Detailed information on CNT3082973


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|A4QL96|RPOC2_LEPVR, E-value = 0.0

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30403985Brassica junceaBeta vulgaris3.686.7185300forward
CNT30220823Brassica junceaHordeum vulgare17.345.6283.981442forward
CNT30314046Brassica junceaCamelina sativa40.1187.2296.833343forward
CNT30142437Brassica junceaLolium perenne17.5277.0482.671460forward
CNT30149619Brassica junceaBrachypodium distachyon3.9125.8782.52326forward

Expression of CNT3082973

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (29 aa)
MGFDNEFESMIAKLPFLDLDFLGQELCPS*

>peptide 2 (29 aa)
MTIPHGLSTDSIIKKCIHGFLYQFFLTHY*

>peptide 3 (30 aa)
MKSIGFCHLSNYLSIRYFFSGPSTYLLRRN*

>peptide 4 (29 aa)
MYIPIMMVFFQNQTLLFSILDKPALRRYR*

>peptide 5 (96 aa)
MAEDSGKICTSSGMKKKRSTFISYFVLNFWTPRYSIISSFWTIESAFRVPYLRIPELFLLYLGSSKKAKILFLRKIPFMGISIEIPECGMNSFACS*

>peptide 6 (93 aa)
MSGRALLLFREAIHSDVMKVRVQRQSPNAPNNRPVCQAESREIFPLFLQLHLKMTCKPYYDHPSWVVHGFHYQEVYPRLLVPIFPDTLLIPLV*

>peptide 7 (98 aa)
MMGLNSGGRTGKRHKTIHSGSIFVRIKCLANSIRLTKKSFLLTIFRSSHSFPVGPSSPNCFHSTNEFSIIIRKSKSANCSRIAPAPVEISRFLNISKP*

>peptide 8 (34 aa)
MRYFLSDPFRTLGCHMRLNFIFPYVERSINITIY*

>peptide 9 (37 aa)
MSELTRRGPNSHGCPIILFYEYHIIRYHMNKLEKNLV*

>peptide 10 (35 aa)
MHFLRNEKKAIYFHFVFCLKFLDSSILNHILFLDD*

>peptide 11 (34 aa)
MDYICLHKYLDECRSLIHRVQSAYLESVQKWDLQ*

>peptide 12 (34 aa)
MPLHNFLKDFPDNRLFFTNLTLSNSYVRSQMLSN*

>peptide 13 (40 aa)
MVLFWLYIDFHKKIVQDLLLWTFPHNNNYYNFDEENTNSI*

>peptide 14 (40 aa)
MSGYLICLVRKMDIPRKYFEFNPFFFSLHSDQPADLASYI*

>peptide 15 (39 aa)
MKSRIKPFVLTSTTKARTSSREEFLLSWSQFKTKQVRTN*

>peptide 16 (39 aa)
MLLFSRDMSDRGHPKLIEGDESLSFLKIKISIKSHIAVY*

>peptide 17 (31 aa)
MIPLFPCLPATLSPTLISRFCEIYTRIISGL*

>peptide 18 (45 aa)
MRLFPGYSGSNTHGLAVCLLASYNSENTSFLEASCSYLSSKGAIR*

>peptide 19 (45 aa)
MFEARCCLIRPRITNVWKSSIAISRGNPQRCNESEGPTTITERPE*

>peptide 20 (47 aa)
MSVLCIPFDIFVSENQQIQLHIVHKIASLLFHLRSLDNFHKRKFHSL*

>peptide 21 (47 aa)
MYLRCISSSSRKRHHMDWIERVRHPKIRIHFLSQIFTCSIPYLNRLA*

>peptide 22 (50 aa)
MDITICKFGCMGYISTPMHFALGVRINIFSNPLFKMKSGCSLANLSNHLF*

>peptide 23 (54 aa)
MPLCRDILSVLSGKWISPENILSSILFFFLSTRINPPTWLLIFKVIRVSTPMIL*

>peptide 24 (60 aa)
