Detailed information on CNT30697496


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9FPJ5|LRR1_ARATH, E-value = 5e-12

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30697496

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (31 aa)
MQVRTAILHKSMKNSESNHSQNPITIPMIVA*

>peptide 2 (46 aa)
MRCFEHGSDEIFMVVTGKVSTIPIAMQMSLVCASCNCVLMWTIIKL*

>peptide 3 (34 aa)
MHSTQFHKAHNRCCKLMDRSVSQAGHLWVPFLTE*

>peptide 4 (36 aa)
MHCKINPGTLGHSYCQYHLGYCQIYYFLIILGTGDP*

>peptide 5 (47 aa)
PSPRAEPVLLSGVPAAFMGRRRRRRCSWCGPRRRRFSGVRSTPIYPW*

>peptide 6 (48 aa)
QAHAPSPSSSPASRPHSWGGGGGGVVVGAARGGGASPASALPQSTRGR*

>peptide 7 (39 aa)
MAEAFPTSSYFSPAISEAEIHCIDQVVIPPINCCWTSLE*

>peptide 8 (53 aa)
MICHLVDTQIMRCSLLNFLYEVAAFASFQLYYIFCLWLLWGPEYTVVLAHRLD*

>peptide 9 (58 aa)
MLSLLFCCIIDLKLAKCAVCWLNLPIDCQLDQVAAVENDLIVARVCILRTYLSITEEF*

Sequence

>CNT30697496
ACCAAGCCCACGCGCCGAGCCCGTCCTCCTCTCCGGCGTCCCGGCCGCATTCATGGGGCGGCGGCGGCGGCGGCGTTGTAGTTGGTGCGGCCCGCGGCGG
AGGCGCTTCTCCGGCGTCCGCTCTACCCCAATCTACCCGTGGTAGGTAGGCCGATCTCCGGATTGGTGAACAATGGCATTTCATTTACGCTTTTAGTGTT
ATGTGGTTTCGTTTGGGGACGATTAGGAATCTTAAGGATGCTGCGTGTTTAGGAGGATTTGCTCATGTTCTTTGCTGTTGAGGTTTTGTTCGATCCCTTC
AAACTTCTAGGCATTGAGTAGAAATGTTTGAACCAATGACCAACTGCATGTTCACTAATTTCACGAAATAATGCGATGCTTTGAGCATGGTTCAGATGAG
ATTTTCATGGTGGTAACTGGCAAGGTGTCCACAATCCCCATAGCTATGCAGATGTCGCTTGTGTGTGCTTCATGTAATTGCGTTTTGATGTGGACTATCA
TTAAGCTATAAACATGTGTAAAGTGGATTGGTAACTGATTCTATTCTCTTGCACATTTTCTGATGATTTGTCATCTGGTGGATACCCAAATAATGAGGTG
CTCCCTTTTGAACTTTTTATATGAAGTTGCCGCTTTTGCCTCATTTCAGCTATACTATATTTTCTGTTTATGGTTGCTATGGGGTCCAGAGTATACTGTG
GTATTAGCGCACCGGCTTGATTGAATTAAACTATGTTAGAGAAATAGGTCGATGTTTATAATGTTTGCACTAGGATGTACTGCTACAAAACTTGTGGAGT
AGAGTAGACAAGAGGGGGATGATCTAGGTAGGAGAGCTCTACCTAGAAGAAACATCATTGACATGAAACATTATTGTGAATCATCCATGACATTGTTAAA
AGAAACATCGGGCTGTAAAAGTATTATAAGCATTAGAGTTGCCCTATAAATCTAATTCTATCTAATATAAGGATGTTGTGGTTGTATTTTGCCACACAGT
TACTTTGGTTCTGCTATGGTTTCATAATTGTTTTTCAGTGTAGACAGATATGATAACCACCGTACGGAATTAGACTACCAGAAATCCTCTTACGTTCCGA
CATTGTTAATACCACAATCGATGCCAATGCACCGAATTCTTTGCATAATCTTATTCTGCACATAATCAATGCAGGTTAGAACTGCAATCCTCCATAAATC
AATGAAGAATAGTGAGTCAAACCATAGCCAAAATCCAATAACAATCCCTATGATTGTGGCTTAGTAAAGACCTAAATTCATCCTTATTTGGTTCAGATCC
AAATCTGGAACTTTCAATTGGGCATGCACTCAACACAGTTCCACAAAGCCCATAATCGTTGCTGTAAATTGATGGATCGTTCAGTGTCTCAAGCTGGCCA
CCTGTGGGTGCCCTTCCTGACAGAGTGACAGGTGGTTATTAGAGAGATGTAAGGAGCTGAGAAATGTTAAGCTAGAGATGTTGGTCGTAATATGACCTGA
AAATGCATTGCAAGATAAATCCAGGGACTCTAGGGCATTCATATTGCCAATATCATTTGGGATACTGCCAGATATATTATTTCTTGATAATTTTAGGAAC
TGGAGACCCTTAAGGTTTGCAAACTCTGCAGGTATCTCATAAGAAAAAATGTTGCTTGTAAATCAATAACTGCCAGAAGTGGAATTGTGCTTTCAAATGT
ATAAGATCTGCTCTTCCAAATTAGTTCAATTCTGTTAGAATATGGGGACAAAAAGTAATTTGAATATGTGAACGCAACATATGTTGATCCAATGTTGAGC
CTTTTGTTCTGTTGCATCATTGATCTGAAGTTAGCAAAATGTGCTGTGTGCTGGTTGAACCTACCAATTGATTGTCAGCTAGATCAAGTAGCTGCAGTTG
AGAATGATTTGATAGTTGCCAGGGTATGTATCCTTCGAACATATTTGAGCATAACTGAAGAATTTTAAGAGAAGGCAAGCTTTCCCATATCCTTGAAGAA
ATTTCAGCAGATAGCCTATTGTCCCGGAGATCTACCATTGTTAAGTTCTTGCAGATGGGAAGACTTTTGCTTGTTGAGGTTGGGACTTTGCCAGAGAAAG
CATTGCTTGACAAATCTAGGAAAAACAATTGTTGAAGATTTGACCAGCAAGTAGGGAGGTCCCCATAGATCTGATTGCTTGATAGATCCAAGAAGTTCAG
TAAAACCAATTGACAGAACTCCTGAGGAAGCATCCCTGTAAATTGATTCGAATCGCCTGTGCAATGTCACCAGAGAAGTGGTTTTGCCCTATCCAAGCAT
ACGCCAATTTTGGACATGGCAGAAGCATTCCCAACAAGTAGTTATTTCTCACCAGCAATTTCTGAAGCTGAAATCCACTGCATAGATCAGGTGGTAATTC
CCCCAATAAATTGTTGTTGGACTAGTCTAGAATAAGGAGTGCGATGCTTTTCTAGTTCC