Detailed information on CNT3093737


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONSTUT002070, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30622146Solanum tuberosumCajanus cajan10.0120.1491.64287forward
CNT3057972Solanum tuberosumAmborella trichopoda5.6951.5892.02163forward

Expression of CNT3093737

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (36 aa)
MHGRMENRVFLVVFYFGVWVGFGFMLMGFGFWVFFF*

>peptide 2 (40 aa)
MPCCYFFCIVLLSGSIDATCVSISLYLIICKCISYPFLCQ*

>peptide 3 (41 aa)
MSHYFHEFDSIEDFFCSQFGINPNNSRLSSVEMIPLPQIMD*

>peptide 4 (78 aa)
MPFSIIFCTPIYCSPYLSRDSCMLMGFQYLRTTRLLLVACSLPCSSLLLSVVPCFVPFALCTSVCLSSGWRLLHVSSS*

>peptide 5 (69 aa)
MSLFQYFDDIFEHFPFNLFKAIRARSTFWGIRVETIARIFLVEHLSQSLERWFTNRPRDKSFDSFTSRS*

>peptide 6 (69 aa)
MELQFGGESGNLPQLTLSRVQLSAASLLLPALHQSSLVPVDHYAPIVPPLVPHYAVLLFFLYCPAQWFY*

>peptide 7 (52 aa)
MEASTCFILMTLHFTLFAIFGQHIILDLNFFLPRLICLFVYNLHLYMLRKLT*

>peptide 8 (64 aa)
MMNLVSFPLTLDFTCFIITIICPCRFLWMHLFFLLGQCSKSIININALFYHFLYSNLLLTLLIS*

>peptide 9 (41 aa)
MDPRAWARITFVVTCLTTSMNSTPLKTSSAPSLASIPTILG*

>peptide 10 (47 aa)
KLNLEKVPMGYWWRIYSFMILSCMAGWRTEYSLWFFTLGYGSGLVLC*

>peptide 11 (30 aa)
MGRVWFYVNGFWVLGVFFLKSNLDQGPFIN*

Sequence

>CNT3093737
AAAAATTGAATCTTGAAAAAGTCCCAATGGGTTACTGGTGGAGAATTTATAGTTTTATGATCCTTTCATGCATGGCCGGATGGAGAACAGAGTATTCCTT
GTGGTTTTTTACTTTGGGGTATGGGTCGGGTTTGGTTTTATGTTAATGGGTTTTGGGTTTTGGGTGTTTTTTTTTTAAAATCTAACTTGGACCAAGGTCC
ATTTATTAATTGATAAAAAGGAAAGATCCAGCTTGTGCTACAGACAATCCCAAGAGAAAGAACAAAAACATAAAGTGTAAAGAAACAGACACAGACAACT
AAAAAGAAAAAATCTATACACATAAAAATAGCTGGAGAAAGCTCACGCCTCCCTTCATCTTCCAAATCAATTCCGTGAATCTCCGGCTAACTTTACCCCG
ATTGTCGGCGTCGAAGCATGGATCCAAGAGCTTGGGCGAGAATCACTTTTGTTGTAACATGTCTCACTACTTCCATGAATTCGACTCCATTGAAGACTTC
TTCTGCTCCCAGTTTGGCATCAATCCCAACAATTCTAGGCTGAGCTCCGTAGAAATGATACCACTGCCTCAAATCATGGATTAGATCAACACAATACTCT
AGGATTTAAGATCGAGGAACTACAACTACTGCACAAGAAAGACTTTCTTCAACCAATGGAACTACAATTTGGAGGGGAATCTGGCAATCTGCCTCAGCTA
ACTCTTTCAAGAGTACAATTATCAGCTGCCTCTCTCCTTCTCCCAGCACTACATCAATCATCCCTTGTGCCTGTTGACCATTATGCACCAATTGTTCCTC
