Detailed information on CNT3080096


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9SU35|ERLL1_ARATH, E-value = 4e-21

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT3080096

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (40 aa)
MDQTSQNVNTSSELQCVDWTRWLSASSSGRWTTMIRWITS*

>peptide 2 (44 aa)
MQNKMKDYSKQQDPCKNPSLIITTTTTDNKLKTALVKTLDKQQT*

>peptide 3 (64 aa)
MKMFKLRSLSLMVVQRHTAASNSSNPCNTGQHTFSTGFPSPIWIKPPKTSTQAPSFNALIGHVG*

>peptide 4 (78 aa)
MRRSSTTTTMMRRPTTFSTMMWRFTTTFSSVMWWLRDRRVRVSARSASLDRWWQCDDRGDQENEEGSRNPGTHYLLIY*

>peptide 5 (31 aa)
MIGGRSPGGVVIGGRIPGGVVIGGGLTIGGG*

>peptide 6 (31 aa)
PFFFSACIPLIILIERDVSLENSKLSLARVS*

Sequence

>CNT3080096
TACCTTTTTTTTTTTCTGCATGCATACCTTTAATTATCTTGATAGAGAGGGATGTAAGTCTAGAAAACTCAAAATTAAGTCTTGCTAGGGTTTCTTAATA
AGATTAGAGATTCAAATAGATGCAAAACAAAATGAAAGATTACAGCAAACAACAAGACCCATGCAAAAACCCTAGCTTAATCATCACAACAACGACAACG
GACAACAAATTAAAAACTGCACTTGTTAAAACCCTAGACAAACAACAAACCTGATCTTCAACAAAAGGAACACAAATACAAATATTTAGATTATTTCAAA
AGCCTCGAAACCCTTGATACATCGTACGTTGTTTGTTATCAAGTGAGAGGAGGGCAGATAAAACCAGGAGGAGGATTGATTCCACAAGTGATGAGAGCTT
GAAGTGCAAGAGGAATGAAGATGTTTAAGTTGAGAAGCTTAAGTCTTATGGTTGTGCAAAGACATACGGCTGCTTCTAACTCAAGTAACCCTTGTAACAC
TGGACAACACACATTCTCGACTGGATTTCCAAGTCCAATATGGATCAAACCTCCCAAAACGTCAACACAAGCTCCGAGCTTCAATGCGTTGATTGGACAC
GTTGGCTGAGCGCCTCCTCCTCCGGAAGGTGGACCACCATGATACGGTGGATAACCAGTTGATGGTGGTGGAGTAGTGATCGGAGGTGGGTTAATGATCG
GAGGGAGAAGTCCTGGAGGTGTTGTGATTGGAGGGAGAATTCCTGGAGGTGTTGTGATAGGCGGTGGCCTTACCATTGGTGGTGGATAGACGACCGGAGG
AGGTCTTGAGATAGGCGGTGGCCTCACCACTGGTGGTGGATAAACCACCGGAGGAGGTCTAACAAACGGCGGTCCTCCACCTTGATGCGGAGGTCCTCCA
CCACCACCACCATGATGCGGAGGCCCACCACCTTTTCCACCATGATGTGGCGGTTTACTACCACCTTTTCCTCCGTGATGTGGTGGCTTCGGGACAGGAG
GGTGAGGGTGAGTGCAAGGAGTGCAAGCTTGGATCGTTGGTGGCAATGTGATGACCGTGGCGATCAAGAAAATGAAGAAGGAAGCCGAAACCCTGGAACC
CATTATTTGCTAATTTATTAGGGTTAAACTTTTACTGCATTGTTTGTCTAAT