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Detailed information on CNT30691513


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002853, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30100124Oryza sativaOryza rufipogon94.1698.6299.771291forward

Expression of CNT30691513

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (32 aa)
SLFPRSPLLSLTAHALPVPPLLRQRRRRRRSP*

>peptide 2 (33 aa)
MVVTTTAAAAACFGLHDQPETWVGNDSHKLFYQ*

>peptide 3 (40 aa)
MINIVLVIHLLAWLFPSCTCDTSTWLVRWDNLKLFVNFLN*

>peptide 4 (64 aa)
LFFLVLPFSPSRLTLSQCRRFLGSAGDAAALPSAGYRAPLRRPLKQMSRSRESVYWLHASLPLS*

Sequence

>CNT30691513
ATCTCTTTTTCCTCGTTCTCCCCTTCTCTCCCTCACGGCTCACGCTCTCCCAGTGCCGCCGCTTCTTAGGCAGCGCCGGCGACGCCGCCGCTCTCCCTAG
CGCCGGCTACCGCGCCCCACTCCGGCGACCCCTCAAGCAGATGTCCCGCAGCCGCGAATCGGTTTATTGGCTCCACGCTTCTCTGCCCCTAAGCTAACCC
CAGCCACCAGTCTCCTGCTGCTGCTGCCGCCGTGGAGATGGCTGGTGGAAACACAGCGCAACTCCGGTGGCTGCATCCCTTTCCCCCATAGGATCTACTC
TCCTCCCCTATTTTAATTTTTTGGTTACCTCGGTTGATTCTACCGTGATTGAAAAATGTGTGGTTCAGCTCCTCCTCCAGAACTCCAAGTCTTCTCTTCT
ACTGCTGCTCTTCTGGATCTAAGGTAATTCTCCTCCTTGGCTCTTGCTCTACTGGTAATATTTGACTGCTTCCTGACATCTTCCTTGATCTGCTTCTGGT
GATTCTCTTCCTCCTCTTCAGACTGATCCTCTTGCTTGATTTTCGCTCCATCTTGCTTCTTGACCTGAGTTTCATCTCTTCCTAGAGCTGAAACCCTTCT
TCATCCAAGAACTAAACAACCCTGCTTCTCCTTCAGATTTGGTTTTCCTCTCTCTGATTACTTGGCCATGGTTACTACTACTGTTGGTTCATGTATTGGT
TTGAGCTGGACTTCAGTTGAGCTATTTCTCTCTGGGTGGAGCTAACACTTAAGCTAATTTTTCCTGGAGCTTGGTTCTATGGTTGTAACTACTACTGCCG
CAGCTGCTGCTTGTTTTGGTTTGCACGACCAACCCGAGACTTGGGTTGGAAATGATTCACACAAATTATTTTATCAATGATAAATATTGTACTGGTGATT
CACCTGCTTGCATGGCTATTCCCATCCTGTACTTGTGACACCTCAACATGGCTTGTTCGGTGGGATAACCTAAAGCTATTTGTTAATTTCCTTAATTAAT
GGAAAATTGGTAGAGTCTGAGGTGTTTGATACTTTTGCACTTGAATCCCTCAAGTCTGGTAAAATTGGAGGTTACCATTAGTTTAGGGACTGATTTGTAA
TTTGTTCTATAACGCAGGGTCCCTTTTTGAAATATTACTAATTACACGATATGTTCTCGGCTAATGTATTTGTACAATATATGAAATGCATACTGTATAA
TAAGATTTTAAATATATAACTATATCCATGTATGTATGGATGGTTGCAAAACTGTACTGGTCAATTGTGAATAAAGTGCTATAGCTTCCATGGTGATTTC
TATTGTGCATAAGTGTTCCGCTCTTAGTGATGACTAATCCATGCTATAATTCAACCAAAACTAAATTATCC