Detailed information on CNT30691387


BLAST search results

BLAST vs Swiss-Prot: nothing found

BLAST vs NONCODE: nothing found

Results of reciprocal BLAST search (potential orthologs)
TargetQuery speciesTarget speciesQuery coverage (%)Target coverage (%)IdentityAlignment length (nt)Orientation
CNT30595715Oryza sativaOryza meridionalis19.2464.4197.7914forward
CNT30107393Oryza sativaOryza longistaminata14.1948.5998.96674forward
CNT30100463Oryza sativaOryza rufipogon14.0461.65100667forward
CNT30575447Oryza sativaOryza barthii15.2431.8499.59724forward
CNT30603702Oryza sativaOryza punctata10.7138.9492.93509forward

Expression of CNT30691387

Peptides detected in this lncRNA

>peptide 1 (35 aa)
MFVTLRLQGCNSLTIDCRTDHIKTAAKMVQNRVLC*

>peptide 2 (32 aa)
MCFSLMRKVRLIVLAPIPCEFVGDFFRLIRFH*

>peptide 3 (43 aa)
MTLFIRKVVLIIHAMLHVWFIYVLILIRYLVSFFTNLKLKLNC*

>peptide 4 (41 aa)
MMNHSSFYYFNFPDFAIVSLSYYWRTDLYSVRQIINLSDQL*

>peptide 5 (29 aa)
MFTFGRKKMCMTVLKQMKNSSFYEVNFCC*

>peptide 6 (32 aa)
MLTNHNDFIYKEGCFNYSCNAPCLVYLCFNLN*

>peptide 7 (32 aa)
MQASLLSITSKLHCGICFQDDLIFFRVDIFLT*

>peptide 8 (67 aa)
MKIVPSVLIMKAAHVNCLVHPDHLLLFTLIRLRRLYIVYWLPLLNVSLITHDMLAWKGNFELIMRFA*

>peptide 9 (44 aa)
MNQVISVIKSLRLKYTHYENHAVNCQERYGHLMQLIICLLYLFA*

>peptide 10 (45 aa)
MPFSASSRRPLPSTVPVRRARGFSDSCKGMVTSLWQQLHILQENL*

>peptide 11 (79 aa)
IAASSDISSPLLRREQHVSRLLLRFHGHMPRHGHPRARAPARRPHAASAAQIRRTLLPLLSRHRRHRRARRRGAAAPIS*

>peptide 12 (84 aa)
DRGQLRYLFASTPPGATCVAAFASLPRPHAAPRAPARARARAPSSRRVRRPDPAHAPPPFEPPSPAPPRATARRSRTDLVNSPP*

>peptide 13 (65 aa)
MQYIFMLQWCKYLKLAHTKIICAPISIKRSNNFILVIISSKFSVLHTPPMAPLPKIYHKRDTYFP*

>peptide 14 (56 aa)
MIPFWWRSVLLFFLSSQFLIDTESCQFEVGQKSESPKFISARCTCDYSTQPKVSLY*

>peptide 15 (60 aa)
GSRPAQISLRLYSAGSNMCRGFCFASTATCRATGTRARARPRAVLTPRPPPRSGARSSPF*

>peptide 16 (50 aa)
MEAGTCFDKVDIILMVLLNLLINKNIFISMDASATRQLQMNSSTYEHLAR*

>peptide 17 (55 aa)
MVDISLVDNVLLSLFSCLVYYFHNKCVQTDLQFFGNYPCIYILNQRLVILDRHRT*

Sequence

>CNT30691387
GGATCGCGGCCAGCTCAGATATCTCTTCGCCTCTACTCCGCCGGGAGCAACATGTGTCGCGGCTTTTGCTTCGCTTCCACGGCCACATGCCGCGCCACGG
GCACCCGCGCGCGCGCGCGCCCGCGCGCCGTCCTCACGCCGCGTCCGCCGCCCAGATCCGGCGCACGCTCCTCCCCCTTTTGAGCCGCCATCGCCGGCAC
CGCCGCGCGCGACGGCGCGGCGCAGCCGCACCGATCTCGTGAATTCCCCTCCCTGACCACTCTCCCGGCCCCGGCCCCAGCCACCACCTAAATCGCAATG