MSYRTCQFYVSHLISSYPRINKFNSTLFTKLRVFFFISDHSIISTSANSTLYRPKNPFTK*

>peptide 25 (62 aa)
MKVSSHPAQVVISNKDKERGRTFQLYFIKSSENPKRIYALLKFSVQTNHHFIDSINSSLISI*

>peptide 26 (41 aa)
MPVTCTCRMNQILIKFDFSIIRGSYMFGSTSCKYSTGMKSS*

>peptide 27 (43 aa)
MTNCGSNIYKKSLFFYTSYYQIVCINLMIVTKRFIVNFDRNFF*

Sequence

>CNT3082973
CCCCCTGGGATCGATAAACCTTTTGAATCTTATTAACCAAAGAAATACGACTTTGCACTATAGTTAGCTCAGCACCAATCAAGAATCCCCAAGGAATTCC
AAGAATTCTTGTTATACACCTGTTCCAACCCTTAATCCGCTTTTCTAAGTTCAGTGATATTGAATCAATCGAGCGGACTTCTAACACCTGTTCTACTTTT
GGAAGACCTTGGGTTATATCACCGGATCTCGATTTTTCATATATAAATGTAACTAATGTATCCCCTTCGTAAAGAATTTCTCTATAATGCCCGTGAACTT
TTGCTCCCGGAGTAGCCAAATAGGGCTTAGCGGATCTTATTACTACAGAATCCCTTTGAACAATTAAAACTTGACCCGATTTTAGGTATGGTTCTTTTTT
GGCTATACATAGATTTTCACAAAAAAATTGTCCAAGACTTATTATTGTGGACGTTTCCTCACAATAATAATTATTATAATTTTGATGAAGAAAATACCAA
TTCAATTTGAATGGATTCAAAACAAGGTTACTGTATGGATCTAGATTAAAAATTCTTCCGTTTTCATCTATTAAATAAGAGTGAATTATTTGAAAAATAT
ATTTGAAGTTATCAAGTTGCAAATATTTAATTACAGAGATCTGATTATAAGTTAGTAAAGGCAAAAATGAATAAAAATTCGAAATTTGAATGGCTGTTCC
TAAGGGGCCCGACGAATTTTGAATTGTAATTAGAGGTTTTTTTTTTATTGATTGGTTTATAACATTGTGATATTTTACATGATTAAATGGACCGATTCTA
AAACAATTAGAGGATGATAAAATTAACAAAGATTGGGATTCCTTATTTCTGAACATACGAATAGTTCCGTGATTTTGTCTAAGCGATTGTTGAAGAATGC
CAGCCTTGGGAGAAAGCGAATAAAACGGATTCACGGAATCTGCAGAGATCAATCCCGAATCCGGCGGATTATTCCTTTTTCTTATATACGAAATATGGGA
TTTCACTAAGCCAATTCTTATGAAATCTCGAATCAAACCCTTTGTACTTACTTCAACAACGAAAGCGCGGACCTCCTCGAGGGAAGAATTTTTGTTGTCT
TGGTCCCAATTCAAGACTAAACAAGTGCGAACCAATTGAATACTTGTGTCAGAAATTCCTCGAGTTGGTTTACCATTTCCATAAAGGATATAGTTGAAAA
CTCGAAGTTGAATATTATCCTTTTCCCGAAAGAGATCTTGTGGGAAGAGTGTTGCTAAATTTATACTGTCCATTATCTCATAGGTGGCTACGGGCCGCAC
CAAAACAAAAAACTTTTTCTTGGTTGGTGTGATCCGTTGGGCATAAATCCAATTTTTTAAATTTTTTGATTCTTTAGAGTTTGTTTTTCCCCTTCCTGGC
GGTATCAAGATGCCACTATGTCGGGATATCTTATCTGTCTTGTCCGGAAAATGGATATCCCCCGAAAATATTTTGAGTTCAATCCTTTTTTTTTTTCTCT
CCACTCGGATCAACCCGCCGACTTGGCTTCTTATATTTAAAGTGATTCGTGTATCGACTCCAATGATACTATAGTTCTGTACCATTATGGCGGAGGATTC
GGGTAAAATATGCACTTCCTCAGGAATGAAAAAAAAGCGATCTACTTTCATTTCGTATTTTGTCTTAAATTTTTGGACTCCTCGATACTCAATCATATCC
TCTTTTTGGACGATTGAGTCCGCCTTTAGAGTTCCATATTTAAGAATTCCGGAACTCTTTCTTCTGTATCTAGGATCATCAAAAAAAGCAAAAATACTGT
TTCTACGGAAAATACCATTTATGGGTATTTCAATCGAGATACCTGAATGTGGTATGAACTCTTTCGCTTGCTCTTGAATCGATTGGAATGGAATGAGAAA
