Detailed information on CNT3099472


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30690669Oryza rufipogonOryza sativa15.1471.8998.15918forward

Expression of CNT3099472

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (54 aa)
MDSCLKLCVLTSLSVSHLISLSLFLPHVLYCSLISIFFEVVIYLSKLSCLIICV*

>peptide 2 (92 aa)
MLYPFGFGGSIKLICVNDLFSSKKTSSESVLFFRAAEHVCSVPDQYLCTITCQLLRAFTKKFQLFGETTHLLTQGNKAFFGTRNKKQIISSL*

>peptide 3 (41 aa)
MFIIICIGPFHRSSFCHPSRKGGWADLLGKENQSDGKEHWI*

>peptide 4 (42 aa)
MGFGGLTEESEHTRCFLSMQEPCWELCVLTLYLSAVHHAQYD*

>peptide 5 (45 aa)
MGQQQLSIKLVPEKCKSYKWLTGYLSSRNGLVWFGIMSDVLLVLK*

>peptide 6 (45 aa)
MISSSEEATTSYLASCLTLLGLCFCVLVGVVRRKRGVRGEADRRE*

>peptide 7 (40 aa)
MLNGLMLEAMCAHFSLCQPFDLSFSLSPSCVILFSHIYLL*

>peptide 8 (41 aa)
MDGFVWRVWLWPSISLLLYLSIILSLHCATVLLCSCFSLRG*

>peptide 9 (31 aa)
MQAHARRMDGPVHMCEKGSSTFLRPIQIIGP*

>peptide 10 (29 aa)
MYNGLIRFSGKYFFYLASSGLHPFGAISV*

>peptide 11 (34 aa)
MTRHFCCVSWCGVFMSTRNQKYFHMFLHKKHVLH*

>peptide 12 (38 aa)
MHSTHHASLNKIWPGNICWLSKKSCFIFPFFFLNTMAS*

>peptide 13 (39 aa)
MVWFGLASCRMYFWFLNSTLSVFFNYKSFCFLIFYLINL*

>peptide 14 (39 aa)
MDEHKTGGPHHTSHQSHPTSKISSEFSQSFVVFFYTNHS*

>peptide 15 (32 aa)
MELRAFYGCESPNMYQTLFSPPRQMIFLKTFW*

>peptide 16 (31 aa)
MSRRCMQRYFPRSLYYCRYMRVTIVHKPCIL*

>peptide 17 (37 aa)
MHNHIGTDFRINAYRDYLLFVTMCYLLFLKHGAINLL*

>peptide 18 (38 aa)
MICFLPRKLHLKVFFSSEQQSMCAVFLISTCVLLPVNC*

>peptide 19 (29 aa)
MSASRFFISSIYLNQTVEMIVSTNLVRKI*

>peptide 20 (29 aa)
MNIKLVVHTTRVIKAIQHLKFRLNSHNPL*

Sequence

>CNT3099472
CAACAGTAATGTTCTACAGTTAGTGAGATGTAGAGAGAGATATGGCTAGCTAATCCATGAGAGAGATCTAGATAGAGAGAGGGAGAGATGATCAGTTCTT
CAGAAGAGGCTACTACTAGCTATCTAGCTTCATGTTTAACTCTTCTTGGTTTGTGTTTTTGTGTGCTTGTTGGAGTTGTTAGGAGGAAGAGAGGGGTGAG
AGGTGAGGCTGACAGAAGAGAGTGAGCACACATGGTGACTTTCTTGCATGCTGAATGGACTCATGCTTGAAGCTATGTGTGCTCACTTCTCTCTCTGTCA
GCCATTTGATCTCTCTTTCTCTCTTTCTCCCTCATGTGTTATACTGTTCTCTCATATCTATCTTCTTTGAGGTAGTAATATACTTGAGCAAATTAAGCTG
CTTAATTATTTGTGTATGATGATCAGCTGCTGATCCGGCCTCATTTCTTGCATATATGAGATCAGTTTCAACCACAACCACATACATGCTTGTTCATTTT
TTTTCACAAAGAAAGAGAACAGTTTAATTTAATTTCTTGGGGTTTTTGGATCAGTTAATTTGTCTTGAGAGGGGAAGAGATCTCTATGGGTTTTGGAGGT
