Detailed information on CNT3098852


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P0C2F6|RNHX1_ARATH, E-value = 9e-14

BLAST vs NONCODE:
NONSTUT000097, E-value = 1e-102

Expression of CNT3098852

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (66 aa)
MWIQARVDYVERVLLVIHPLNLRLCMDFWDLHYCTGCAKYSGLEQLVRFTLNPTNFSLLFWTDRSK*

>peptide 2 (51 aa)
MIHMLPNMFHNMIRQMIIHTIIIPPYFLHKKLNVHQRVTSLYFSLICVKRT*

>peptide 3 (93 aa)
MIILLAVSRTSWRDLNSYVPAKRKTKLAKKSARVFPSLKECCTLTDMEFLNLLMELTSIVTFQGISHSPFSICTKTNESVSIIMFGKLFSKQH*

>peptide 4 (33 aa)
MYQNQRVSFNYNVWKVVFQTTLKTFSNSNSFSN*

>peptide 5 (47 aa)
MISDTKGSSTRPRITSRSPICITFQPPRWWRMPFNPFRDKPRSENIQ*

>peptide 6 (50 aa)
MSYNSSYWNSISPNPPTKERYLKRKILHPYHLAIFIYFLFFPQNLPCTLN*

Sequence

>CNT3098852
CATGGGTCAAGAAATTTATTAAACTAAGAGAGAATATATACAAAATCATGTGGGTTGCCTAAGTGAACAGCCCACCAAATAAATAAACAAAACAATAAAA
GACAACACCTACCAGCTAAGAAATATCAAAAAAAATAATTAGGAAAGTGGAAGTTGAAGAGTACTTGCAGGTGCAGCGCCTCTTCCTCGATACATCATCA
AATCGGAGCTGATATTCGACTTCAATTCGGTGTAATTTTTTCTCCTCGTAGATTTCATGTGGATCCAAGCTCGTGTAGATTATGTGGAAAGAGTATTGTT
GGTAATCCATCCATTAAACCTCAGGTTGTGTATGGATTTCTGGGATTTGCACTATTGTACAGGTTGTGCAAAGTATTCTGGACTTGAGCAACTTGTTAGG
TTCACATTGAACCCAACCAATTTTTCTCTTCTCTTTTGGACTGATCGTTCGAAATAATCAATTTCGAAGTTATTCTGCTATGTGTATTGTGAAATAATAA
ACCTACTATAGATGTTAATTGACTGCTACAATCTATGAGTCTTGATTTTATACCATATGAAACACCCTAAACTCTCACCAGGTGCATGGTATATCAACCA
ACTGAAATTCATTCAGACATCATATAATGTGTAGTAGCTTTTATCATCTAATATAGCTTTATCAATATCATATGTAGAGTGTATTCAAATCAAACCATTT
ATACTCTTGTAGTGTTTGACTGCCTTATCCTCAACTGTGGTGTGCTTTGTTTATTTAAGATGATAATTCTCTTGGCCGTATCCAGAACCTCTTGGAGAGA
TCTAAATTCATATGTACCTGCAAAAAGAAAAACCAAGTTAGCAAAAAAATCAGCAAGAGTATTTCCCTCCCTTAAGGAGTGTTGTACTCTTACTGACATG
GAATTCCTCAATCTATTGATGGAATTGACCTCCATTGTCACATTCCAAGGTATTTCCCACTCTCCCTTCAGCATATGTACCAAAACCAACGAGTCAGTTT
CAATTATAATGTTTGGAAAGTTGTTTTCCAAACAACATTGAAGACCTTTTCTAATAGCAATAGCTTCAGCAACTAGATTAGTAGAATCAGGGATCCTCAC
CCCCTTAGCAATCACCAGCTCTCCTTCATGATTTCTGATACAAAAGGCAGCAGCACTAGGCCCAGGATTACCTCTAGAAGCCCCATCTGTATTACATTTC
AACCACCCAGATGGTGGAGGATGCCATTTAACCCATTTAGAGACAAACCTAGGTCTGAAAATATCCAATAGAGCAACCATCTGAGGCCAAGTGGAGGGGA
CATCAGTATATTGAAACTTTAACTACATAAATTTCTGAACAGTACTATTGATGTCCCAAATCACTTTACTTGTGGTGTAATTACCACCATGAAGCACAGT
ATTTCTCCTTTTCCATAAGAACCATAAGATTAGATTAGGAATAGCTTGAAAAATCACCTTTTGCCTAGTATTTCCTTGAACATCCCACCATTTTTTAATA
GATTGCTTCAACTGAATCCAAGGCCCTAATATTCCAGCTGCAGATGAGAAATACTGCCACACTTTGTTGGCAATTTCACCTTTCAAAATAAGTGTTCCAT
AGTTTCTCTTGCTGGAACAGTACAACATAGGCAAAGTTGAGACTGATTAGGGTTCCAATGAGCTATAACAGCAGCTACTGGAACTCTATTAGTCCAAACC
CTCCAACTAAAGAAAGATATCTTAAAAGGAAGATCTTGCACCCATATCATCTTGCAATTTTCATTTACTTCCTTTTTTTTCCTCAAAATCTCCCATGCAC
TCTTAACTGAGAACTTTCCGGTGCTTGTCTTGATCCACCACGGTTTGTCTCCCATATCAGTCCGTCTAATATGATCCATATGCTGCCTAATATGTTCCAC
AACATGATAAGGCAGATGATCATACATACTATCATAATCCCACCCTACTTCCTTCATAAAAAACTCAATGTCCATCAAAGAGTGACAAGTTTGTACTTCA
GTTTGATATGTGTAAAAAGGACCTAGCTGGGTCCAATTATCATACCAAACAGTAGAAGTTCCACCCTTAGGTTCCCACCATATAAATTTTTCTATGTCGT
CCCTATTTTGTAACATATTCTTCCACAATTGGGATCCACCTTTCCATTGAACCAGAGCTGGAATTAATATAAAAAAG