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Detailed information on CNT30726123


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30671254Lupinus angustifoliusSetaria viridis3.236.8194.34106reverse complement
CNT30383362Lupinus angustifoliusTriticum turgidum5.2834.1896.57175reverse complement
CNT30569652Lupinus angustifoliusActinidia chinensis4.1322.9997.81137reverse complement
CNT30147387Lupinus angustifoliusMedicago truncatula5.2826.297.14175reverse complement
CNT30435185Lupinus angustifoliusAegilops tauschii5.2831.9996.57175forward
CNT30657665Lupinus angustifoliusTriticum dicoccoides5.2857.3896.57175reverse complement
CNT30687939Lupinus angustifoliusTriticum urartu3.6831.0496.72122forward
CNT30323793Lupinus angustifoliusAsparagus officinalis4.1643.6796.38138forward
CNT30151602Lupinus angustifoliusBrachypodium distachyon4.4629.5496.62148reverse complement
CNT3040451Lupinus angustifoliusMarchantia polymorpha3.9522.3291.6131forward

Expression of CNT30726123

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (31 aa)
MILSLVCAKILFLVTNLYSDIYINWRVFSFA*

>peptide 2 (62 aa)
MYSRGTASDILEEGGDDVKSAWPLRAGPHTCYNGNYNGKQGCKAERIRKDCLSSDCSLQLTM*

>peptide 3 (35 aa)
MCCTNGVSHILFICATINLFILKIIFVQLLILEVN*

>peptide 4 (33 aa)
MAITMGSKAVRRSESGKIVSVRIVLYNLPCEIY*

>peptide 5 (31 aa)
MKVMKLFLAYTPTKLTMTVPLILKFIIDYAF*

Sequence

>CNT30726123
ATTAATGATCTTATCGCTAGTTTGTTACACCTAAGGTGTATATAATCACATGTATACCTTAAGCAAGACCAAGTTCTCTTGAAATCTAACAATAGGAAAA
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