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TGATGAGCTTGCCAATATCATCTCCACGGCAAAACACAAACTAGCTATGATTTGATTCATTATATTTCTTTTCGCTGTTTAATTAATTATATGCAGGCAT
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TGGCTGTCAGACTAGATCATCTCTGAATGATCAAGAGCCGGATCAAATAATTATTGTGAGCACCGAAATCGATCATGCGTACTCTCTCTGTGAAGTATTT
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ACAAGTTTACATTATATTGTAATTGGAATCTGTTGCAAGTACTATATACTGTTTTTTTATGCATAGCAGTTGAGAAATAGAATCCAATATACTTGTGCAA
GTTATTCTATGCCACCTTAATTAATTACTTCTTCCTAGTAATGAAGTGCTAGCTTCGATCTTTCAATATTACCTGTCAATCTTAATTTATACTTGTTTAA
TTTGACTGTAATTTGCCAGCTAGAATTAAATGTACATTAAATTGAATTCTTCAGTGTTGTTCTTGTGAAGTTAAAATAATTTCTGAACATTCACCCCTCT
ATAATCATTTGTCTATATAGAAAAAGCATGAAGCAATTCTAATCACATGGAGTTGTCTAGATCAAACAATTAATTAATCAATCATCAATCAAACCAAAGA
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TCTGCTATTTGTGACTATGTGCTATTTGCTATTTTTGAAACATGGAGCAATTAATCTGTTATAATAATCGGATCGGATGAACAAGTTGAAACAAAAAGGG
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TGAAAGTACCCAAGAAAAAAAATCGAAAAAGAAGCCCAAGTTGGGGCAATGCAGGCACACGCACGGCGGATGGATGGTCCGGTCCACATGTGTGAGAAGG
GAAGCTCCACGTTCCTCCGGCCAATTCAGATAATTGGGCCGTGATAATTCATTTCGCATGACAGTAAGTCTATTTTGCCTCCCTCTTCTTGCTTCTGGTT
GAACCACAGCCCTCAACAGCAAAACCGGGTACAACGTCTCCCCCATCTTCGAAATATGGTGGAAAGGTGTTACACCCGGTTTTGCAGTTGAGAGATGCAA
TTCGATCAGCAGCAATAGTTCAGAGATGTATAATGGACTTATTCGTTTCTCAGGAAAATATTTCTTCTACTTAGCTTCATCTGGGCTTCATCCTTTTGGG
GCAATCTCTGTTTGAGACAGCATCTCAGCTATGCATGGGCCAGCAGCAGCTCAGCATAAAATTGGTCCCTGAAAAGTGTAAAAGTTACAAGTGGTTAACC
GGTTACTTGTCCAGCAGAAATGGTTTGGTTTGGTTTGGCATCATGTCGGATGTACTTCTGGTTCTTAAATAGTACTCTCTCCGTTTTTTTTAATTATAAG
TCATTTTGTTTTTTAATTTTTTATTTGATAAATTTATAGAAAATATTAGCAATATTCACAACGTTAAATTAGCTTCGTCATTACATGTAACTTTGATAAC
ATTTTTGTTTTGTGTAGAAAATGTTGCTTTGTTTGATTAAGAAAAAAATCAAATCAACTTATGATATAAAACAGAGAGAGTGTTCACCCTCTTAAATACA
ACACTACGTACCAAAGTTATAATCATGGAATTGCGTGCTTTTTATGGTTGCGAATCACCTAACATGTATCAAACACTTTTTTCCCCTCCTCGCCAAATGA
TCTTTTTAAAAACTTTTTGGTAGACTTTTCTGGCCTCGGATAAAAGCGTGTACCTTTTACTTGAAGAAAAATAATAGCTCAGCATATTTAAAACACTATC
TACCTTGGCCACGCCCTCCATCATTGTCATTTCGATCCCCCGTCATTCATGTAGAATTCGGGTTGAAAAAACTACAAGCTCCATTTTTTATATGTATGTT