CCTTTCTCCGCTAGCTCCCGCCGTCCCCTCCCCTCGACGGTGCCGGTGCGGCGCGCGCGTGGTTTCTCAGATTCATGCAAGGGGATGGTGACAAGCTTGT
GGCAGCAACTGCACATCTTGCAAGAAAATCTTTAGGGTTTTTCAGACCATACCGATGATTTTCTTGCAAGTTGTGCAGTTGTTGTCTCAAGCTTGCTGCC
TCCCTTTGCCAAAACTATCAAGTGAGAAAGCAGGGTAGAGTTATTCAATTACAGGCACACAAGACAAAATTAAAGTAATAAACATGTCTGACCAACAAAC
ACAATGATTAATAACAAAACTCTTGTGGCATGAGATAATATTGAAGCATGATGCTTACAACAGTTATAATATGAAAACTAGATGGAGGCAGGTACATGTT
TTGACAAGGTTGACATTATCTTAATGGTTCTTCTAAATCTTTTGATTAACAAAAATATATTTATTTCCATGGATGCTAGTGCCACCAGGCAATTGCAAAT
GAACTCATCAACATATGAACATCTAGCAAGGTGAGTAAAGTCTGGTAAGGTGCTAGATGAGTAAAGTCTGGTAAGGAAGTCAAACATCTAATATGTATGA
AAATTGTTCCTAGTGTTCTTATAATGAAGGCTGCACATGTAAACTGTTTAGTCCATCCTGATCATCTATTGTTGTTTACTCTGATCAGATTACGTCGTCT
CTACATTGTGTATTGGCTTCCACTGCTGAATGTTTCTCTTATTACCCATGACATGCTTGCTTGGAAGGGCAATTTTGAGTTGATCATGAGGTTTGCATGA
ATTTCTCTAGGAATGCCCAGTGAGTGATCCTGTAAATTTTGGAGTTGATTGTTCATCAGAATAGCACTATAATTTTCCTGTCACCTGTGCTTTGGTAGCG
GAACGTTCATTGTCCCATGCTACTCAGCTTTGTACTTTTGTAAATCAAATGAGACTGAATAATATATGTTTACTTTTGGAAGGAAAAAGATGTGTATGAC
TGTTCTCAAGCAAATGAAAAATTCCAGCTTTTATGAAGTTAATTTCTGCTGTTAACATGCTACCTAGTGCATTCCTAGAATCCTAGTTAGTGTCTTAAAC
CTTGGTTGACCTATTCAGCAGAATGCAAGGTTTGTAGGGATTACTATTTGAGAAAGGAAAACCAGTGCCTAGGTGCTTTCTTGAGTATGTAGTTTACTAC
TGAACCACCTATGTCCCAAAATATAACCTGGACATTTCCTGTCTAGATTCATAGTCCTATAAAATATTTCTTTCTGTAGTAGTTAGTAACATTTTTGAAC
GGATGTAGTATTTCACTATTTTTGTATCCTCACATGTTCAGCATTCACCTTTGCGGACAAAAAAGGCACATGACATTTTCTTTGAATGTTTGTTACTCTT
AGATTGCAGGGGTGTAATTCATTGACTATTGACTGCCGTACTGACCACATAAAAACCGCTGCTAAGATGGTGCAAAACAGGGTTCTTTGTTAAAAGATTA
GCTATTCTTTTGCATGTACTGTGAACTTTCTATTTCTATTTTTATTTTTATTTTTTTTTGTGTTGTTCTCCTTGTATCTTCTCTGAATAGTTGAGCAAAC
AGGAGGACTTACTCCTCATTTCTGTTTAAGTGGAAAAACATGAGCTGCCACTCTGGTCTTCATAATTTCTACCCAAGTTTGCATGTGATTGTAATGCACA
TCTCTTTGTAAGTATCGAGTACATGATTCCATTTTGGTGGAGATCTGTTCTTTTATTTTTCCTGTCAAGTCAATTTTTGATAGATACAGAGTCATGCCAA
TTTGAGGTGGGTCAAAAGTCTGAAAGCCCTAAATTTATTTCAGCCCGTTGCACTTGCGACTACTCAACCCAGCCCAAGGTAAGTCTGTATTGACATCCTA
AAAACCCAGCCCAAGGCAAATACTACTTACTTACATCTTGTTTGATGGGTCTTAAACAACTATAATTTGGTTACTTGTTTCTTTATCTAAAAGATATAAT
TTGGTTACTTGTTTGACCCAACTACCTCGTACTAGGTATGTGGCCCTGTAGGGCTTTGGTCAGAGCTTCTTTATTTGCCCACTTCTTCCTTAATTAAGGC
CCTGTTTCTTTTAGTTTAAAATTATTATAATCTAAATGATTAAGTCAGATTACTATAAACTAGATTATTATAATCTATAGTAGAATAAGCCGTTAGTTGT
