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Detailed information on CNT3086010


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30202287Vigna radiataPisum sativum15.5821.8386.74181forward
CNT30541456Vigna radiataBrassica napus15.5820.3684.53181forward

Expression of CNT3086010

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (72 aa)
MCRSSRHRSHKRTIEGYSFLLISSNCIIGITKKRFFFFRILIVFLWNYLIFPISAITCSSGSGSNFSDSLINE

>peptide 2 (31 aa)
MPGWPTNPPNFIFINLLSYKILKNTIRLIIH*

Sequence

>CNT3086010
GGCATTAAGTATATCTAAGATTTGATTCATTTATCGGATTTGGAGAATTCCCTCTCTAAAGTCACATTTCTTTTTTTTAAAGTTCTATTCGTTTAAGATG
ATAATTTGGAATAGAGGGAATGAATGAATTTAAAGAGATTTGTGAGTGAATTTATCATTGTTTTTTTAAAGAGATTTGGAGGTGAGTAAAAGTGTATTTG
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TTGTTGATAAGCTCCAATTGTATCATAGGAATTACAAAAAAAAGGTTCTTTTTTTTTCGTATACTTATAGTTTTTCTATGGAATTATTTGATTTTTCCAA
TTTCTGCAATTACGTGCTCTAGTGGATCAGGTTCAAATTTTTCCGACTCACTAATAAATGAG