« Back to Solanum tuberosum search


Detailed information on CNT3097228


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|P69322|UBIQP_PEA, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE:
NONMEST001181, E-value = 2e-162

Expression of CNT3097228

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (55 aa)
MSSQKSAYHPLGAAPNGELIPFECCNLLESFHPQAVSQQKSTSAGQVGCLPYLEF*

>peptide 2 (57 aa)
MFSQRSACHHADEGQGGVWTPFGCCSQLEFFHPPTVYRQRSISADLEEFLPYLGFLP*

>peptide 3 (59 aa)
NRAKFLFIHINDSSTTHKKGNITKLKPEKSGKHLSTKGEENTVTKAINSQKPPRRRRTR*

>peptide 4 (37 aa)
MVSELSTSRVIVFPVNVFTKICIPPLRRSTKWRVDSF*

>peptide 5 (40 aa)
MVSELSTSRVMVFPVNVFTKICMPPRRRRTRWSVDSFWML*

Sequence

>CNT3097228
GTAACAGAGCTAAATTTTTATTTATTCACATAAACGACAGTTCAACCACACATAAGAAAGGCAACATCACAAAACTAAAACCAGAAAAGTCTGGAAAACA
TCTTTCGACCAAAGGAGAAGAAAACACAGTTACAAAAGCAATAAATTCTCAAAAGCCACCACGGAGACGAAGAACAAGGTAATCGTCTTTCCAGTAAGTG
TCTTGACAAAGATCTGCATTCCTCCTCTCAAACGGAGCACCAAATGGAGTGTGGACTCTTTCTGGATATTGTAATCAGCAAGAGTCCTACCATCCTCAAG
CTGCTTGCCAGCAAAAATTAAACGCTGCTGGTCTGGTGGAATCCCTTCTTTGTCTTGGATCTTTGCCTTCACATTATCAATGGTGTCTGAACTTTCTACC
TCCAGGGTGATTGTCTTCCCAGTCAATGTCTTCACAAAAATCTGCATACCACCCCTTAGGCGCAGCACCAAATGGAGAGTTGATTCCTTTTGAATGTTGT
AATCTGCTAGAGTCCTTCCATCCTCAAGCTGTTTCCCAGCAAAAATCAACCTCTGCTGGTCAGGTGGGATGCCTTCCTTATCTTGAATTTTAGCCTTGAC
ATTGTCGATGGTGTCAGAACTCTCAACCTCAAGGGTGATGGTCTTCCCTGTCAATGTTTTCACAAAGATCTGCATGCCACCACGCAGACGAAGGACAAGG
TGGAGTGTGGACTCCTTTTGGATGTTGTAGTCAGCTAGAGTTCTTCCATCCTCCAACTGTTTACCGGCAAAGATCAATCTCTGCTGATCTGGAGGAATTC
CTTCCTTATCTTGGATTTTTGCCTTGACATTGTCAATAGTGTCAGAGCTCTCAACCTCAAGAGTAATTGTCTTCCCAGTCAAGGTTTTCACAAAGATCTG
CATACCACCACGCAAACGAAGGACAAGGTGGAGGGTGGACTCCTTCTGGATGTTATAGTCTGCAAGAGTTCTACCGTCCTCTAATTGCTTTCCAGCAAAG
ATCAGCCTTTGCTGATCAGGAGGAATTCCTTCCTTGTCTTGAATCTTTGCCTTAACATTATCGATTGTGTCAGAACTCTCAACCTCGAGAGTTATGGTCT
TGCCAGTAAGGGTCTTAACAAAGATTTGCATCTATAATTAATCAAAA