Detailed information on CNT3080182


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9SU35|ERLL1_ARATH, E-value = 3e-21

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT3080182

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (40 aa)
MDQTSQNVNTSSELQCVDWTRWLSASSSGRWTTMIRWITS*

>peptide 2 (38 aa)
MRRSSTTTTMMRRPTTFSTMMWRFTTTFSSVMWWFASSS

>peptide 3 (37 aa)
MIGGRSPGGVVTGGGLMIGGRSPGGVVIGGGLTIGGG*

>peptide 4 (31 aa)
PFFFSACIPLIILIERDVSLENSKLSLARVS*

>peptide 5 (64 aa)
MKMFKLRSLSLMVVQRHTAASNSSNPCNTGQHTFSTGFPSPIWIKPPKTSTQAPSFNALIGHVG*

>peptide 6 (44 aa)
MQNKMKDYSKQQDPCKNPSLIITTTTTDNKLKTALVKTLDKQQT*

Sequence

>CNT3080182
TACCTTTTTTTTTTTCTGCATGCATACCTTTAATTATCTTGATAGAGAGGGATGTAAGTCTAGAAAACTCAAAATTAAGTCTTGCTAGGGTTTCTTAATA
AGATTAGAGATTCAAATAGATGCAAAACAAAATGAAAGATTACAGCAAACAACAAGACCCATGCAAAAACCCTAGCTTAATCATCACAACAACGACAACG
GACAACAAATTAAAAACTGCACTTGTTAAAACCCTAGACAAACAACAAACCTGATCTTCAACAAAAGGAACACAAATACAAATATTTAGATTATTTCAAA
AGCCTCGAAACCCTTGATACATCGTACGTTGTTTGTTATCAAGTGAGAGGAGGGCAGATAAAACCAGGAGGAGGATTGATTCCACAAGTGATGAGAGCTT
GAAGTGCAAGAGGAATGAAGATGTTTAAGTTGAGAAGCTTAAGTCTTATGGTTGTGCAAAGACATACGGCTGCTTCTAACTCAAGTAACCCTTGTAACAC
TGGACAACACACATTCTCGACTGGATTTCCAAGTCCAATATGGATCAAACCTCCCAAAACGTCAACACAAGCTCCGAGCTTCAATGCGTTGATTGGACAC
GTTGGCTGAGCGCCTCCTCCTCCGGAAGGTGGACCACCATGATACGGTGGATAACCAGTTGATGGTGGTGGAGTAGTGATCGGAGGTGGGTTAATGATCG
GAGGGAGAAGTCCTGGAGGTGTTGTGACCGGAGGTGGGTTAATGATCGGAGGGAGAAGTCCTGGAGGTGTTGTGATAGGCGGTGGCCTTACCATTGGTGG
TGGATAGACGACCGGAGGAGGTCTTGAGATAGGCGGTGGCCTCACCACTGGTGGTGGATAAACCACCGGAGGAGGTCTAACAAACGGCGGTCCTCCACCT
TGATGCGGAGGTCCTCCACCACCACCACCATGATGCGGAGGCCCACCACCTTTTCCACCATGATGTGGCGGTTTACTACCACCTTTTCCTCCGTGATGTG
GTGGTTTGCCTCCTCCTCC