Detailed information on CNT30694556


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30110154Oryza sativaOryza longistaminata51.9937.398.091097reverse complement

Expression of CNT30694556

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (50 aa)
MVKAHHQQVEPSYLVLQFLVSKVVLWQKIDCFNLNGIKTKLQILMKHMLR*

>peptide 2 (46 aa)
ELPAEVRSHRGEWKLLEPYPPFSFLSRCGWLNLPLRARRGFASRTF*

>peptide 3 (64 aa)
SCRRRCEAIEVSGSFWNLTLLFPFYLAAVGLICLCGRVAVLLLEPSSSCGGMKFLRECQMWIRH*

>peptide 4 (33 aa)
MFVCRSLANLDQWNALVVQCSWKLWSSPCDSVS*

>peptide 5 (33 aa)
MTFSFSGAMLGLALFKIRGSIFLLSRAQNFSCE*

>peptide 6 (42 aa)
MFHGLMDKQDNCVQNPACSISALSRCSFAASKAWLIAIPLPL*

>peptide 7 (39 aa)
MVAPSMRLQLHYLQGNHKSQETHVITMDVRFFYSQFIFP*

>peptide 8 (30 aa)
MMSVVNIQKMTLFFATISFQLFRLSYFSML*

Sequence

>CNT30694556
GAGCTGCCGGCGGAGGTGCGAAGCCATCGAGGTGAGTGGAAGCTTCTGGAACCTTACCCTCCTTTTTCCTTTCTATCTCGCTGCGGTTGGCTTAATTTGC
CTCTGCGGGCGCGTCGCGGTTTTGCTTCTAGAACCTTCTAGTTCTTGTGGTGGTATGAAGTTTCTCCGTGAGTGTCAAATGTGGATCCGCCATTAGAGAT
GGATTTGAGTTCGCTGTGCTTTGTGACGATAGGCTTGTTTCGGTGGAGATTTCATGGATAGGTCGACGACGAGTTCATAGAAGGAGGGGCTTTATATGCA
TTAGATGAACGGCTTCCAACAGTTTCCGTAGCAAGAAGCTTCTATGGTTTAATCTAATTCTAGGAGGGCGGTAGGGGTGATGTTTGTGTGCCGAAGTCTT
GCTAACCTGGATCAATGGAATGCGCTTGTTGTGCAATGCAGTTGGAAACTGTGGAGTAGCCCGTGTGACAGTGTGAGTTAATTACTTGGTTGCTTATTTG
AGGATTAGGATACACACAGGAGGTCATGAGATGTTGTTTGGTTAAACTGAACATTTAATTTGTAGTCTATTAGGCTGAAAGGAAAATAAAGAACCATTCA
GCCTAGTTGCAAGACTAGTTTTTCTTTGTAACGTTGGTGAATTGTACTGTGTTTAAGCCAAACTAAGTTGTTAAAGGTTTAGACTGACGTCCCCTTATGT
GATGTTTATCTTTGTTGTTGTTGTCATATTTTGAAAATTGTGCATTCACCATCTCTAAAATAGCTCATAGGGCATTAACGAGTGATTTCAATCGAGGTGC
CTTGTTTACAACTATTGCTTTGCATATTCTGATCATTGCAATGTTTTCAACCAGTTATTGCATATGGTGGCACCAAGCATGAGGTTACAACTGCATTACT
TGCAAGGGAATCACAAGTCACAAGAAACACATGTTATTACAATGGATGTAAGATTTTTTTATTCCCAGTTTATTTTCCCATGATTTTGCGACAGTGAATA
GTTTTATTTTTTTTAAATAAAATGAACTTACATGATCATTGATGTTGTCTTTAACAACAACTCACCAATGAACAACCATACATTGTCATATGTGAACTCT
GGTTAAAGAGTATCTTTTTGTAACTTAAGATAAATGGGCATCTGTCCTGCAAATGGAGATGGAAAGTTTGCATAGAAGTAACAGTGATATGCTATTCTGC
TTATAATCACCTTTCCAGATATATGTTGTGCTGTACTAGCAGTCTAATACATACTATATGATGTCTGTTGTTAATATTCAGAAAATGACCCTGTTTTTTG
CCACCATAAGTTTCCAACTTTTCAGGCTATCATATTTCAGTATGCTGTGATAGATAAGTGAACCTCTTTGTGTGTAAATGTTTCATGGTCTGATGGATAA
ACAAGATAATTGTGTACAGAACCCAGCTTGCAGCATATCTGCATTAAGCAGATGTAGTTTTGCTGCAAGCAAAGCATGGCTTATTGCTATACCATTGCCT
TTGTGAGTGGAATGGTATATCTTCTAAATTAAGGAAAAGATGACTTTCTCCTTTTCTGGAGCTATGTTGGGGTTGGCTCTGTTCAAGATCAGAGGGAGTA
TATTCCTCCTCTCAAGAGCTCAAAACTTTTCTTGTGAATAAGTTTCCATGTTAAGGACTGCATAGAGCCCCTTTTCCATTGATAGGTACACCCAAGGCAG
CGGGCAGTCTCATTATATAAAATTATGTTGGTATGGTCAAAGCGCACCATCAGCAGGTTGAACCTTCCTACTTAGTTCTTCAATTCCTTGTGTCAAAGGT
GGTCCTATGGCAGAAGATTGATTGCTTCAATCTAAATGGAATTAAAACAAAGTTGCAGATATTAATGAAGCACATGCTAAGGTGACCTTCATCTGAGATG
TGACTATTGACATCACATACGCTCATTTTGAGTTGGTTCTCTAAATTCCAGAGATCTCTTGCATTTAGGCCAGCAAGCTCCTGTCCATATTTATCAATAA
ACACAGGACGGAGTTGATTTAACATTCTGAGAAAAATTGTCACAATTTGATTTCTTATACATGTATTCTTTCTCACTAACTTACTAATATTATGGAAGAG
AAGCTGCTTC