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Detailed information on CNT30693591


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30574947Oryza sativaOryza barthii7.9835.5888.06201forward

Expression of CNT30693591

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (30 aa)
MIYYCKGLPSSTNISIPNVQNLSISIIIKN*

>peptide 2 (35 aa)
MRWHHHQLYNDYLENKISFLHFLFFFHLFFLPFIF*

>peptide 3 (31 aa)
MQSCYPSYRQKATGKRWTKGFSLTALDHKNT*

>peptide 4 (31 aa)
MHPFLGLASAGKNNILIAKFLSIFNRTFHLF*

Sequence

>CNT30693591
TCGCTATATTTGGATTAAAAATAATATAATAATGGCGACCAGTTTTTTCAGTGTCTAACAGTCGTATCATGTTTTTCATGGGTGTCATATAACAAATTTT
ACCAATTAAATTTCATCATTTATGGATGCACCCATTCTTAGGTCTAGCTTCCGCTGGTAAAAACAATATTTTAATAGCAAAATTTCTAAGTATATTTAAC
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CTCTGAATCGATGATTCTTGGAGAATTATATGTCTAGACTAGATTCACAAATCCATATATCTGAATCTACGATTATGTTAATATTATTTGGGAAAATTAT
ACTATTTCTATTTTAAATAAAAATATAAATTTTAAATCACTATAATTTTGAACACTACAATTTAACATATGAACTTTTAATCCGTGTGTTTTTTTTAAAA
AAAGAAACAGTGCATCTA