TCTATTTCTTCGCCTTTTTGCTAATAAATCCGAATTCTCATGAAAAATAGCAGAATATATGAAATTATAATGACTAGTACCTACGATTCCATTCAATTCT
GAATAATTGGGAATCCCAGATTTTTTTTTATCAGAAAAATCTGAACTGAAAAATTTTTTGCTCACTTGATCATTATTCACTGAGAGGCTAGAAATAGATT
TTCTTTCGACGGAAAGAAAGGGTATGTTCATTTGATCTTGATCTTTGTGGATCGAAAAAAGAATTAGACTAGATCCACAAGAACCTCCTGATAATATCCA
TAAATGACTTGTTTTTGGTAAAAGATGGACATTACTATATGTAAATTCGGGTGCATGGGATACATCAGTACTCCAATGCATTTCGCCCTCGGAGTCAGAA
TAAATATATTTTCTAACCCTCTCTTTAAAATGAAAAGTGGATGTTCCCTCGCGAATCTCAGCAATCACTTGTTCTGATTCCACATATTGATCATTTTGAA
CTAAAAGAAAACTTTTTGGTGGAATAGTCACGCTATGTATAATATCTTCGCTCTCAATAATTACAGACAAGTCTATATAACATAGAAAGGCAGGATGCCC
GTGACGTGTACGTGTAGGATGAACCAAATCCTCATTAAATTTGATTTTTCCATTATAAGGGGCTCGTACATGTTCGGCAGTACCTCCTGTAAATACTCCA
CCGGTATGAAAAGTTCTTAATGTTAGTTGAGTCCCCGGTTCGCCAATAGATTGACCCGCAATAATACCTACAGCTTCCCCCAATTCAACTAGGTCACCAT
GAGTGGGACTCCGGCCATAACATAATCGACAGATCCAAGATGTACTCCGACAAGTAAAGGGAGTTCGAATAGATATTGATTGTGTTCCAAAGGTTATGAA
TCGATTGACAAGTCCAATCCCAAGATCTTGATTTCGAAAGGCGACACATCGGGAACCTATATATATATCGTCTGCTAAGACACGACCAATTAATGTTTGG
ATAAAAATTCTTTCTGACATCATCCGACTTTTATTTCGAGGACTCACAGAAATCCCTCGGATAGTGCCACAATCCGTTCGACGTACAACAATATGTTGAA
CTACTTCAACAAGTCGACGCGTAAGATATCCAGCATCTGATGTGCGGACCGCAGTATCTACAACTCCTTTACGGGCTCCATAGCAAGAAATAATATATTC
TGTTAAAGACAGTCCTTCGCGTAAATTGCTTTGAATAGGTAAATCAATCATTTGTCCTTGGGGATCCGACATTAATCCTCTCATACCTACTAATTGATGT
ACTTGAGATGCATTTCCTCTAGCTCCCGAAAAAGACATCATATGGACTGGATTGAAAGGGTCCGTCATCCTAAAATTAGGATTCATTTCCTGTCGCAAAT
ATTCACTTGTAGCATACCATATCTCAATAGATTGGCGTAATTTTTCTACCGCATGTACATTCCCATAATGATGGTGTTTTTCCAAAATCAAACTTTGTTG
TTCAGCATCTTGGACAAGCCAGCCCTTAGAAGGTATCGTTAAAAGATCATCAATTCCTAATGAAATGGATGTAGCAGTTGCTTGCTGGAAACCCAGAGTC
TTTACTTGATCTAGGATGTGTGATGTATATGCCATCCCGAAGTGATCTATTAATCGGCTAATAAGTCGTTTAATAGCAGTTCCATCTATCACTTTATTGT
GAAATACCAGATTGGCCCGTTCCGCCATAAGTACCTCCATATTCTGCTGAATGGGATTCGACAATGAGTTTGAGTCAATGATTGCAAAACTTCCTTTTCT
CGATCTTGATTTTTTAGGTCAGGAACTATGTCCGAGTTGACTCGGAGAGGTCCGAATTCACACGGGTGTCCTATAATTCTTTTTTATGAATACCATATTA
TTAGGTATCATATGAACAAGCTTGAGAAAAACCTTGTATAGCTTCCTCGATTTCTCGATAAAAAGAAATATGACCAACTGTGGTTCGAATATATATAAAA
AAAGTTTGTTTTTTTACACTTCTTACTATCAGATAGTGTGCATAAATCTCATGATAGTTACCAAAAGATTCATAGTGAACTTCGATAGGAACTTCTTTTG