TTCTTTCCTAAATTATTAGAGTCTAGATTATTGGGTTCGCAAGTCTATAGAGGGAGTGGGGTAGCATGGTAGTAATTTTTCACCCAATAATTTGGAAAAA
GCTCACCTAAATGAGCTTATCAGATTATAATAAGCTGGGCTTCAGATTATAATAAGCTATTTCAATAAGTTGTCTGTTTCTTTCAGCTTACTCCCAATAA
TCTGGATTATAATAATCCCAAGCTGAAAGAAACAGGGCCTAAGTCCCGAATTTACCTCTTTTGACACCATATGCTTGATTTTGTTTCAAATTATTCTCAA
CTGAAGCTCTGAGTAGATATTACTTTTCGATTGGAACAAATTGTATGAAAATGTTTAAATTAACATGAATTTCAGAATGTACTGATTGTGAAGATTAAAA
CCAGCATGATTACTAGCTTGTGACTCACATAATACTACAATAAAACTTTCACCTTCTTACTGGGATTTTAACTTATCTCCTTCCAAATAAATCCTTGTTA
ATCAACTTTTTCAAATCCAATTTTATTTTAAAATGAAGTTATAATTTTCAGGAATCAGGACTGGTTGTAAAATCGATATTCAAACAAAACATGATGAATC
ATTCTTCTTTTTATTACTTCAATTTCCCTGACTTCGCGATCGTGTCCTTAAGTTACTACTGGAGAACCGATCTTTACTCGGTCAGGCAAATCATAAATCT
TTCAGACCAATTATAAACCAGTACTAAAGATGATCGGTTAACAAGCCCAACGGCATGTTATGATGTTTATATCCATGTTTGGTTTATCTATGTTTACCAT
TAATCTTAAGTGATCTTAAAGATCATTTTTACTCCCAGTTCTTTTTTTTCCAGACCTTATCAGGCCCATCAGGATCTATATAAACATCATAAACAATGTG
TTTTTCTCTCATGCGAAAGGTACGTTTAATCGTCTTGGCCCCTATCCCATGTGAATTTGTTGGTGATTTTTTTCGTCTTATCAGATTTCATTGAGTAGGA
TATCAAAGATATAAGATGATATCAACCATGCATTAAAAATTGACCACGAGGATTGATAGCTCCACGCTAATCAAAGACTACATGTAAGATCGACTTCCTT
AATTAATATAGGTAGATTAGAATCAAAATGCTGACAAACCACAATGACTTTATTTATAAGGAAGGTTGTTTTAATTATTCATGCAATGCTCCATGTTTGG
TTTATCTATGTTTTAATCTTAATTAGATACTTAGTTTCATTCTTCACAAATCTAAAACTAAAGTTGAACTGTTAGGCAATTTTCATACGTCACTAGGGCA
AGGTGATTATTTTGGATAACACAGAACAAAACTGTACAATACACTACAATGGAAAAAGGGATTATATAAGGTGTGAAGTACGCTAAGATGAATCAAGTCA
TATCAGTCATAAAATCTCTAAGATTAAAATATACTCATTATGAAAACCACGCTGTTAATTGCCAAGAAAGATATGGTCATCTTATGCAGTTGATTATTTG
CTTGCTTTATTTGTTTGCATAATATAGATTGTCTTACGTATATATGGTTGATATTTCTTTAGTTGATAATGTATTATTAAGTTTATTTAGTTGCTTAGTT
TATTATTTCCATAACAAATGTGTACAAACAGACTTGCAATTTTTTGGGAACTATCCATGTATATATATACTCAATCAGAGGTTGGTCATTTTGGATAGAC
ATAGAACATAAGTAGATTAACATTGTGTTTAGACAATTTAATTAGTTTGCCAGGAGACATATGCAATATATATTTATGTTGCAATGGTGTAAATATCTAA
AGCTAGCACACACAAAAATAATATGTGCACCTATATCTATTAAAAGATCAAATAATTTTATTCTTGTTATTATTTCATCAAAATTCAGTGTGCTACATAC
TCCCCCCATGGCCCCACTCCCCAAAATTTACCATAAAAGAGACACATATTTCCCTTGAAATTAATGAAACTTATACGAATGGCAACACTCCTGCGCAAGG
ACTATATTTAAAACAAATGGTGTTCTACTGTGTCTATATGTAATTGGAAGTTAGGAACCTATATATGGCGGACAAAATGGAAATATATAGTGTGTGATTA
TTCGAGCTATGATGCATGCAAGCTAGCTTGCTAAGTATTACTTCTAAACTCCACTGTGGCATTTGCTTTCAGGATGATCTAATTTTTTTTAGAGTGGATA
TATTTCTCACTTAAATCTGAGAATAATCAAACTGTATAAATTGTAATAATC