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Detailed information on CNT30691479


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE:
NONORUT002853, E-value = 0.0

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30596782Oryza sativaOryza meridionalis20.6732.4892.09253forward

Expression of CNT30691479

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (40 aa)
MINIVLVIHLLAWLFPSCTCDTSTWLVRWDNLKLFVNFLN*

>peptide 2 (33 aa)
MVVTTTAAAAACFGLHDQPETWVGNDSHKLFYQ*

>peptide 3 (56 aa)
SPSRLTLSQCRRFLGSAGDAAALPSAGYRAPLRRPLKQMSRSRESVYWLHASLPLS*

Sequence

>CNT30691479
CTCTCCCTCACGGCTCACGCTCTCCCAGTGCCGCCGCTTCTTAGGCAGCGCCGGCGACGCCGCCGCTCTCCCTAGCGCCGGCTACCGCGCCCCACTCCGG
CGACCCCTCAAGCAGATGTCCCGCAGCCGCGAATCGGTTTATTGGCTCCACGCTTCTCTGCCCCTAAGCTAACCCCAGCCACCAGTCTCCTGCTGCTGCT
GCCGCCGTGGAGATGGCTGGTGGAAACACAGCGCAACTCCGGTGGCTGCATCCCTTTCCCCCATAGGATCTACTCTCCTCCCCTATTTTAATTTTTTGGT
TACCTCGGTTGATTCTACCGTGATTGAAAAATGTGTGGTTCAGCTCCTCCTCCAGAACTCCAAGTCTTCTCTTCTACTGCTGCTCTTCTGGATCTAAGGT
GATTTTGCTAGAACTGAGCTTCTCCACCTTGAGCTTGACTGATTGTTTCCCCCCTCTTGAACTGAACCCCCATGCTCTACTTGGAACTCAGGTAATTCTC
CTCCTTGGCTCTTGCTCTACTGGTAATATTTGACTGCTTCCTGACATCTTCCTTGATCTGCTTCTGATTTGGTTTTCCTCTCTCTGATTACTTGGCCATG
GTTACTACTACTGTTGGTTCATGTATTGGTTTGAGCTGGACTTCAGTTGAGCTATTTCTCTCTGGGTGGAGCTAACACTTAAGCTAATTTTTCCTGGAGC
TTGGTTCTATGGTTGTAACTACTACTGCCGCAGCTGCTGCTTGTTTTGGTTTGCACGACCAACCCGAGACTTGGGTTGGAAATGATTCACACAAATTATT
TTATCAATGATAAATATTGTACTGGTGATTCACCTGCTTGCATGGCTATTCCCATCCTGTACTTGTGACACCTCAACATGGCTTGTTCGGTGGGATAACC
TAAAGCTATTTGTTAATTTCCTTAATTAATGGAAAATTGGTAGAGTCTGAGGTGTTTGATACTTTTGCACTTGAATCCCTCAAGTCTGGTAAAATTGGAG
GTTACCATTAGTTTAGGGACTGATTTGTAATTTGTTCTATAACGCAGGGTCCCTTTTTGAAATATTACTAATTACACGATATGTTCTCGGCTAATGTATT
TGTACAATATATGAAATGCATACTGTATAATAAGATTTTAAATATATAACTATATCCATGTATGTATGGATGGTTGCAAAACTGTACTGGTCAATTGTGA
ATAAAGTGCTATAGCTTCCATGGT