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Detailed information on CNT3080078


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q42431|OLEO4_ARATH, E-value = 7e-22

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT3080078

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (70 aa)
QHIYSLYIPFLFHSQNILFGQHKTNLTHIDKIFKKTKKLGHNSKITLLPFQHLKKKNPTFLLKLPPCLTL*

>peptide 2 (29 aa)
AAYIFPLYPIFISLTKYFIWTAQNELNTY*

>peptide 3 (40 aa)
MLTFKTVINHNHALDMILYTCMHAHGLNLCLIHYLNISIN*

>peptide 4 (82 aa)
MVRAAGTITGLKRRKSGTESIKPITEPASVSPAKASNDPPIGTPAISATTCMIQLDPFKILLQLLAFFFVIINVNIQNCYKS*

Sequence

>CNT3080078
GCAGCATATATATTCCCTTTATATCCCATTTTTATTTCACTCACAAAATATTTTATTTGGACAGCACAAAACGAACTTAACACATATTGACAAAATATTC
AAGAAAACAAAGAAACTGGGACACAACAGCAAAATTACATTATTGCCTTTCCAACATTTAAAAAAAAAAAACCCCACATTTTTATTGAAGCTTCCTCCTT
GTCTTACGCTATAGCCCTCTTTGCCTGAACCGGCTCTCTGCTCAGACCCGTCAGACCAAATAACCCAGACGCCAAAATTCCGGTCACAGCGAGCCCTATG
GTGAGAGCTGCCGGAACGATCACCGGACTGAAGAGGAGGAAGAGTGGAACGGAGAGCATAAAACCTATCACCGAACCGGCTAGTGTGAGTCCAGCTAAGG
CTAGCAATGACCCACCAATTGGAACTCCTGCTATAAGTGCTACGACCTGCATGATACAGTTAGACCCTTTTAAAATTTTGTTACAATTGTTAGCATTTTT
TTTTGTTATAATTAATGTTAACATTCAAAACTGTTATAAATCATAACCATGCCTTGGATATGATCCTATATACATGCATGCATGCACATGGTTTAAATTT
ATGTTTAATACATTATTTGAATATATCGATTAATTAATACTTTTTGCATATTTTGTTTAGAAATCCTAAGATTAAATGTATATTGACCACTAGATTTTTT
AAGTTCTCTGTAACAGGTTCAAACTCATGATTCTTCACATATATTAGTCAATAATTTATTTATAATTTGCAGAAATTTTTTCATATATTTGAGTGTATAA
TCATAAGAAAGGAAAAAAAAAACACTAAAGAACACAAAAATACTTGGTTAGTGGAAGGGCCGCGACTCTTGTAATCGGCACCATAACCATAACCAGAGCC
ATAACCGACACGATCTTCGTACTGCGGCTGAAGTAGAAGTCCTTTGTCAGTACGGTCGACATTCACACGCACAGTCGCCATAGCTATTGATATGATTTAG
AACTACTATAAGCAAAGTTTAAATGGAAAAGAGAACACAAAAGGGATATAATAGATATATAAGCTGTTGTTGTAT