CATTAGTTCCCCACTATGCCGTGTTGCTATTTTTTCTGTATTGTCCTGCTCAGTGGTTCTATTGATGCTACATGTGTCTCCATATCCCTTTACTTGATAA
TTTGCAAATGCATTAGTTATCCATTCCTTTGTCAATGAGTGATGATGAACCTTGTTAGCTTCCCTTTGACTCTTGACTTCACTTGTTTTATCATTACTAT
AATTTGTCCCTGTAGATTCCTCTGGATGCACCTCTTCTTTCTTCTCGGCCAGTGCAGCAAAAGCATTATCAATATTAATGCCCTTTTCTATCATTTTTTG
TACTCCAATTTATTGCTCACCCTACTTATCTCGTGACTCTTGTATGTTGATGGGTTTCCAATATCTTCGAACAACTCGTCTCCTTCTTGTTGCATGTTCA
TTGCCCTGCTCTTCATTGTTGTTATCGGTTGTCCCCTGTTTTGTCCCCTTTGCATTGTGTACCTCTGTTTGCCTTAGTTCAGGATGGAGGCTTCTACATG
TTTCATCCTCATGACCTTGCACTTTACATTGTTTGCAATATTTGGGCAGCATATCATATTGGATCTTAACTTTTTCCTTCCTAGACTCATTTGTCTTTTT
GTTTATAATCTCCATCTCTACATGCTTAGGAAACTCACTTAACAAGTCCACTTGCACCTTGACCCTCGCACAACTAGGTCTAGTTTTATTGATTGTTGCC
ATGTCTAACTGAAGAGGTTTTCCAACTACAGGTGCTAATGAAAACAAGGCTTCCTTCACAAAATATGTGGGTTTTAAATCCGAGAAGGATATCCATGCCA
TAGCTTGTGTCGTCTCTTCTTCAACCTTAAACTTAGCATCATATATAAGTGGCCTCATAGTATATGAATAACCGTCCTTGGCCAGAATATAATATATGCC
TTTTGACATTAAGTTTATGAAGTCTTCTTGTTGATCCAATCTAATCAGAACATGCCTATTTCTCAATAGGCCTATTTTACACTCTCCTTTGATATTACAC
TGTCGTGGGATACTTGTGCGGAGTTCTTCCAACTCCGGCCAACCATAGGAAAATTTTCCAACCACGACGTATTGAAGATCTTCCAAACTATTCATCCTAT
CAACTTCCTCTTCTGTCCACACAATCCTTGGAATCCCATTATTGTATTGGAGTTGTTTCAATGGAATAGGCTCAATTCCAGCCTTTTGGGCTTGATTGTT
GATATGATTCTTAAGGACATTAGCATAATTGTTAATTACATGAGTATCGTGAGTCGCCAACCCAGGCGCGATAAGCAGATTTAAACAAGAATTTTGTATT
AGAGATGGAAAACTACTATCTTGTAACAGATTCGACTGGCCAGCCCCAAGATTAGGCTGACCAGTGGCCAGAATGGCCATTCATGGAAGGTATTAGGTTA
AAGGCGGCGCAACGGCGCTAGCAAGTTAGGACTGATAAAAGCGTCTTTTTTGTTTTTATTTTAATTAAATGACCTGATTTTATATTGGTGACGTGGACCT
CTAATAAGAGACCATGTCACATTAATGGTTTTGAAAATCTGGATATGGATTCCGTTATAGAAAAGGTGGTTAATGAAAAGTGGCATGAATGGACCTTTTC
TATAACGGTAATGGCATAAATGAGCCAGACTTTTAACGGATGGCATAGATGAGCCTTTTCCAATACTTCGATGACATATTTGAGCATTTTCCCTTTAATT
TGTTCAAAGCTATTAGAGCTAGATCCACCTTTTGGGGAATACGAGTCGAAACAATAGCAAGAATATTTCTAGTAGAACATCTTTCACAATCCCTAGAGAG
ATGGTTCACTAATAGACCGAGGGATAAGTCATTCGACTCATTCACATCCAGATCATGAATGTTTGGAATCCATATTATGCAATGAGACATTACTTTTGCT
AATTCAAATTGAAGGGTGATATAAAATCGGTCTATTTCCAGCATCATATCCACAGTTAGCCCATTCATCCTAGTTAGAAGTTTTGTTTTTCTATACTTCA
GTTTTAGACTTTGTATGTGATGTATGGGTTACGTCCCAATCACTTTTCTTGTGTTGTATTAGGTGGC