« Back to Solanum tuberosum search


Detailed information on CNT3090449


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONSLYT000079, E-value = 6e-81

Expression of CNT3090449

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (52 aa)
MNKLSPLDVQFFAIIFANHYRSVTVKNYSSLFIHQKNLKKIVAAPIVLHRLN*

>peptide 2 (38 aa)
MKTTQSLRCSINCDHLRKSLQVCNCKKLIIIVVFIYND*

>peptide 3 (45 aa)
MKRKMKKEQHTYYCFKGTSWSKINYFLPTRLKKHITQNIYTYTQK*

Sequence

>CNT3090449
AAGTTTTATGATATAAGATTTAGGCCTTAAAATTTGAAGTTTAGATTTTAACAATTAGGCTCTAAAAACTTTAAGATTAAAAATACAGCATTTGAACATT
ATAATAAATAATTATGTAGTACCCCAACGACCAAATACACCACAAAAATTAGATGCAAAGGATAGCGAGGGGAACATTATTATAGCTTCACTTGCTAAAG
TATCACACTACAAAAATGTAATCCACAAAATATAATTAGCAAAGCATAGTATAATTAACAACATATTCAATAAAATCCTGCAAATCTACGTAAACCTTAT
CATTATCTCATAAAAAATAAAATAAAATATGAAAACAACTCAGTCCCTTAGATGTTCAATTAATTGCGATCATCTTCGCAAATCATTACAGGTCTGTAAC
TGTAAAAAATTAATCATCATTGTTGTTTTCATATACAATGATTAGAATAAAATATATATAAAAAATTTTGATGAACAAACTCAGTCCCTTAGATGTTCAA
TTTTTTGCGATCATTTTCGCAAATCATTACAGGTCTGTAACTGTAAAAAATTACTCATCATTGTTTATTCATCAAAAAAATTTAAAAAAAATTGTAGCTG
CTCCAATTGTTCTCCACAGATTAAATTAAATGAAGAGAAAGATGAAAAAGGAACAACACACTTACTATTGCTTCAAGGGAACGAGTTGGTCAAAAATAAA
TTATTTCTTGCCAACCAGATTAAAGAAGCATATAACTCAAAATATATACACATACACACAAAAATAAATAAAATAAATTTGGAATTTAGAAGATATCACC
ATTGTTGAAGATTTCAATCTGCAGATTCAGAGGAAG