TATCATAATTTGCATAGGTCCCTTTCATAGATCATCCTTTTGTCATCCTAGCCGAAAGGGCGGCTGGGCTGACCTCCTTGGCAAGGAAAATCAATCGGAT
GGAAAAGAACATTGGATTTGACCTATTGAAAATGAGATCAAAAGAAGCACTCCTAATGGTGTCAATGTGATGTTAGTACCCCTTTTCTGCCTAATCTCCA
CCCCAGATTCTCTCCCAGGTTGAGAAAAAGAAGAAAACCTAGAAAAAAAAAGTGGCTTTCTGTGATGGACGGTTTTGTTTGGCGTGTTTGGCTGTGGCCC
TCTATATCACTGCTGCTCTATCTATCTATCATTCTATCTCTGCACTGTGCCACTGTGCTACTGTGCTCCTGCTTTAGCCTTAGGGGCTAATAAAACCTTG
TCAAGTTGCAATTTGTGTGGTGATTATGCTCTGAAAATCTTAACAGTGCCTGGGGTGGCAGGGTCATGACAAGGCACTTTTGCTGTGTATCTTGGTGTGG
GGTTTTCATGTCCACTCGTAATCAGAAATATTTCCACATGTTTCTGCATAAAAAGCATGTGCTTCATTAATTCTTGAGAAATGTCGAGCTAAACCAGGCT
AATAATTTGTAACAACGCAATGTTATTTAACATGTGTCCATTGATGTATGATGCTTATCAGTCCCAACGTTTCATCTACAATTGGTTATCACAACATTAG
CGACAAAAAATAATTTTTGATAAAAAATTTATATATGATTTTTTGACGATTTAAAAGCTAATATTAAAAAAAGCTATGAAAAAAATAAAACCAACTCTAA
AATTAAGATTTTAAATCAAAATTTTGGTTGCAGCTAACAAGCTGCATAGGAAATGATGAAGCAATATGTATATAGTAATAGTACTATATATGCTATTGCA
ATTAACACTAATATCCAGTTAGCAAGCTATTAACTAGTGTGGAACATATGTGAATTTATGATATACCATGACGTCGAAGTGGAAATAATACGATGACGTT
AGAGCCATTGTAACTTATCTAATAATTTACAAAATACATCAAAATGTACAAGTACAACCTAAATTTCAACTTGTTTATGGTTGACCGACAACGTTGGATT
TGTTAATCTTGCCTAAAGCCGACCTTAACTGCTTCTTGTAAATCCAGACAAACTAGTATTCCTTGGACTGTGACATCTTGAGTCATCCTTGAAAGCTCAA
TGTATGACAAGATGAACGACAAAGTGCAAAGCATAATTTCCATTTTATTCTGTAATCACCTTCTCTGCACGTTGGTGAAATCTTAACTTCGAATTATCAC
AATTTCCATTTCTCCCTCCATGGATGAACATAAAACTGGTGGTCCACACCACACGAGTCATCAAAGCCATCCAACATCTAAAATTTCGTCTGAATTCTCA
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GGAAAAGAACAAATTAAAAGTGGGAAAAGTCCATACGTACTAACTTTTTCTTACTAAATTTTTACTAACATTGACATGTCGTATTATGAGTGCATCTAGA
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AAGTGTTCTTTTCTTCAGAGCAGCAGAGCATGTGTGCAGTGTTCCTGATCAGTACTTGTGTACTATTACCTGTCAATTGCTAAGAGCCTTTACCAAAAAG
TTTCAATTATTTGGAGAGACAACACACTTATTGACACAGGGAAATAAAGCATTTTTTGGCACTAGAAACAAAAAGCAAATTATATCCAGTTTATAATAAG
GCAAAGAAATGGTGAAAAAAGAAGGTAATAATACATGAATGTATCTGCAAAAAACGTGATGACTTTCTAGATGTCTTCCTCTTCAGGCATCAAACCACCA
CCTGGTGCTTAAGTTTGTTAGAGAAAAAAGTGTATTTAATTAGCGTTAATTGCAAGTTATGATGCAATATTCCACCCATTTGATTTGTAGGCAGCATTAA
GGCCCGTTCTTTTCTGATTTTGAGATGCTCATTTTCATTTGCACGCTTCGCCTCTAAACGGTG