Detailed information on CNT30697615


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30555582Oryza sativaOryza glaberrima101.0532.5198.262017reverse complement
CNT30597168Oryza sativaOryza meridionalis63.7371.9593.241272forward
CNT30371298Oryza sativaOryza glumipatula22.047.8586.36440forward
CNT30110006Oryza sativaOryza longistaminata65.0366.9894.451298forward
CNT30104449Oryza sativaOryza rufipogon62.5865.8899.441249forward
CNT30578550Oryza sativaOryza barthii101.0528.9198.222017reverse complement

Expression of CNT30697615

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (34 aa)
MANCGLLCWVQYARSVGLCQFMFGAMDLSWIFWA*

>peptide 2 (34 aa)
MRDRLVCVNSCLVRWICHGYFGLDQRLDELKFSL*

>peptide 3 (32 aa)
MEEFSVAVFDFYLVQLASPVVSFTYGLVLFHN*

>peptide 4 (30 aa)
MGLVIVRNSLWCIRCFLHSIQDCCYAFGSK*

>peptide 5 (60 aa)
MFSPFHSRLLLRFWVKITSEIDIIWRPFVCLENSGYLSPSCCAFMVVLSEHRHGHSSPRI*

>peptide 6 (47 aa)
MLWFRAMVNCNLLKFQYVNIVQLVCFHYKQLSKNILFVIRTFINQRN*

>peptide 7 (46 aa)
VEDGPMASFLFSRGHSSPFPLRRGWAGKSVGKGSIGFDLTSFAAVC*

>peptide 8 (29 aa)
LRMVPWLPSSSRAVILPLFPSAAGGLVSR*

Sequence

>CNT30697615
GTTGAGGATGGTCCCATGGCTTCCTTCCTCTTCTCGCGCGGTCATTCTTCCCCTTTTCCCCTCCGCCGCGGGTGGGCTGGTAAGTCGGTAGGTAAGGGAT
CAATCGGTTTCGATCTCACCTCGTTCGCTGCCGTTTGTTGATTGATGATCAGGCGCACCAACTAGCCGGATAGATTGCCCGCTTGCTCGTCCTTTTCTGG
TGCTTGATCCGTTCGGTTTGGGGGGGGTCTAGTTTCGGCGATTTGCTTCTGCTGTTGTGTTAGTTTTCTGAACACAGTATCTCTTTCGATTGGTTTATGG
CTAATTGTGGTTTGCTGTGTTGGGTACAATATGCGCGATCGGTTGGTTTGTGTCAATTCATGTTTGGTGCGATGGATTTGTCATGGATATTTTGGGCTTG
ATCAAAGGCTAGATGAACTGAAGTTTTCGCTCTGAATTGGTCATGGTTAGGATTGCTCACTGGCCTCAGATTATTGTTCGGTTCCTTTCAAGTTCGTGAT
GCTTGGTTTTGTTTGAGACCGTTCGTCTGCTTGCAGCTATGCAGTTTTTCCTTCGGATCTAGTAATTTTTATGATAAGGTCAAGTCATATCAGAAAATTT
AAGGTCTGTTCAGAGCTTTCAAATCACCGGCTTTAACTTGTTCAATTTCGGCAAGACATACTCTTCAGATTATCTTGAATATGGTTGTGTGTCATCTTAA
CCGGACCATGTATTGCTTTTTGGCTTTGATAAAAATCGTCACTATGTGCTAGGGCGTTGGAATGATTCTTCTGTGTCAGTTCTTAGTTAAAGTTTAACAT
CAGGATTTCTCGCGAGGATTTAAGGAGCTCTTTTTGACCGCCTTCCCTGTGGATTAATTTATCCTAGTACAGGAACTACAGATTACTTGCTGCTTGACCT
GCTCAGTTTGAGGTACAGATCTCGTGATTTCCCTGTTTACTGGTGTTAGTTTTAGGAACCTTGATGCTTTGGTTTAGGGCTATGGTTAATTGCAATTTAT
TGAAATTTCAATATGTCAATATTGTGCAGTTGGTTTGCTTCCATTACAAGCAACTGTCCAAGAACATTTTATTTGTAATACGAACATTTATAAACCAGAG
AAATTGAAGCTTGTTGTATGGGATTGGTCATTGTTAGGAATAGTCTTTGGTGTATAAGATGTTTTCTCCATTCCATTCAAGACTGCTGCTACGCTTTTGG
GTCAAAATAACAAGTGAGATTGATATTATTTGGAGGCCATTTGTCTGCTTGGAAAACTCTGGTTATTTAAGTCCATCCTGCTGCGCTTTTATGGTTGTCT
TGTCAGAACATAGACATGGCCATAGTTCTCCGAGAATTTGACGTTAACTTGTTTACTTCCGGAAAAGCTATATCAGTCAGTTATTAACTTGCTGTGAGGG
TGGTTATGTAGTAACTAAGAAGACACATCCTAAAGTTTCTGTGGTAGACGATTCATTTGGCAGTTCTTTCGAACAATATTACAAGGTTGTGAAGGTGATT
CTGAAATCTTTTGACTACTTTGGGTGAAATTAATTTGAAGATTTATTTCAAGAACATTTATGGACCTCAACATTATAAAGCCATCTGTTTGAAGTTTCTT
CTGAGTAGAAACAATTGCTTTATGAACCATGGAGGAGTTCTCAGTAGCAGTATTTGATTTCTACTTGGTCCAGCTTGCATCTCCAGTAGTATCCTTTACA
TATGGGCTTGTACTGTTCCATAACTAGCTAGGATATGGGTTCATTTCAACATATGATTGGCCCTCTTGTATGTTGGTTTGGTGTCATCTTGTAATTTGTG
TGTTCATTAAGCTTCCCTCTGATGTTGGAAATTGTAATTATCAAATGATATAGACGTCCATATACTGATTTAGTCTGTATAATAGTTGTAACATGGTAAT
TTGTTTTGATAATCCTGAGTTGTAACATGGTAATTTTGTCCATATACTGATTTAGTCTGTATAGAATGAAACTCTATGGCTCTTGTGGCATTGTTC