Detailed information on CNT30693108


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot:
sp|Q9FNI1|GIR1_ARATH, E-value = 3e-16

BLAST vs NONCODE: nothing found

Expression of CNT30693108

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (49 aa)
MVLGSRANAIGLGIKGKVSELKATMKARLTQMRAHNCATRLLLSTGYGI*

>peptide 2 (50 aa)
MFFFHLSERRKFPVMNLLFFFLTSAVVFFSHMLDDCGNLPTVSLVENCNP*

>peptide 3 (77 aa)
MKQRGQAASTMDVASGLLDHCRPCSFSDDRHELGDDSSSAAIALLDDESPLAGSERFSFRSMPLELFLLLRLIPIER*

>peptide 4 (38 aa)
MEGDLIMLQRGSSSTNWKSRITGLLHCGHRGSSCGSMT*

>peptide 5 (44 aa)
STLFLGFSLRKSKDESKRKCSSSRLLLTRSCWMDGGLLQVSSVI*

>peptide 6 (32 aa)
MLPFWANRSSNGWFWDPEPTLSASGSKVKSRS*

>peptide 7 (30 aa)
MMMTYNSLKVVLVCVLHWVWSMLLLIKVKR*

>peptide 8 (34 aa)
MVDCCRFLRSSERFILIQPGTNGWSLCVIMKIWT*

>peptide 9 (33 aa)
MKGEELRAGRIARGLLAGWCGWTEKRWQVFIGG*

>peptide 10 (32 aa)
MKLRGRRRHGDGEGTYCCVGPVRRADDGDWRR*

>peptide 11 (32 aa)
MEFIGHTISNAQHCCQKKKERRENLNVEPWLC*

Sequence

>CNT30693108
ATCGACTTTATTCCTGGGGTTTTCGCTTCGAAAATCAAAAGACGAATCGAAGCGGAAGTGCTCGTCTTCTCGGCTTCTTCTAACTAGATCCTGCTGGATG
GATGGTGGATTGCTGCAGGTTTCTTCGGTCATCTGAAAGATTCATTCTTATCCAACCAGGAACTAATGGCTGGTCTCTATGTGTGATTATGAAGATCTGG
ACTTAATCTGAGATGTCTTTATCAAGTGAACATAAATATATCAGCTTGGCAAAGTTGACTAGAGAAGCAATTAAGAGATAGTAGAGTGTCCATGGAAGGC
GACCTCATTATGTTGCAACGTGGGAGCAGCAGTACCAATTGGAAGTCAAGGATCACGGGGCTCTTGCACTGCGGGCACCGCGGATCATCCTGCGGGAGCA
TGACGTAGATGAAGCAGCGAGGGCAGGCGGCGAGCACCATGGACGTCGCCTCCGGGCTGTTGGACCACTGCAGGCCGTGCTCGTTCTCCGACGACAGGCA
CGAGCTCGGCGACGACTCCTCGTCGGCGGCCATCGCCCTCCTGGACGACGAGTCCCCTCTCGCCGGCAGCGAGAGGTTCAGCTTCAGGTCGATGCCCCTA
GAGCTCTTCTTGTTGCTGCGGCTCATCCCGATCGAGAGGTAACCCACTTGCCTACACCCCCATAAAAACGTTCGTTAGCCGGTTGGTCAAATGGAAACTT
TTGCACGACTGTCATATGAAGCTTAGAGGTAGGAGAAGACATGGCGATGGCGAAGGAACTTACTGTTGCGTAGGGCCGGTGAGACGTGCAGATGATGGTG
ATTGGAGACGATGAAAGGGGAGGAGCTCCGAGCGGGTAGAATTGCTCGGGGTCTTCTTGCTGGGTGGTGTGGTTGGACGGAGAAGAGATGGCAAGTATTT
ATAGGGGGATGAGATGGGTGAGGGTGAGGGGGAGGTCAATTGGTTTTCTTTAATGCAGCATTAAGAGTATAGCAGTACTACTACTACTTCATGTACTAGA
GGCTAAGGAAGGACGCATTTTATTACCAAGGTATTCATGGCTGGAGAGTGGCATGGTAGGGGTTGAATAATCTGTGTTGGGTGGGAGAGAAGTGCGAGGT
GAGAGGCTTTATGGTTGGTCATATACACAAGGCAAAGAAATGTTTTTTTTTCATTTATCTGAAAGAAGAAAATTTCCAGTGATGAATCTTCTCTTTTTTT
TTCTTACTTCGGCGGTAGTTTTCTTTAGCCACATGCTAGATGACTGTGGCAATCTCCCAACAGTGAGCCTGGTTGAAAATTGTAACCCATGATAGGCATG
TCTAGTTTAATTGTGCCAAAAGTTTGCTAGTGACTTAATTACCTCCAGTAGATTTTACAACTTTGTAGTGGCCATGTAAGCAAGTTAGCTGGACTTATTG
GGTAATTATGACAATTATTTATTATTTTTAGGTGTGGAGTTGAAAGTTGAAACTCATCAACTATTTGTCCTTTTTGATTGCTTCTAAAGATTATAGAAAT
TTGACTGACCTCCAATTCATTTCACTACTTCAATGTGGCCTTGAATGGAATTTATTGGGCACACCATCTCAAATGCCCAGCATTGCTGTCAAAAAAAAAA
GGAGAGAAGAGAGAACTTGAATGTTGAGCCATGGTTATGTTAATCGAATAAATAGGTTTCTTGAATAGATATGCTGCTAGTGCACCTTATGCAATTAGGT
CTTTAAATGGTGCAACGCAACACCTATGTTCTTGCACGCACCGATGCGTTGCTTCTGGTGCGCATCTTGATACAATGACGACGAGATAAGTAATACATTA
ATGCCACTTTGTTTGATGCACATAAGAGCAGCACTTTGAAATCTCAGCTCCGTTGGGGTTTTTCTTGTTTCCAGCTTGCAGTGTTTAAATGCCGAGAGCA
GATATTAAATTCGTTAGTTGACTTGTTAGTGTTATGGAGATGTTGCATCCTGATTGTGTGACTTAATCACCTTACAATTAAGAAAAGGGTTAAACTTTGT
AAAGTCATACTAGTATCAACCCACTAATGTAATCCCCGAGATTGCTTACATATCCCACCTTGATTAATGATGATGACATACAACTCACTTAAAGTTGTTT
TGGTTTGTGTGTTGCATTGGGTTTGGTCAATGCTGCTACTCATCAAGGTTAAGAGATAGCCACCTGTAGAGAAAATAATTTGCCTCAGTTAGGACTAATT
CTAGCATTAATGCTCCCGTTTTGGGCAAATAGAAGCAGTAATGGATGGTTTTGGGATCCAGAGCCAACGCTATCGGCCTCGGGATCAAAGGTAAAGTCTC
GGAGTTGAAGGCAACTATGAAGGCAAGGTTGACCCAAATGCGAGCTCATAACTGTGCCACTAGGTTATTGCTTAGTACAGGATATGGTATATAAATGTAT
CTTTGCACGTATATATTGCCATTAGTCGGTGTATGGGGGCCAAACCCATGTGCTCTTCTTTAATTCCATGGTGGCATCTAAGGAGCTTAATTAGAGATTA
TGAGTGAAAAATAATCTCCACTGAGTTTTCTCGCGCCTTCTTGTTGTGGTTGCAAAGGCAATGAGCTCCAATGCAAAATAGTTGGAT