AAGCAATAACGCGTTGATCTAATTGCCACCGAAGCCACAAAGGACTATCTAAATTGATTCTTTTCTGCCGATAAGCTCCAATTGCATCATAGGAATTGCA
AAAAAAGGGTTCTTTCATATACTTATAGTTTGTTTCGTAAATTCTTTCATTTTGATAGTTTTTTCGATTACATGGATTATATCTGTTTGCACAAATACCT
CGACGAGTGCCGCTCGTTAATACATAGAGTCCAATCAGCATATCTTGAGTCGGTACAGAAATGGGATCTCCAATAGCTGGAGATAAGAGATTCATATGAG
AAAACATAAGTAAACGAGCCTCTGCTTGAGCTTCTAAAGATAAAGGCACATGAACAGCCATTTGATCCCCATCAAAGTCTGCATTGAACCCCTTACAAAC
TAATGGATGTAAACAAATAGTGCGTCCTTCCACTAAAATGGGTTGGAATGACTGTATGCCTAATCTATGTAGAGTAGGTGCTCTATTCAGTAATACGGGA
TGCCCCTGCATAACTTCTTGAAGGATTTCCCAGACAATCGGCTTTTTTTCACGAATTTGACTCTTAGCAACTCCTATGTTCGAAGCCAGATGTTGTCTAA
TTAGACCACGAATTACAAATGTCTGGAAGAGCTCTATTGCTATTTCGCGAGGCAATCCACAGCGATGTAATGAAAGTGAGGGTCCAACGACAATCACCGA
ACGCCCCGAATAATCGACCCGTTTGCCAAGCAGAGTCTCGCGAAATCTTCCCTCTTTTCCTTCAATTACATCTGAAAATGACTTGTAAACCTTATTATGA
CCATCCCTCATGGGTTGTCCACGGATTCCATTATCAAGAAGTGTATCCACGGCTTCTTGTACCAATTTTTCCTGACACATTACTAATTCCCCTGGTGTAG
ATCTACTTGTTGTTAATAGATCAGTAAGAGTATTGTTCCGATAGATAACTCTTCTATAGAGTTCATTAATATCTGAACTCATCAGTTTACCCCCTTCTAT
CTGAATGATGGGTCTCAACTCGGGAGGCAGAACCGGTAAGAGACATAAAACCATCCATTCCGGTTCTATATTTGTTCGAATAAAATGCTTAGCTAATTCC
ATACGTCTAACTAAAAAATCTTTTCTTCTTACAATTTTTCGATCTTCCCATTCATTCCCCGTGGGACCTTCTTCTCCTAATTGTTTCCATTCTACCAACG
AATTTTCTATAATAATTCGCAAATCTAAATCGGCTAATTGTTCTCGGATAGCACCCGCCCCAGTAGAAATTTCTCGATTTCTAAATATATCGAAACCTTG
AGTAGTAAAAAAAAGTGGGATGCTGTATTTCCAGGATTGAATTTCATATTCAAATGAACCTCGTAATCGTAAGAAAGTAGGTTTTTTCGTTATGGGCCTA
GCAAAAGAAAAATTGGGATAGGGTCCACTATATGATCTCCCCCCCTCAAAACCGGACATGAAAGTTTCCTCTCATCCGGCTCAAGTAGTTATATCAAATA
AAGATAAAGAAAGGGGTCGCACTTTCCAATTGTATTTTATAAAATCAAGTGAAAACCCAAAAAGAATCTACGCCTTACTCAAGTTCTCAGTGCAAACCAA
CCACCATTTCATTGATTCAATTAATTCTTCTTTGATTTCTATTTAGATTCTTTAGTGAATTCAAAATTACGACAGAAAAAAGAAAAAAATGTCAAATTCT
TGAGTAGTCTACTTCCCTTCGAATGCCGGAATACTTTTTACCTTAAGTGAAAGGAATGCCTTAGAATTCATACGGGATTTATTTGTCTATGTATTGTTCC
ATTCGATCTTTTAGGTCCTGCGTTACCTCGATGGTTATGCCACAATATTCTTAAAGCTTATATGCGATGTATAGACTTCTCCAACCATGACATATTTGTT
TACTTCAATATAAAAAACCAAATTTCTTTTCGTTTAGAAAGATAAGGGAATGCTTAATTCGACAAAAAAAAGGTCTTCTTTTCACGAGGTACGACTATCA
ATTTGAAGTTACTTTTTTTTTACTGAATCGACCATAGACCAATCGCCCTTGTTATTTGGGAGTATTGAATACACCCACAAGTCTGAGCTTCATGTTACTC
TTTTCAAGAGACATGTCAGATCGAGGGCATCCCAAATTGATTGAAGGGGATGAGAGTTTATCATTCTTAAAAATAAAAATTTCGATCAAATCACACATCG
