATCCAATCTAATCTATGGCCTCTAACATGGTTTAGTGCAATCTGT
CATGACCTTCTGCTTGGTTTCATGTGCTTGACATGTTCTCCTCAGATTGAAGGAAAAAACGCATGTCCTCCCACTAGGAGTGGTTAGTGGTTCATTCTTG
AGCATACCAGAAGAAACACGTGCGGTACCACGTGATTATCACTGGCTTAACTCTTTATGTAATTTTTTGCTTGAACCTTAATCCCACCCCTTCTATGGGG
AAATGTAATGCCTTTAAAATATCAAATGTCACTATGACGTTATATCTTTTTCAATTTGAGTTATCAATTGTC