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Detailed information on CNT3084557


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9M015|Y5161_ARATH, E-value = 2e-06

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT3084557

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (77 aa)
MGVTVARNVRLHFFIVPVWCSRSFYDSYFLRVKNHTLSYPTCLSSPNSFVGSHFTPFHKSKYYYKLFLYFSISLTDS*

>peptide 2 (56 aa)
MSSDLRRVGHKFTDFFELVSVTLLLFEPDETGFSVVTALFYVFEGQETIGESDFLE*

>peptide 3 (70 aa)
MSLRGKRPLGRAISLSSSLDFTWQISSPWYTSDLLLTSSATRAMVRTVMMIALCSFRLSKSEKEEVFFTC*

Sequence

>CNT3084557
AAATAAGCCCTTTATAGTTACTAGTTATTAACCAAAGTAACCGGATGGTATAACTTTATCCATTCGAAGTTCAAACCGATAAGGTTTGCAAGAGCCCTGA
AATCTTAGTTTTCAAATACGTTTCAAAATTGCTTTAATATTCCTTAAATGCGTGGTATAGTTATTTGATATTCCCTTTCCTCCCTTCTTATTTATAAGTG
AGAAATAGTCAACTTTAAATAAATATCATTAATATATATTTTGCAAACAAACATTAATTTTTATATAAATAAAACGAATTTAATACATGACAAGACATAT
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ATCCCACATGCCTTTCATCACCTAACAGTTTCGTTGGTTCACATTTTACACCATTTCATAAATCAAAATATTACTATAAACTTTTTCTTTATTTTTCAAT
TTCCTTAACCGATTCTTGATGAAAACAAAGTGACCTAAGATTTCCTTTTCATGTCATAATTTCAGTAGGTTAGGCAGAAGTAAATTAATGCCTGTCAATA
TCCCACCGCGTCAAATATAAGCTAAAACTATTCGCTGTCAAAACAAAATTCCACATGTCAAATACCAAAAAACTAAAAGATTGATTTCATCATAATAAGA
CCAAATCGAGAGGAGCTATAATTGCCTAAAAAAGCAGTATCATATTAATTTCATCATAATAATAACATTAATAATAAAAAGATTGACATAAATAAAACTT
AATTTGACAGTAAATATCATTCTCGATTCATTCACCGTAACCACCAAGACAGAAGCTTGTTGAGAATGAATCAGACCTCTTTCACTTGCACAGCCGCAGC
TGGCTCCTCCACGCGCTTACTCGCCTGAGCCTGCTCCTCAATCTCGAAGGCGGAGACAGGAAAAGACCGAAATAGCCCAGCGGGGGTTTTGAAGGTGATT
TTGCCGGTGGGAGGGTCATCGACGTAGATGTCACTGAGCGTGATCCAGAGCAAGAGCTCCTTCGTCTTCACACCGGTGAGCTTGGAGATCTTTCCCTTTT
CTACATGAGCAGTGACCTCCGGCGCGTAGGACACAAGTTTACCGATTTTTTCGAACTTGTGAGTGTAACTCTTCTTCTGTTTGAGCCAGACGAAACCGGT
TTCTCGGTCGTAACCGCACTCTTCTATGTCTTTGAGGGGCAAGAGACCATTGGGGAGAGCGATTTCCTTGAGTAGCTCTTTGGACTTCACCTGGCAGATT
TCGTCGCCGTGGTACACCTCCGATCTGCTCTTGACATCCTCTGCTACCAGAGCCATGGTGAGGACGGTGATGATGATTGCTTTATGCTCTTTTAGGTTAT
CCAAGTCAGAGAAAGAGGAAGTGTTCTTCACCTGTTGAGAAAGGAGAGAGTCTCTTCTCTCATATATAGCTCTCCACCTCTCACTTTAACCTTTCATCTC
CCCAAAATTTCAATCTCTGCCCCTCTCTCACTTTAATGCCTCATTTAATAGTGATTCAGGAACACTAACTAATTTTATTAAAATAACATTAATTTTATTA
AAAAGATAAAAATTAATTAATTTAGCAACAACTTATGTGTCATTGCAATTTAAG