CAGTATACTAGACCTTCTAATTCTTTAAGAGGTTTATCTAAAAGATTCGCAATATAACTAGGAAGACGTTTCAAATACCATACATGAGTTACAGGACATG
TCAGTTTTATGTATCCCATTTGATATCTTCGTATCCGAGAATCAACAAATTCAACTCCACATTGTTCACAAAATTGCGAGTCTTCTTTTTCATCTCCGAT
CACTCGATAATTTCCACAAGCGCAAATTCCACTCTTTATAGGCCCAAAAATCCTTTCACAAAATAATCCATCTTTTTCCGGTTTATTGGTTTTGTAATGA
AAAGTATAGGGTTTTGTCACCTCTCCAACTATCTCTCCATTAGGTATTTTTTTAGTGGCCCAAGCACTTATTTGCTGAGGAGAAACTAATCCAATTCGGA
GTTGTTGATGTTTATACCGATCGATCATATAAGAAATTTTGTGATTCATTCCGATTAAACTTCCTTCCTATTAATCTGGAAATTCTTCTCAGATACAAGG
AAATGATTCAGTTCCAGAGCCAAAGATCGTAGTTCTCGAACAAGTAATCGAAAAGATTCTGGAGCATCTTCTGGTTTAGGTATTGCTCCTCCAATGATAG
TGGTACCAAGTACTTCTTGGCGAGCTCTAATATGATCAGATTTATAAGTAAGCATCTCTTGTAAAATATGAGCAACACCAAACCCCTCTAGAGCCCAAAC
CTCCATTTCGCCTACCCGCTGCCCCCCCTGCTTAGAACGGCCTCTAAGGGGTTGTTGTGTAACAAGTGCATAATGTCCACTAGAACGTCCGTGTATTTTA
TCATCAACCTGATGAATTAATTTCAAGATATAGGGCTTTCCTATTATCACAGGCTGTTCAAAAGGATCTCCCGTTCTTCCATCAAAAATGCGGCTTTTTC
CTGGATACTCGGGTTCAAATACCCATGGATTGGCTGTTTGCTTACTAGCTTCATATAATTCAGAAAATACGAGTTTTCTCGAAGCCTCTTGTTCATATCT
CTCATCAAAAGGGGCTATTCGATAATGTCTATCTAGCAAACTTCCCGCTAATCCAAGCGAGCATTCAAATATCTGTCCTACATTCATGCGTGAGGGTACT
CCTAATGGGTTGAAGACCATATCCACGGGTCTCCCGTCTTGCAAATAAGGCATATCCTGTCTAGGCAAAATTTTGGAAATGATACCTTTATTTCCATGTC
TTCCGGCTACTTTATCACCTACTTTGATTTCACGTTTCTGTGAAATATATACACGAATTATTTCGGGGTTATAACTTGAACCCCCCTTTTTCTGAACCCA
TCTCACATCAATAACTCGACCTCTACCACCTATAGGCAATTTTAAACAAGTTTCTTTTGAAGTCGATACCTGAATGCCAAGTATGGCCCGTAATAATCTA
TCTTCCGGAGCATACGAGGATTCTTTCGCCATCTGAGGCGTTAATTTACCTACTAAAATATCACCCGTTTCAACCCACGATCCTAGCATCACAATTCCAT
TTTTGTCTAAATTTCGGAGTAAACGGCCCTCTAGATGCGGTATTTCCTTAGTGATCCTTTCAGGACCTTGGGTTGTCACATGCGTCTGAATTTCATATTT
CCGTATGTGGAAAGAAGTATAAATATCACCATATACTAGACACTCACTAATGAGTACCGCATCTTCAAAATTGTATCCTTCCCATGGCATATAAGCCACT
AATATATTTTTCCCCAAGGCGAGTTCCCCACCAACTGTAGCAGCACCATCCGCTAAAATCTGTCCCTTTTTAATACATTTACCCCGGCGAACCTGAGGTT
TTTGATGCATACAAGTATTTTTGTTTGAGCGTTGATACATAATTAATGGAATACTTAAAGTATTCTCATTTCCCGATAAAATTATCTTCTCAGTGTCAGT
ATAAAGGATTTTTCCCTCGTGTTCGGCTATAGCGGGAACCCCCGAATCTAAAGCCACTTGGCGTTCCAATCCAGTTCCAACAATGCACTTTTCGGACCGA
GAAAGTGGAACTGCTTGACGTTGCATATTAGAACTCATTAAAGCTCGATTCGCATCATTATGTTCGATAAAAGGAATTAGGGAAGCTCCAATGGAAAAAT
ATTGGAAAGGAAAAATGCTTCGAAGATGAACCTCT