CANTATAdb - search

Detailed information on CNT3078255

BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q6YYX9|SLC1_ORYSJ, E-value = 1e-27

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT3078255

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (47 aa)
MNHALVYAVAHHFYLISQLNYQSSFNIRHTDPFFVGVHYLESLATLK*

>peptide 2 (49 aa)
MGYLIQPKFFVACLSYLRLSLSFFFSLSKLISLSRSHDIIIDHNIDHPF*

>peptide 3 (51 aa)
MFIISSSLSLFFFLSLETYLSFSISRHYHRSQHRSSLLNHRSQQHSNSSSL*

>peptide 4 (60 aa)
MSHENFLVEFCGLVPSSSGVALQVDCSQLHDESRSCICRCSSLLLDLPTELSKLLQHPAH*

Sequence

>CNT3078255
TTGACCCAAACCAAACCAATCCATAATCCTAATGGGTTAATAATTTGAGTGTTAATGGATAAATGGTTTTTGTGGGTTAGTGGGTTTAGTGAGTTGGATC
AATATTAGTCCGAATCAATATTAGTCCGAATCAATATTAGTCCGGATCAAAATGAGTTTATGGGTTACCTAATCCAACCCAAATTTTTTGTCGCATGTTT
ATCATATCTTCGTCTCTCTCTCTCTTTTTTTTTCTCTCTCTCGAAACTTATCTCTCTTTCTCGATCTCACGACATTATCATCGATCACAACATCGATCAT
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GTTTGAGTTTCTGAATCTGTTGGTGATTTTGGATTCAAAATCATCACGTCATATGGTTCTTCAATTTTGGATCCCTTACAGTGTGAAACAAATGACGGGA
GAAAGCAGAGAAGATTAAAGAAAGAGATCCTGAAAGATCGTTCCTGGCTCAAATCATCACATCATATTATCCAAGGTTGTCCACATTGTTCCTTACTCCA
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AAAGATGAGCCATGAAAATTTCCTTGTTGAATTCTGCGGTTTGGTGCCATCATCTTCAGGAGTTGCTCTTCAGGTAGACTGTTCACAGTTACACGATGAA
TCACGCTCTTGTATATGCCGTTGCTCATCACTTCTACTTGATCTCCCAACTGAACTATCAAAGCTCCTTCAACATCCGGCACACTGATCCATTTTTCGTT
GGAGTCCATTATCTGGAGTCCCTGGCTACTTTGAAGTAAGATTGTCAGCGAGCCGAAGTCCGAGTGTGGTGGCATTCCCAAGGTAATTTCAGGTTCAGGA
CATGCTGGATAACAGTTCACTGCCATGACTTGTGAGCCTTCTTCAGTTTGTTCTTGTAGCTAATAATTTGTTGGGGAGTTGTTGTTAATACTACACGTTG
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TTCAATGCAATTTGTATTTCGTTTATCACATTGTATATCATTGATCTTGTTTAAAATAGAAAGAGAGATCTAAATTTTTT